SMILES’tan InChIKey’e Dönüştürücü
Kısaca: SMILES dizelerini aranabilir InChIKey tanımlayıcılarına dönüştürün. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
SMILES dizelerinden kompakt InChIKey tanımlayıcıları oluşturun.
Girdi ve çıktı biçimleri
| Girdi: SMILES | Çıktı: InChIKey | |
|---|---|---|
| Tam adı | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChIKey |
| Ne içerir | Atomlar, bağlar, halkalar, yükler ve stereokimya tek satırlık metin olarak. Koordinat yok. | InChI’nin web ve veritabanı araması için oluşturulmuş 27 karakterlik özeti (hash). Bir arama veritabanı olmadan yapıya geri dönüştürülemez. |
| Dosya veya biçim | .smi veya düz metin | XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z gibi metin |
Dosya biçimi açıklaması
SMILES, moleküler yapı için kompakt bir metin gösterimidir. Girdi, düzenleme ve dönüştürme işlemleri için kullanışlıdır.
InChIKey, bir InChI’den türetilen sabit uzunlukta, özetlenmiş (hash) bir tanımlayıcıdır. Hızlı veritabanı eşleştirmesi ve web araması için tasarlanmıştır, ancak bir veritabanı sorgusu olmadan tam olarak geri çevrilemez.
Bir bileşik için kararlı bir arama anahtarına ihtiyacınız olduğunda InChIKey, düzenlenebilir bir yapı dizesine ihtiyacınız olduğunda SMILES kullanın.
Neden InChIKey kullanılır
InChIKey’ler arama için tasarlanmıştır. Tam bir InChI veya SMILES’ı arama motoruna yapıştırmak çoğu zaman işe yaramaz, çünkü =, / ve parantez gibi semboller özel olarak işlenir. Yalnızca harf ve tirelerden oluşan 27 karakterlik bir anahtar sorunsuz aranır ve veritabanı kayıtlarıyla güvenilir şekilde eşleşir.
Örnek
Kafein, CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C, RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N InChIKey’ini verir. Bu anahtarı aramak PubChem, ChEMBL ve diğer veritabanlarında kafein sayfalarını döndürür.
Anahtarın yapısı
- İlk 14 karakter: bağlantıların özeti.
- Sonraki 10 karakter: stereokimya ve izotop katmanlarının özeti ile sürüm bayrakları. Stereo veya izotop katmanı olmayan yapılarda
UHFFFAOYSAgörünür. - Son karakter: protonlanma (N = nötr).
SSS
Enantiyomerler farklı anahtarlar alır mı? SMILES’ta stereokimya tanımlıysa evet. İlk bloğu paylaşırlar ve ikincide farklıdırlar. Bir anahtardan yapıyı geri alabilir miyim? Yalnızca InChIKey’den SMILES’a aracıyla veritabanı sorgusu yaparak.
Son güncelleme: