InChI-naar-SMILES-converter
Kort gezegd: Zet InChI-identificaties om in canonieke SMILES-strings. Gratis, werkt in je webbrowser en zonder download.
Zet InChI-strings uit de literatuur en databases om in SMILES-formaat.
Invoer- en uitvoerformaten
| Invoer: InChI | Uitvoer: SMILES | |
|---|---|---|
| Volledige naam | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Wat het bevat | Een gelaagde tekstidentificatie die uit de structuur wordt opgebouwd. De standaard-InChI is in elk programma hetzelfde. | Atomen, bindingen, ringen, ladingen en stereo als één regel tekst. Geen coördinaten. |
| Bestand of vorm | Tekst die begint met InChI=1S/ | .smi of platte tekst |
Bestandsformaat uitgelegd
InChI is de IUPAC International Chemical Identifier. Hij is gelaagd en deterministisch, en handig om molecuulformule, connectiviteit, waterstofatomen, lading, stereochemie en isotopen te beschrijven.
SMILES is korter en makkelijker te plakken in veel teken-, zoek- en chemo-informaticatools. InChI omzetten naar SMILES is handig als een database InChI geeft, maar je werkwijze SMILES verwacht.
Verschillende diensten kunnen voor dezelfde InChI verschillende canonieke SMILES teruggeven. Beschouw gelijkwaardige SMILES-strings als geldig als ze hetzelfde molecuul beschrijven.
Wanneer zet je InChI om naar SMILES?
InChI is uitstekend om een stof eenduidig te identificeren, maar de meeste tekenprogramma's, chemo-informaticascripts en zoekvakken verwachten SMILES. Door om te zetten maak je van een identificatie uit een databaserecord of de aanvullende gegevens van een artikel iets wat je kunt bewerken en tekenen.
Zo gebruik je het
- Plak een volledige InChI-string, inclusief het voorvoegsel
InChI=1S/. - Converteer en kopieer daarna de SMILES-uitvoer.
- Plak de SMILES in MolDraw om de structuur te bekijken en te bewerken.
Voorbeeld
Ethanol: InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 wordt CCO. De InChI geeft de formule, de connectiviteitslaag (atomen 1–2–3) en de plaats van de waterstofatomen; SMILES beschrijft hetzelfde molecuul in drie tekens.
FAQ
Blijft de stereochemie behouden? Als de InChI stereolagen bevat (/t, /m, /s of /b), worden die vertaald naar de SMILES-symbolen @ of / en \. Waarom verschilt mijn SMILES van die van een andere tool? Eén molecuul kan meerdere geldige SMILES hebben; vergelijk ze door beide om te zetten naar een InChIKey met SMILES naar InChIKey.
Laatst bijgewerkt: