Crystal View: افتح ملف CIF وشاهد خلية الوحدة ثلاثية الأبعاد

نُشر: 30 أكتوبر 2026 · الكاتب: Scidart Academy · مدة القراءة: ~5 دقائق

خليتا وحدة في إضافة Crystal View من MolDraw: الملح الصخري (NaCl) بشبكتي Na وCl المتداخلتين، والبيروفسكايت المكعب SrTiO3 مع ثماني أوجه TiO6 في المركز — خليتا وحدة للملح الصخري والبيروفسكايت المكعب في إضافة Crystal View.

إجابة مختصرة: افتح العارض ثلاثي الأبعاد في MolDraw، واضغط + وثبّت Crystal View. في علامة تبويب Crystal، انقر على Open واختر ملف CIF أو POSCAR أو PDB أو XYZ الموسّع، أو أحد الأمثلة المضمّنة. ستحصل على خلية الوحدة ثلاثية الأبعاد مع ثوابت الخلية والحجم وZ والكثافة، ويمكنك تكرار الخلية، والنظر على امتداد أي اتجاه [uvw]، وعرض متعددات أوجه التناسق، وتصدير صورة PNG.

لماذا ننظر إلى البلورات بصورة ثلاثية الأبعاد؟

صيغة مثل NaCl أو SrTiO₃ لا تخبرك شيئًا عن كيفية تراصّ الذرات. فأعداد التناسق والطبقات المتراصّة بإحكام وشكل متعددات الأوجه لا تتضح إلا عندما تستطيع تدوير الخلية والنظر إليها من جهات مختلفة. تعرض صور الكتب المدرسية زاوية واحدة ثابتة، أما النموذج التفاعلي فيتيح لك إيجاد الزاوية التي تشرح البنية.

يعمل Crystal View في متصفحك بجوار رسمك. تُقرأ الملفات على حاسوبك ولا تُرفع إلى أي مكان.

ما الذي تعرضه الإضافة

Crystal View يعرض خلية وحدة الملح الصخري مع ذرات Na البنفسجية وذرات Cl الخضراء، ومحاور a وb وc الملوّنة، وبطاقة فيها a = 5.640 Å والزمرة الفراغية Fm-3m وZ = 4 والكثافة 2.163 g/cm³ — الملح الصخري (NaCl). تسرد البطاقة a وb وc وα وβ وγ، والزمرة الفراغية، وحجم الخلية، وZ، والكثافة المحسوبة.

خلية الوحدة	حواف الخلية مع محاور a وb وc الملوّنة، والذرات في كل موقع شبكي، بما فيها الذرات المشتركة مع الخلية المجاورة.
ثوابت الخلية	الأطوال a وb وc، والزوايا α وβ وγ، والزمرة الفراغية، والحجم، وZ، والكثافة.
التكرار	ابنِ كتلة من a × b × c خلية لترى كيف تمتد البنية.
النظر على امتداد	وجّه العرض للنظر على امتداد محور أو أي اتجاه مخصص [u v w].
العرض	ذرات الكرة والعصا أو ملء الفراغ، ومتعددات أوجه التناسق، والتماسات الأيونية، وتسميات الذرات.
الإسقاط	بدّل بين الإسقاط المنظوري والإسقاط المتوازي (العمودي).
المخرجات	صدّر صورة PNG، أو أضف العرض الحالي إلى اللوحة كرسم قابل للتحرير.

كيفية تثبيت Crystal View

افتح محرر MolDraw وسجّل الدخول. الحساب المجاني يكفي.
افتح العارض ثلاثي الأبعاد واضغط + بجوار علامات التبويب (أو انتقل إلى Settings › Plugins).
انقر على Install بجوار Crystal View. تظهر علامة تبويب Crystal.

كيفية فتح ملف CIF

قائمة Open في Crystal View مع خيار فتح ملف لصيغ CIF وPOSCAR وPDB وXYZ الموسّع، وأمثلة: كلوريد الصوديوم، وكلوريد السيزيوم، وفلوريد الكالسيوم، والماس، والغرافيت، وتيتانات السترونتيوم، والروتيل، وأكسيد الزنك، والنحاس — قائمة Open: ملفك الخاص، أو إحدى تسع بنى كلاسيكية.

في علامة تبويب Crystal، انقر على Open (أيقونة المجلد في أعلى شريط الأدوات على اليسار).
اختر Open a file… وحدّد ملف .cif أو POSCAR أو PDB (مع سجل CRYST1) أو XYZ الموسّع.
اسحب للتدوير، ومرّر للتكبير. استخدم Repeat لعرض مزيد من الخلايا وLook along للنظر على امتداد محور.

لا يوجد ملف لديك؟ تغطي الأمثلة البنى التي تدرّسها معظم المقررات: الملح الصخري، وكلوريد السيزيوم، والفلوريت، والماس، والغرافيت، والبيروفسكايت المكعب، والروتيل، والورتزيت (أكسيد الزنك)، والنحاس المكعب متمركز الأوجه.

رؤية التناسق: البيروفسكايت مثالًا

البيروفسكايت المكعب SrTiO3 في Crystal View: ذرة تيتانيوم في مركز الخلية مرتبطة بست ذرات أكسجين، وذرات السترونتيوم على أركان الخلية؛ تعرض البطاقة a = 3.905 Å والزمرة الفراغية Pm-3m والكثافة 5.117 g/cm³ — تيتانات السترونتيوم (SrTiO₃): يقع التيتانيوم داخل ثماني أوجه من ست ذرات أكسجين، والسترونتيوم في التجويف الكبير بين ثمانيات الأوجه.

افتح Display وفعّل Coordination polyhedra لملء ثمانيات الأوجه TiO₆. ومع بضع خلايا مكرّرة سترى أن ثمانيات الأوجه تتشارك الأركان، وهي السمة الأساسية لعائلة البيروفسكايت. جرّب الشيء نفسه مع الروتيل، حيث تتشارك ثمانيات الأوجه TiO₆ الحواف في سلاسل على امتداد c، وقارن بينهما.

البلورات على اللوحة ثنائية الأبعاد

لوحة البلورة على لوحة رسم MolDraw مع قراءة الخلية، وأدوات التكرار a × b × c، وأزرار Look along، وأسهم تدوير العرض، وخيارات التسميات والتماسات الأيونية، وزر Open in Crystal View — البلورة المفتوحة على اللوحة تحصل على لوحة خاصة بها؛ ويعرضها Open in Crystal View بصورة ثلاثية الأبعاد.

يمكنك أيضًا فتح ملف CIF مباشرةً على لوحة الرسم. يرسم MolDraw البلورة كرسم عادي قابل للتحرير، ويعرض لوحة فيها الخلية والتكرارات واتجاه العرض والتسميات والتماسات الأيونية. ويمكنك تبديل العنصر في المواقع المتكافئة، مثلًا لتحويل NaCl إلى KCl لورقة عمل. ثم يتابع Crystal View رسم اللوحة مباشرةً، فيظهر كل تغيير بصورة ثلاثية الأبعاد على الفور.

طرق استخدامها في الصف والمختبر

تدريس كيمياء الحالة الصلبة: قارن تناسق NaCl ‏(6:6) مع CsCl ‏(8:8)، أو عُدّ الذرات في الخلية وتحقّق من قيمة Z على البطاقة.
التراص المحكم: انظر على امتداد [1 1 1] في النحاس لترى الطبقات المتراصّة بإحكام.
متآصلات الكربون: ضع الماس والغرافيت جنبًا إلى جنب لمناقشة الترابط sp³ وsp².
فحص ملف: افتح ملف CIF من بحث منشور أو قاعدة بيانات وتحقّق من الخلية والكثافة والارتباطات قبل استخدامه في مكان آخر.
الأشكال: صدّر صورة PNG، أو أضف العرض إلى اللوحة وسمّه مع بقية مخططك.

هل تتعلّم عن مجالات الليغندات أيضًا؟ يشرح دليل نظرية المجال البلوري الانفصال في المجال ثماني الأوجه ورباعي الأوجه، ويمكنك رؤيته كمتعددات أوجه في Crystal View.

أسئلة وأجوبة

كيف أفتح ملف CIF عبر الإنترنت؟

ثبّت إضافة Crystal View المجانية في MolDraw، وافتح علامة تبويبها في العارض ثلاثي الأبعاد، وانقر على Open واختر ملف ‎.cif. تظهر خلية الوحدة ثلاثية الأبعاد في متصفحك، ولا يُرفع أي شيء إلى خادم.

ما صيغ ملفات البلورات التي يقرؤها Crystal View؟

CIF، وVASP POSCAR، وملفات PDB التي تحتوي على سجل CRYST1، وملفات XYZ الموسّعة التي تتضمن الشبكة.

هل إضافة Crystal View مجانية؟

نعم. تحتاج فقط إلى حساب MolDraw مجاني لتثبيت الإضافات.

هل يمكنني رسم بنية بلورية على اللوحة ثنائية الأبعاد؟

نعم. افتح ملف CIF على اللوحة لتحصل على رسم بلوري قابل للتحرير مع لوحة خاصة به للتكرارات واتجاه العرض والتسميات. ثم يتابع Crystal View هذا الرسم مباشرةً بصورة ثلاثية الأبعاد.

مزيد من إضافات MolDraw

عارض البروتينات البحث في ChEMBL مقارنة الجزيئات نظرية المجال البلوري جميع الإضافات