Konverter InChI ke SMILES
Singkatnya: Ubah pengenal InChI menjadi string SMILES kanonis. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Ubah string InChI dari literatur dan basis data menjadi format SMILES.
Format masukan dan keluaran
| Masukan: InChI | Keluaran: SMILES | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Isi data | Pengenal teks berlapis yang dibangun dari struktur. InChI standar sama di setiap program. | Atom, ikatan, cincin, muatan, dan stereo dalam satu baris teks. Tanpa koordinat. |
| File atau bentuk | Teks yang diawali InChI=1S/ | .smi atau teks biasa |
Penjelasan Format File
InChI adalah IUPAC International Chemical Identifier. Pengenal ini berlapis, deterministik, dan berguna untuk mendeskripsikan rumus molekul, keterhubungan, hidrogen, muatan, stereokimia, dan isotop.
SMILES lebih pendek dan lebih mudah ditempel ke berbagai alat gambar, pencarian, dan kemoinformatika. Mengubah InChI menjadi SMILES berguna jika basis data memberikan InChI tetapi alur kerja Anda memerlukan SMILES.
Layanan yang berbeda dapat menghasilkan SMILES kanonis yang berbeda untuk InChI yang sama. Anggap string SMILES yang setara valid jika mendeskripsikan molekul yang sama.
Kapan mengubah InChI menjadi SMILES
InChI sangat baik untuk mengidentifikasi senyawa tanpa ambigu, tetapi sebagian besar program gambar, skrip kemoinformatika, dan kotak pencarian memerlukan SMILES. Konversi memungkinkan Anda mengambil pengenal dari catatan basis data atau data pendukung suatu makalah lalu mengubahnya menjadi sesuatu yang dapat diedit dan digambar.
Cara menggunakannya
- Tempel string InChI lengkap, termasuk awalan
InChI=1S/. - Konversi, lalu salin hasil SMILES.
- Tempel SMILES ke MolDraw untuk melihat dan mengedit strukturnya.
Contoh
Etanol: InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 menjadi CCO. InChI mencantumkan rumus, lapisan keterhubungan (atom 1–2–3), dan letak hidrogen; SMILES menyatakan molekul yang sama dalam tiga karakter.
FAQ
Apakah stereokimia dipertahankan? Jika InChI memuat lapisan stereo (/t, /m, /s atau /b), lapisan itu diterjemahkan menjadi simbol SMILES @ atau / dan \. Mengapa SMILES saya berbeda dari alat lain? Satu molekul dapat memiliki beberapa SMILES yang valid; bandingkan dengan mengubah keduanya menjadi InChIKey lewat SMILES ke InChIKey.
Terakhir diperbarui: