محوّل InChI إلى SMILES
باختصار: حوّل معرّفات InChI إلى سلاسل SMILES قانونية. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب دون الحاجة إلى تنزيل.
حوّل سلاسل InChI من المراجع العلمية وقواعد البيانات إلى صيغة SMILES.
صيغ الإدخال والإخراج
| الإدخال: InChI | الإخراج: SMILES | |
|---|---|---|
| الاسم الكامل | InChI (المعرّف الكيميائي الدولي من IUPAC) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| ما الذي تحتويه | معرّف نصي متعدد الطبقات مبني من البنية. ويكون InChI القياسي هو نفسه في كل البرامج. | الذرات والروابط والحلقات والشحنات والكيمياء الفراغية في سطر نصي واحد. دون إحداثيات. |
| الملف أو الشكل | نص يبدأ بـ InChI=1S/ | ملف .smi أو نص عادي |
شرح صيغة الملف
InChI هو المعرّف الكيميائي الدولي من IUPAC. وهو متعدد الطبقات وحتمي، ومفيد لوصف الصيغة الجزيئية والترابط والهيدروجينات والشحنة والكيمياء الفراغية والنظائر.
SMILES أقصر وأسهل لصقًا في كثير من أدوات الرسم والبحث والمعلوماتية الكيميائية. ويفيد تحويل InChI إلى SMILES حين تعطيك قاعدة البيانات InChI بينما يتطلب سير عملك SMILES.
قد تُرجع الخدمات المختلفة سلاسل SMILES قانونية مختلفة للمعرّف InChI نفسه. اعتبر سلاسل SMILES المتكافئة صحيحة إذا كانت تصف الجزيء نفسه.
متى تحوّل InChI إلى SMILES
InChI ممتاز لتعريف المركب دون لبس، لكن معظم برامج الرسم وبرامج المعلوماتية الكيميائية ومربعات البحث تتوقع SMILES. يتيح لك التحويل أخذ معرّف من سجل قاعدة بيانات أو من البيانات التكميلية لبحث منشور وتحويله إلى شيء يمكنك تحريره ورسمه.
طريقة الاستخدام
- الصق سلسلة InChI كاملة، بما فيها البادئة
InChI=1S/. - حوّل، ثم انسخ ناتج SMILES.
- الصق SMILES في MolDraw لعرض البنية وتحريرها.
مثال
الإيثانول: InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 يصبح CCO. يسرد InChI الصيغة وطبقة الترابط (الذرات 1–2–3) ومواضع الهيدروجينات؛ بينما تعبّر SMILES عن الجزيء نفسه بثلاثة أحرف.
الأسئلة الشائعة
هل تُحفظ الكيمياء الفراغية؟ إذا احتوى InChI على طبقات فراغية (/t أو /m أو /s أو /b) فإنها تُترجم إلى رموز SMILES @ أو / و\. لماذا تختلف SMILES لديّ عن ناتج أداة أخرى؟ قد يكون للجزيء الواحد عدة سلاسل SMILES صحيحة؛ قارن بينها بتحويل كلتيهما إلى InChIKey باستخدام SMILES إلى InChIKey.
آخر تحديث: