كيف ترسم الجزيئات القفصية ثلاثية الأبعاد: الكوبان والأدامانتان والأقفاص التناسقية

نُشر: 30 أكتوبر 2026 · الكاتب: Scidart Academy · مدة القراءة: ~6 دقائق
الكوبان مرسومًا بمنظور ثلاثي الأبعاد مع تظليل العمق بجوار قفص تناسقي Pd6L4 على لوحة MolDraw
الكوبان وقفص تناسقي Pd₆L₄، وكلاهما مرسوم بمنظور ثلاثي الأبعاد على لوحة MolDraw.

إجابة مختصرة: لا تحاول رسم القفص يدويًا كإسقاط مسطّح. في MolDraw، إما أن تضع القفص من Library (البطاقات التي تحمل علامة 3D تظهر على اللوحة بأبعاد ثلاثية حقيقية)، أو ترسم ترابطه ثنائي الأبعاد وتضغط 3D Clean Up ‏(Shift+Ctrl+D). ثم اسحب على اللوحة لتدويره، وانقر Flatten 3D pose عندما تريد شكلًا عاديًا ثنائي الأبعاد لبحث أو شريحة عرض.

لماذا يصعب رسم الجزيئات القفصية

الكوبان والأدامانتان والدوديكاهيدران والأقفاص الفلزية العضوية ثلاثية الأبعاد بطبيعتها. على الورق يجب رسم كل رابطة كإسقاط: بعض الروابط تتقاطع، والجزء الخلفي من القفص يختفي خلف الجزء الأمامي، وخطأ صغير يجعل المكعب يبدو كسداسي مسطّح. تحل أشكال الكتب المدرسية ذلك باختيار زاوية رؤية جيدة وجعل الروابط البعيدة أفتح لونًا.

يفعل MolDraw الشيء نفسه نيابةً عنك. فهو يبني هندسة ثلاثية الأبعاد حقيقية، ويعرضها على اللوحة بالمنظور مع تظليل العمق، ويتيح لك تدويرها حتى يشرح العرض البنية. عليك فقط اختيار الزاوية.

الطريقة 1: ضع قفصًا من Library (الأسرع)

الخطوة 1. افتح Library

محرر MolDraw مع إبراز زر Library في أسفل شريط الأدوات الأيسر
① يقع زر Library في أسفل شريط الأدوات الأيسر (تلميح الأداة «Library — R-groups, ligands, structures…»). على لوحة فارغة يمكنك أيضًا النقر على Templates في بطاقة البداية.

الخطوة 2. اختر قفصًا يحمل علامة 3D

نافذة Library، علامة تبويب Structures، فئة Polyhedra محددة، تعرض بطاقات Cubane وPrismane وAdamantane وDodecahedrane وTetrahedrane وعلى كل منها علامة 3D
② في علامة تبويب Structures اختر Polyhedra. ③ انقر بطاقة Cubane. البطاقات التي تحمل علامة 3D صغيرة توضع بأبعاد ثلاثية.

توجد الأقفاص في عدة أماكن:

  • Polyhedra: الكوبان، والبريزمان، والأدامانتان، والدوديكاهيدران، والتتراهيدران.
  • Bridged Polycyclics وOrganic & amine cages (أقفاص الإيمين CC1 وCC3) وStrained hydrocarbons (البنتابريزمان، والدايامانتان، و[1.1.1]بروبيلان) و3D Templates.
  • علامة تبويب Supramolecular: أقفاص تناسقية مثل قفص فوجيتا Pd₆(TPT)₄ وPd₂L₄ وFe₄L₆ ومربع Pd₄، إضافة إلى الكاتينانات والروتاكسانات.

يمكنك أيضًا الكتابة في Search categories or templates…، مثل «adamantane» أو «Fujita cage».

الخطوة 3. انقر اللوحة لوضعه

الكوبان موضوعًا على اللوحة بمنظور ثلاثي الأبعاد؛ مع إبراز أداة 3D View وأزرار 3D Clean Up وFlatten 3D pose وExit 3D؛ ويعرض العارض ثلاثي الأبعاد على اليمين المكعب نفسه
يظهر المكعب ثلاثي الأبعاد مع حواف خلفية باهتة. ④ أداة 3D View محددة بالفعل. ⑤ يظهر 3D Clean Up مفعّلًا. ⑥ يظهر Flatten 3D pose و⑦ Exit 3D ما دمت في وضع 3D. ويعرض العارض ثلاثي الأبعاد على اليمين الوضعية نفسها.

الخطوة 4. دوّره إلى أفضل عرض

الكوبان بعد السحب لتدويره، مع إبراز منزلق Fade وزر Depth taper في شريط الأدوات العلوي
اسحب على اللوحة لتدوير القفص. ⑧ يحدد Fade مدى بهتان الذرات الخلفية؛ ⑨ ويجعل Depth taper الروابط البعيدة أرفع، كما في شكل منظوري مرسوم باليد.

كل سحبة خطوة تراجع واحدة، لذا يعيدك Ctrl+Z إلى الزاوية السابقة. اضغط Alt+D لتشغيل تظليل العمق أو إيقافه.

الخطوة 5. سطّحه إلى شكل ثنائي الأبعاد

الكوبان بعد Flatten 3D pose: رسم عادي ثنائي الأبعاد يحتفظ بالعرض المنظوري المختار
بعد Flatten 3D pose يصبح العرض الذي اخترته رسمًا عاديًا ثنائي الأبعاد. يمكنك إضافة تسميات وألوان وأسهم، وتصديره بصيغة SVG أو PNG أو PDF متجهي.

إذا كنت تفضّل التخلي عن العرض ثلاثي الأبعاد، فانقر Exit 3D: تُلغى الوضعية ويعود الرسم الأصلي. وإذا تعذّر عرض مركز فراغي بشكل صحيح من الزاوية الحالية، فسيخبرك Flatten بذلك؛ دوّر قليلًا وحاول مرة أخرى.

الطريقة 2: ارسم القفص بنفسك ودع 3D Clean Up يطويه

لقفص غير موجود في المكتبة، ارسم الترابط فقط. لا يهم أن يبدو الرسم ثنائي الأبعاد خاطئًا أو أن تتقاطع الروابط.

رسم مسطّح ثنائي الأبعاد للكوبان من مربعين موصولين ركنًا بركن، مع إبراز زر 3D Clean Up وأداة الحلقة المربعة
رسم مسطّح للكوبان: ② مربعان من شريط الحلقات موصولان ركنًا بركن بأداة الرابطة. ① ثم اضغط 3D Clean Up.
  1. اختر حلقة من شريط الحلقات في الأسفل (مربع، خماسي، سداسي…) وانقر اللوحة. للكوبان ضع مربعين.
  2. اختر أداة الرابطة الأحادية واسحب من كل ذرة في حلقة إلى الذرة المقابلة في الحلقة الأخرى لإغلاق القفص. أضف الجسور بالطريقة نفسها (للأدامانتان ارسم حلقة الهكسان الحلقي واربط المواقع 1,3,5 بمجموعات CH₂).
  3. تحقّق من الصيغة في لوحة Info: الكوبان C₈H₈، والأدامانتان C₁₀H₁₆.
  4. اضغط 3D Clean Up في شريط الأدوات العلوي أو Shift+Ctrl+D. يرتّب MolDraw الرسم، ويبني بنية ثلاثية الأبعاد، وينتقل إلى أداة 3D View.
الرسم اليدوي بعد 3D Clean Up: مكعب ثلاثي الأبعاد صحيح على اللوحة مع إبراز أداة 3D View، والنموذج ثلاثي الأبعاد مع ذرات الهيدروجين على اليمين
بعد 3D Clean Up أصبح الرسم مكعبًا حقيقيًا. ③ أداة 3D View مفعّلة، لذا يمكنك السحب لتدويره فورًا.

تابع الرسم ثلاثي الأبعاد. يمكنك إضافة ذرات ومستبدلات أثناء عرض الوضعية. اضغط 3D Clean Up مرة أخرى لإعادة تقليل طاقة الهندسة: يُحتفظ بالاتجاه الذي اخترته، وتستقر الذرات الجديدة في مواقع ثلاثية الأبعاد صحيحة.

الأدامانتان بمنظور ثلاثي الأبعاد على لوحة MolDraw بعد 3D Clean Up
الأدامانتان مرسومًا كهكسان حلقي بثلاثة جسور CH₂، بعد 3D Clean Up.

الأقفاص التناسقية الكبيرة

قفص فوجيتا التناسقي Pd6(TPT)4 موضوعًا من علامة تبويب Supramolecular بمنظور ثلاثي الأبعاد، مع ألواح تريازين ملوّنة؛ ويعرض العارض ثلاثي الأبعاد على اليمين القفص كاملًا مع ذرات الهيدروجين
قفص فوجيتا Pd₆(TPT)₄ من علامة تبويب Supramolecular، موضوعًا ثلاثي الأبعاد مع ألواح ملوّنة.

لا يمكن بناء الأقفاص الفلزية العضوية الكبيرة التي تضم أكثر من 100 ذرة بشكل موثوق من رسم ثنائي الأبعاد، لذا تأتي نسخ المكتبة مع نموذج ثلاثي الأبعاد مُتحقَّق منه. ضعها من علامة تبويب Supramolecular ودوّرها تمامًا مثل الكوبان. لرسم قفصك الخاص، ابدأ من قفص في المكتبة وعدّله، أو ابنِ ركنًا واحدًا (فلز مع ربيطة) واستخدم Generate لإنشاء نسخ مدوّرة حول مركز.

نصائح لأشكال أقفاص واضحة

  • تجنّب العروض الحافّية. دوّر القفص حتى لا تتراكب أي ذرتين ولا تشير أي رابطة نحوك مباشرة.
  • استخدم مؤشرات العمق. قيمة معتدلة من Fade مع Depth taper تُقرأ جيدًا في الطباعة؛ أوقفهما للحصول على رسم خطي نظيف.
  • سطّح في النهاية. أضف التسميات والألوان بعد التسطيح، لتبقى في المكان الذي وضعتها فيه.
  • تحقّق من العارض ثلاثي الأبعاد. تعرض اللوحة على اليمين الهندسة نفسها مع ذرات الهيدروجين، لقياس المسافات أو تصدير ملف ثلاثي الأبعاد.

أسئلة وأجوبة

ما أسهل طريقة لرسم جزيء قفصي؟

ضعه من مكتبة MolDraw ‏(Library). قوالب الأقفاص مثل الكوبان والأدامانتان والدوديكاهيدران والأقفاص التناسقية تحمل علامة 3D وتظهر على اللوحة بمنظور ثلاثي الأبعاد حقيقي، جاهزة للتدوير.

هل أرسم الجزيئات القفصية ثنائية الأبعاد أم ثلاثية الأبعاد؟

ارسم الترابط بين الذرات ثنائي الأبعاد (لا يهم إن تقاطعت الروابط)، ثم اضغط 3D Clean Up ‏(Shift+Ctrl+D). يبني MolDraw هندسة ثلاثية الأبعاد حقيقية، ويعرضها بالمنظور، ويتيح لك تدويرها، وهذا أوضح بكثير من إسقاط مرسوم باليد.

كيف أدوّر الجزيء على اللوحة؟

أثناء عرض وضعية ثلاثية الأبعاد، استخدم أداة 3D View ‏(Alt+D) واسحب على اللوحة. كل سحبة خطوة تراجع واحدة.

كيف أحوّل العرض ثلاثي الأبعاد إلى رسم عادي لبحث منشور؟

انقر Flatten 3D pose. يصبح العرض الحالي رسمًا عاديًا ثنائي الأبعاد يمكنك وضع تسميات عليه، أو تصديره بصيغة SVG أو PDF، أو لصقه في Word وPowerPoint.

أدلة ذات صلة

هيئات الكرسي Crystal View: خلايا الوحدة ثلاثية الأبعاد المتصاوغات الفراغية عارض البروتينات

آخر تحديث: