MOL2 → SMILES 변환기

요약: 최선 추정 방식의 공개 변환 서비스로 MOL2 텍스트를 SMILES로 변환하세요. 무료이며 웹 브라우저에서 작동하고 다운로드가 필요 없습니다.

MOL2 내용을 SMILES로 변환하세요. 작은 리간드 MOL2 블록에 가장 적합합니다.

파일 형식 설명

MOL2는 도킹과 모델링에 쓰이는 Tripos 구조 형식입니다. 원자 좌표, 원자 유형, 부분구조 레코드, 결합, 전하 값을 포함할 수 있습니다.

SMILES는 연결 정보에 초점을 둔 한 줄 분자 식별자입니다. MOL2를 SMILES로 바꾸면 모델링 작업에서 나온 리간드를 검색 가능한 문자열로 만들 수 있습니다.

MOL2 파일에는 SMILES가 보존하지 않는 원자 유형과 전하 정보가 있을 수 있습니다. 변환 후 입체화학과 양성자화 상태를 확인하세요.

MOL2 파일 소개

Tripos MOL2 형식은 분자 모델링과 도킹에서 흔히 쓰입니다. MOL 파일과 달리 SYBYL 원자 유형(방향족 탄소 C.ar, 아마이드 질소 N.am 등), 부분 전하, 부분구조 정보를 @<TRIPOS>MOLECULE, @<TRIPOS>ATOM, @<TRIPOS>BOND 같은 태그로 시작하는 섹션에 저장합니다. 도킹 프로그램과 리간드 라이브러리는 분자를 MOL2로 제공하는 경우가 많습니다.

SMILES로 변환하는 이유

SMILES는 훨씬 읽고, 저장하고, 검색하기 쉽습니다. 도킹된 리간드나 라이브러리 항목을 SMILES로 바꾸면 정체를 확인하거나, 스프레드시트에 붙여 넣거나, 그림용으로 다시 그릴 수 있습니다.

사용 방법

1. 텍스트 편집기에서 .mol2 파일을 열고 @<TRIPOS>MOLECULE부터 결합 섹션까지 분자 하나를 복사하세요.
2. 붙여 넣고 변환하세요.
3. SMILES → 구조식으로 그려서 SMILES를 확인하세요.

주의: 도킹용으로 준비한 파일에는 명시적 수소와 특정 양성자화 상태가 들어 있는 경우가 많아, SMILES에 양성자화된 아민 같은 하전기가 나타날 수 있습니다.