Konverter Nama IUPAC ke SMILES
Singkatnya: Ubah nama sistematis menjadi SMILES atau impor senyawa dari PubChem berdasarkan nama/CID. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Ubah nama IUPAC atau nama senyawa PubChem menjadi SMILES. Berguna untuk mengubah nama dari literatur menjadi string struktur. Masukkan nama dalam bahasa Inggris.
Format masukan dan keluaran
| Masukan: nama IUPAC | Keluaran: SMILES | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | Nama IUPAC | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Isi data | Nama kimia sistematis yang disusun menurut aturan tata nama IUPAC. | Atom, ikatan, cincin, muatan, dan stereo dalam satu baris teks. Tanpa koordinat. |
| File atau bentuk | Teks | .smi atau teks biasa |
Penjelasan Format File
Nama IUPAC adalah nama kimia formal yang dirancang untuk mendeskripsikan struktur secara sistematis. Nama ini berguna dalam publikasi dan pengajaran, tetapi nama yang panjang bisa sulit ditempelkan ke alur kerja perangkat lunak.
SMILES adalah string struktur ringkas yang digunakan oleh alat gambar, basis data, skrip kemoinformatika, dan konverter. Mengubah IUPAC ke SMILES membantu mengubah nama dari literatur menjadi struktur yang dapat dibaca mesin.
Resolusi nama paling baik untuk nama yang jelas dan dikenal. Garam, campuran, stereokimia, nama umum, dan variasi ejaan mungkin tidak memberikan hasil atau memberikan rekaman yang berbeda.
Tips konversi nama ke SMILES
Nama IUPAC sistematis mengodekan struktur secara tepat, tetapi panjang dan mudah salah ketik. Mengubah nama menjadi SMILES memberi Anda struktur ringkas yang dapat dibaca mesin dan dapat ditempelkan ke alat gambar atau spreadsheet.
Contoh
- propan-2-ol →
CC(C)O - asam 2-asetiloksibenzoat (aspirin) →
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - asam (2S)-2-aminopropanoat (L-alanina) →
C[C@@H](C(=O)O)N
Mendapatkan hasil yang baik
- Salin nama persis apa adanya, termasuk lokan, koma, tanda hubung, dan kurung: 1,2-dichloroethane tidak sama dengan 1,1-dichloroethane.
- Sertakan deskriptor stereo seperti (R), (S), (E), atau (Z) jika Anda memerlukan isomer tertentu; jika tidak, stereokimia mungkin tidak ditentukan.
- Nama umum seperti caffeine sering juga bisa digunakan, tetapi nama dagang yang sangat baru atau langka mungkin tidak.
- Waspadai karakter tipografis dari PDF, seperti tanda pisah khusus atau tanda aksen (prime), dan ganti dengan tanda hubung dan apostrof biasa.
Ingin sebaliknya? Gunakan SMILES ke Nama IUPAC.
Terakhir diperbarui: