Cara Menggambar Molekul Sangkar dalam 3D: Kubana, Adamantana, dan Sangkar Koordinasi

Diterbitkan: 30 Okt 2026 · Penulis: Scidart Academy · Waktu baca: ~6 menit

Kubana yang digambar dalam perspektif 3D dengan bayangan kedalaman di samping sangkar koordinasi Pd6L4 di kanvas MolDraw — Kubana dan sangkar koordinasi Pd₆L₄, keduanya digambar dalam perspektif 3D di kanvas MolDraw.

Jawaban singkat: Jangan mencoba menggambar sangkar sebagai proyeksi datar dengan tangan. Di MolDraw, tempatkan sangkar dari Library (kartu bertanda 3D muncul di kanvas dalam 3D sungguhan), atau gambar konektivitasnya dalam 2D lalu tekan 3D Clean Up (Shift+Ctrl+D). Kemudian seret di kanvas untuk memutarnya, dan klik Flatten 3D pose bila Anda menginginkan gambar 2D biasa untuk makalah atau slide.

Mengapa molekul sangkar sulit digambar

Kubana, adamantana, dodekahedrana, dan sangkar logam–organik pada dasarnya tiga dimensi. Di atas kertas setiap ikatan harus digambar sebagai proyeksi: beberapa ikatan bersilangan, bagian belakang sangkar tersembunyi di balik bagian depan, dan sedikit kesalahan membuat kubus tampak seperti heksagon datar. Gambar di buku teks mengatasinya dengan memilih sudut pandang yang baik dan membuat ikatan yang jauh lebih pudar.

MolDraw melakukan hal yang sama untuk Anda. MolDraw membangun geometri 3D yang nyata, menampilkannya dalam perspektif di kanvas dengan bayangan kedalaman, dan memungkinkan Anda memutarnya sampai tampilannya menjelaskan struktur. Anda cukup menentukan sudutnya.

Metode 1: Tempatkan sangkar dari Library (tercepat)

Langkah 1. Buka Library

Editor MolDraw dengan tombol Library disorot di bagian bawah bilah alat kiri — ① Tombol **Library** ada di bagian bawah bilah alat kiri (tooltip "Library — R-groups, ligands, structures…"). Pada kanvas kosong Anda juga dapat mengklik **Templates** di kartu awal.

Langkah 2. Pilih sangkar bertanda 3D

Jendela Library, tab Structures, kategori Polyhedra terpilih, menampilkan kartu Cubane, Prismane, Adamantane, Dodecahedrane, dan Tetrahedrane yang masing-masing bertanda 3D — ② Di tab **Structures**, pilih **Polyhedra**. ③ Klik kartu **Cubane**. Kartu dengan tanda kecil 3D ditempatkan dalam 3D.

Sangkar ada di beberapa tempat:

Polyhedra: kubana, prismana, adamantana, dodekahedrana, tetrahedrana.
Bridged Polycyclics, Organic & amine cages (sangkar imina CC1, CC3), Strained hydrocarbons (pentaprismana, diamantana, [1.1.1]propelana), dan 3D Templates.
Tab Supramolecular: sangkar koordinasi seperti sangkar Fujita Pd₆(TPT)₄, Pd₂L₄, Fe₄L₆, dan persegi Pd₄, serta katenana dan rotaksana.

Anda juga dapat mengetik di Search categories or templates…, misalnya "adamantane" atau "Fujita cage".

Langkah 3. Klik kanvas untuk menempatkannya

Kubana ditempatkan di kanvas dalam perspektif 3D; alat 3D View serta tombol 3D Clean Up, Flatten 3D pose, dan Exit 3D disorot; penampil 3D di kanan menampilkan kubus yang sama — Kubus muncul dalam 3D, dengan rusuk belakang dipudarkan. ④ Alat **3D View** sudah terpilih. ⑤ **3D Clean Up** tampil aktif. ⑥ **Flatten 3D pose** dan ⑦ **Exit 3D** muncul selama Anda berada dalam mode 3D. Penampil 3D di kanan menampilkan pose yang sama.

Langkah 4. Putar ke tampilan terbaik

Kubana setelah diseret untuk diputar, dengan penggeser Fade dan tombol Depth taper disorot di bilah alat atas — Seret di kanvas untuk memutar sangkar. ⑧ **Fade** mengatur seberapa kuat atom belakang memudar; ⑨ **Depth taper** membuat ikatan yang jauh lebih tipis, seperti gambar perspektif buatan tangan.

Setiap seretan adalah satu langkah urungkan, jadi Ctrl+Z membawa Anda kembali ke sudut sebelumnya. Tekan Alt+D untuk menyalakan atau mematikan bayangan kedalaman.

Langkah 5. Ratakan menjadi gambar 2D

Kubana setelah Flatten 3D pose: gambar 2D biasa yang tetap mempertahankan tampilan perspektif yang dipilih — Setelah **Flatten 3D pose**, tampilan yang Anda pilih menjadi gambar 2D biasa. Anda dapat menambahkan label, warna, dan panah, lalu mengekspornya sebagai SVG, PNG, atau PDF vektor.

Jika Anda ingin membuang tampilan 3D, klik Exit 3D: pose dibuang dan gambar semula kembali. Jika suatu pusat stereo tidak dapat ditampilkan dengan benar dari sudut saat ini, Flatten akan memberi tahu Anda; putar sedikit lalu coba lagi.

Metode 2: Gambar sangkar sendiri, lalu biarkan 3D Clean Up melipatnya

Untuk sangkar yang tidak ada di pustaka, gambar konektivitasnya saja. Tidak masalah jika sketsa 2D tampak salah atau ikatannya bersilangan.

Sketsa 2D datar kubana dari dua persegi yang disambung sudut ke sudut, dengan tombol 3D Clean Up dan alat cincin persegi disorot — Sketsa datar kubana: ② dua persegi dari bilah cincin, disambung sudut ke sudut dengan alat ikatan. ① Lalu tekan **3D Clean Up**.

Pilih cincin dari bilah cincin di bagian bawah (persegi, pentagon, heksagon…) lalu klik kanvas. Untuk kubana, tempatkan dua persegi.
Pilih alat ikatan tunggal dan seret dari setiap atom pada satu cincin ke atom pasangannya di cincin lain untuk menutup sangkar. Tambahkan jembatan dengan cara yang sama (untuk adamantana, gambar sikloheksana lalu jembatani posisi 1,3,5 dengan gugus CH₂).
Periksa rumusnya di panel Info: kubana adalah C₈H₈, adamantana C₁₀H₁₆.
Tekan 3D Clean Up di bilah alat atas atau Shift+Ctrl+D. MolDraw merapikan sketsa, membangun struktur 3D, dan beralih ke alat 3D View.

Sketsa buatan tangan setelah 3D Clean Up: kubus 3D yang benar di kanvas dengan alat 3D View disorot, dan model 3D dengan hidrogen di kanan — Setelah 3D Clean Up, sketsa telah menjadi kubus sungguhan. ③ Alat 3D View aktif, jadi Anda bisa langsung menyeret untuk memutarnya.

Terus menggambar dalam 3D. Anda dapat menambahkan atom dan substituen selama pose ditampilkan. Tekan 3D Clean Up lagi untuk meminimalkan ulang geometri: orientasi yang Anda pilih tetap dipertahankan, dan atom baru menempati posisi 3D yang tepat.

Adamantana dalam perspektif 3D di kanvas MolDraw setelah 3D Clean Up — Adamantana yang digambar sebagai sikloheksana dengan tiga jembatan CH₂, setelah 3D Clean Up.

Sangkar koordinasi besar

Sangkar koordinasi Fujita Pd6(TPT)4 yang ditempatkan dari tab Supramolecular dalam perspektif 3D, dengan panel triazina berwarna; penampil 3D di kanan menampilkan sangkar lengkap dengan hidrogen — Sangkar Fujita Pd₆(TPT)₄ dari tab Supramolecular, ditempatkan dalam 3D dengan panel berwarna.

Sangkar logam–organik besar dengan lebih dari 100 atom tidak dapat dibangun secara andal dari sketsa 2D, sehingga versi di pustaka disertai model 3D yang sudah diperiksa. Tempatkan dari tab Supramolecular dan putar persis seperti kubana. Untuk menggambar sangkar Anda sendiri, mulailah dari sangkar pustaka lalu edit, atau bangun satu sudut (logam plus ligan) dan gunakan Generate untuk membuat salinan yang diputar mengelilingi suatu pusat.

Tips agar gambar sangkar jelas

Hindari tampilan dari sisi. Putar sangkar sampai tidak ada dua atom yang saling menumpuk dan tidak ada ikatan yang mengarah lurus ke Anda.
Gunakan petunjuk kedalaman. Fade sedang ditambah Depth taper terlihat bagus saat dicetak; matikan keduanya untuk gambar garis yang bersih.
Ratakan paling akhir. Tambahkan label dan warna setelah meratakan, agar tetap berada di tempat Anda meletakkannya.
Periksa penampil 3D. Panel di kanan menampilkan geometri yang sama dengan hidrogen, untuk mengukur jarak atau mengekspor file 3D.

Tanya jawab

Apa cara termudah menggambar molekul sangkar?

Tempatkan dari Library MolDraw. Templat sangkar seperti kubana, adamantana, dodekahedrana, dan sangkar koordinasi bertanda 3D dan muncul di kanvas dalam perspektif 3D sungguhan, siap diputar.

Sebaiknya molekul sangkar digambar dalam 2D atau 3D?

Gambar konektivitasnya dalam 2D (tidak masalah jika ikatan saling bersilangan), lalu tekan 3D Clean Up (Shift+Ctrl+D). MolDraw membangun geometri 3D yang nyata, menampilkannya dalam perspektif, dan memungkinkan Anda memutarnya, jauh lebih jelas daripada proyeksi yang digambar tangan.

Bagaimana cara memutar molekul di kanvas?

Saat pose 3D ditampilkan, gunakan alat 3D View (Alt+D) dan seret di kanvas. Setiap seretan adalah satu langkah urungkan.

Bagaimana mengubah tampilan 3D menjadi gambar biasa untuk makalah?

Klik Flatten 3D pose. Tampilan saat ini menjadi gambar 2D biasa yang dapat Anda beri label, ekspor sebagai SVG atau PDF, atau tempel ke Word dan PowerPoint.

Panduan terkait

Konformasi kursi Crystal View: sel satuan dalam 3D Stereoisomer Penampil protein