محوّل SMILES إلى InChIKey
باختصار: حوّل سلاسل SMILES إلى معرّفات InChIKey قابلة للبحث. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب دون الحاجة إلى تنزيل.
أنشئ معرّفات InChIKey مختصرة من سلاسل SMILES.
صيغ الإدخال والإخراج
| الإدخال: SMILES | الإخراج: InChIKey | |
|---|---|---|
| الاسم الكامل | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChIKey |
| ما الذي تحتويه | الذرات والروابط والحلقات والشحنات والكيمياء الفراغية في سطر نصي واحد. دون إحداثيات. | تجزئة (hash) من 27 حرفًا لـ InChI، مصمَّمة للبحث على الويب وفي قواعد البيانات. لا يمكن تحويلها إلى بنية دون قاعدة بيانات للبحث. |
| الملف أو الشكل | ملف .smi أو نص عادي | نص بالشكل XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
شرح صيغة الملف
SMILES ترميز نصي مختصر للبنية الجزيئية، وهو مفيد في الإدخال والتحرير والتحويل.
InChIKey معرّف مُجزّأ ثابت الطول مشتق من InChI. صُمّم للمطابقة السريعة في قواعد البيانات والبحث على الويب، لكن لا يمكن عكسه بدقة دون البحث في قاعدة بيانات.
استخدم InChIKey عندما تحتاج إلى مفتاح بحث ثابت لمركب ما، واستخدم SMILES عندما تحتاج إلى سلسلة بنية قابلة للتحرير.
لماذا تستخدم InChIKey
صُمّمت مفاتيح InChIKey للبحث. فلصق InChI كامل أو SMILES في محرك بحث يفشل غالبًا، لأن رموزًا مثل = و/ والأقواس تُعامَل معاملة خاصة. أما المفتاح المكوّن من 27 حرفًا من الحروف والشرطات فقط فيُبحث عنه بسهولة ويطابق سجلات قواعد البيانات بموثوقية.
مثال
الكافيين، CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C، يعطي المفتاح RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N. والبحث عن هذا المفتاح يُرجع صفحات الكافيين في PubChem وChEMBL وقواعد بيانات أخرى.
بنية المفتاح
- أول 14 حرفًا: تجزئة لترابط الذرات.
- الأحرف العشرة التالية: تجزئة لطبقتي الكيمياء الفراغية والنظائر، إضافةً إلى رايات الإصدار. يظهر
UHFFFAOYSAللبنى التي لا تحتوي على طبقة فراغية أو نظائرية. - الحرف الأخير: حالة البرتنة (N = متعادل).
الأسئلة الشائعة
هل تحصل المتصاوغات الضوئية (enantiomers) على مفاتيح مختلفة؟ نعم، إذا كانت الكيمياء الفراغية محددة في SMILES. فهي تشترك في الكتلة الأولى وتختلف في الثانية. هل يمكنني استرجاع البنية من المفتاح؟ فقط بالبحث في قاعدة بيانات، باستخدام InChIKey إلى SMILES.
آخر تحديث: