محوّل اسم IUPAC إلى SMILES
باختصار: حوّل الأسماء النظامية إلى SMILES أو استورد المركبات من PubChem بالاسم/CID. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب ولا تحتاج إلى تنزيل.
حوّل أسماء IUPAC أو أسماء المركبات في PubChem إلى SMILES (أدخل الأسماء بالإنجليزية). مفيد لتحويل الأسماء الواردة في المراجع إلى سلاسل بنيوية.
صيغ الإدخال والإخراج
| الإدخال: اسم IUPAC | الإخراج: SMILES | |
|---|---|---|
| الاسم الكامل | اسم IUPAC | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| ما تحتويه | الاسم الكيميائي النظامي المبني وفق قواعد تسمية IUPAC. | الذرات والروابط والحلقات والشحنات والكيمياء الفراغية في سطر نصي واحد. بلا إحداثيات. |
| الملف أو الشكل | نص | .smi أو نص عادي |
شرح صيغة الملف
أسماء IUPAC أسماء كيميائية رسمية مصممة لوصف البنية بطريقة نظامية. وهي مفيدة في المنشورات والتدريس، لكن الأسماء الطويلة قد يصعب لصقها في سير عمل البرمجيات.
SMILES سلسلة بنيوية مدمجة تستخدمها أدوات الرسم وقواعد البيانات وبرامج المعلوماتية الكيميائية والمحوّلات. ويساعد تحويل IUPAC إلى SMILES على تحويل اسم من المراجع إلى بنية قابلة للقراءة آليًا.
يعمل تحليل الأسماء أفضل ما يكون مع الأسماء الواضحة المعروفة. وقد لا تعطي الأملاح والمخاليط والكيمياء الفراغية والأسماء الشائعة واختلافات التهجئة أي نتيجة أو تعطي سجلًا مختلفًا.
نصائح لتحويل الاسم إلى SMILES
ترمّز أسماء IUPAC النظامية البنية بدقة، لكنها طويلة وسهلة الخطأ في الكتابة. وتحويل الاسم إلى SMILES يمنحك بنية مدمجة قابلة للقراءة آليًا يمكنك لصقها في أدوات الرسم أو جداول البيانات.
أمثلة
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid (الأسبرين) →
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid (L-ألانين) →
C[C@@H](C(=O)O)N
الحصول على نتائج جيدة
- انسخ الأسماء بدقة، بما فيها أرقام المواقع والفواصل والشرطات والأقواس: فـ 1,2-dichloroethane ليس هو 1,1-dichloroethane.
- أدرج الواصفات الفراغية مثل (R) أو (S) أو (E) أو (Z) إذا احتجت إلى متصاوغ محدد؛ وإلا فقد تبقى الكيمياء الفراغية غير محددة.
- الأسماء الشائعة مثل caffeine تنجح غالبًا أيضًا، لكن الأسماء التجارية الحديثة جدًا أو النادرة قد لا تنجح.
- انتبه إلى الرموز الطباعية المنسوخة من ملفات PDF، مثل الشرطات الخاصة أو علامات الفتحة (′)، واستبدلها بشرطات وعلامات اقتباس عادية.
تريد الاتجاه المعاكس؟ استخدم SMILES إلى اسم IUPAC.
آخر تحديث: