เครื่องมือแปลง SMILES เป็น InChIKey
สรุปสั้น ๆ: แปลงสตริง SMILES เป็นตัวระบุ InChIKey ที่ค้นหาได้ ใช้งานฟรี ทำงานในเว็บเบราว์เซอร์ และไม่ต้องดาวน์โหลด
สร้างตัวระบุ InChIKey แบบกะทัดรัดจากสตริง SMILES
รูปแบบอินพุตและเอาต์พุต
| อินพุต: SMILES | เอาต์พุต: InChIKey | |
|---|---|---|
| ชื่อเต็ม | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChIKey |
| ข้อมูลที่เก็บ | อะตอม พันธะ วง ประจุ และสเตอริโอเคมีในข้อความบรรทัดเดียว ไม่มีพิกัด | ค่าแฮช 27 ตัวอักษรของ InChI สร้างขึ้นสำหรับการค้นหาบนเว็บและในฐานข้อมูล แปลงกลับเป็นโครงสร้างไม่ได้หากไม่มีฐานข้อมูลสำหรับค้นหา |
| ไฟล์หรือรูปแบบ | .smi หรือข้อความธรรมดา | ข้อความรูปแบบ XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
อธิบายรูปแบบไฟล์
SMILES เป็นสัญกรณ์ข้อความที่กะทัดรัดสำหรับโครงสร้างโมเลกุล มีประโยชน์สำหรับการป้อนข้อมูล การแก้ไข และการแปลงไฟล์
InChIKey เป็นตัวระบุแบบแฮชความยาวคงที่ที่ได้จาก InChI ออกแบบมาเพื่อการจับคู่ในฐานข้อมูลและการค้นหาบนเว็บอย่างรวดเร็ว แต่ย้อนกลับได้ไม่สมบูรณ์หากไม่ค้นในฐานข้อมูล
ใช้ InChIKey เมื่อต้องการคีย์ค้นหาที่คงที่สำหรับสาร ใช้ SMILES เมื่อต้องการสตริงโครงสร้างที่แก้ไขได้
ทำไมต้องใช้ InChIKey
InChIKey ออกแบบมาเพื่อการค้นหา การวาง InChI หรือ SMILES ฉบับเต็มลงในเสิร์ชเอนจินมักไม่ได้ผล เพราะสัญลักษณ์อย่าง =, / และวงเล็บถูกตีความเป็นพิเศษ คีย์ 27 อักขระที่มีเพียงตัวอักษรและขีดจึงค้นหาได้ดีและจับคู่กับระเบียนในฐานข้อมูลได้อย่างน่าเชื่อถือ
ตัวอย่าง
คาเฟอีน CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C ให้ InChIKey RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N การค้นหาคีย์นั้นจะพบหน้าของคาเฟอีนใน PubChem, ChEMBL และฐานข้อมูลอื่น
โครงสร้างของคีย์
- 14 อักขระแรก: แฮชของการเชื่อมต่อ
- 10 อักขระถัดไป: แฮชของชั้นสเตอริโอเคมีและไอโซโทป พร้อมแฟล็กเวอร์ชัน
UHFFFAOYSAปรากฏสำหรับโครงสร้างที่ไม่มีชั้นสเตอริโอหรือไอโซโทป - อักขระสุดท้าย: สถานะโปรตอน (N = เป็นกลาง)
คำถามพบบ่อย
อิแนนทิโอเมอร์ได้คีย์ต่างกันหรือไม่? ได้ หากระบุสเตอริโอเคมีไว้ใน SMILES ทั้งสองมีบล็อกแรกเหมือนกันและต่างกันที่บล็อกที่สอง ได้โครงสร้างกลับจากคีย์ได้หรือไม่? ได้โดยค้นในฐานข้อมูลเท่านั้น ด้วย InChIKey เป็น SMILES
อัปเดตล่าสุด: