MolDraw 中的紐曼投影式:旋轉化學鍵、判斷構形名稱並查看張力
簡答:在免費的 MolDraw 編輯器中畫出分子,按右鍵點選一個單鍵並選擇 Newman Projection(在手機或平板上長按該鍵並點一下 Newman)。拖曳 Rotate the back carbon,或點一下 Anti 180°、Gauche 60°、Eclipsed 120° 或 Syn 0°。MolDraw 會給出構形名稱,顯示二面角與估算的張力能,並允許你 Add to canvas 或 Download PNG。
紐曼投影式顯示什麼
紐曼投影式是沿著一個碳–碳鍵直視的視圖。前方碳原子是一個圓點,後方碳原子是一個圓圈,每個碳上的三個鍵向外伸出。繞著該鍵轉動後方碳原子會改變構形,但不會斷開任何鍵。前方鍵與後方鍵之間的夾角就是二面角(也稱扭轉角)。
| 交錯式 | 後方的鍵位於前方的鍵正中間,相隔 60°。扭轉張力最低。 |
|---|---|
| 重疊式 | 後方的鍵與前方的鍵前後對齊,夾角 0°。扭轉張力最高。 |
| 反式(anti) | 交錯式,兩個最大基團相隔 180°。通常是最穩定的構形。 |
| 間扭式(gauche) | 交錯式,兩個最大基團相隔 60°。有少量空間張力。 |
| 全重疊式(syn) | 重疊式,兩個最大基團前後重疊,夾角 0°。通常是最不穩定的構形。 |
關於椅式構形、直立鍵與平伏鍵基團以及 A 值的原理,請參閱椅式構形與紐曼投影式指南。本文介紹如何用編輯器中的紐曼工具親手探索構形。
如何開啟紐曼投影式
- 在編輯器中畫出分子。經典例子是把丁烷畫成四個碳的鋸齒鏈。不需要畫出氫原子。
- 按右鍵點選要沿其觀察的鍵(這裡是中間的 C–C 鍵),選擇 Newman Projection。在觸控螢幕上,長按該鍵並在快顯選單中點一下 Newman。
- 投影式隨即開啟。它是由結構的 3D 模型產生的,所以你看到的角度是真實的角度。如果 3D 模型還在產生中,對話框會提示,稍後投影式就會出現。
紐曼投影式對話方塊導覽
| 標題列 | 「Looking down C2→C3」:前方原子(圓點)與後方原子(圓圈),編號與你的繪圖一致。 |
|---|---|
| 投影式 | 前方的鍵用深色從中心畫出,後方的鍵用灰色從圓圈畫出。基團寫成 CH₃、CH₂CH₃、OH 或 CH(CH₃)₂。 |
| 構形標籤 | Anti、Gauche、Eclipsed、Syn 或 Staggered,附最大基團之間的二面角與一行說明。 |
| 旋轉後方碳原子 | 從 −180° 到 +180° 的滑桿,加上每種命名構形的一鍵按鈕,以及返回初始幾何形狀的 3D pose。 |
| 張力能(估算值) | 目前數值以及整個 360° 旋轉的曲線。點選曲線可跳到該角度。 |
| 按鈕 | Swap front and back、Show rest of molecule、Add to canvas 與 Download PNG。按 Esc 或點選對話方塊外部即可關閉。 |
旋轉化學鍵:反式、間扭、重疊與全重疊
拖曳滑桿,觀察後方碳原子轉動。經過每種構形時標籤名稱都會變化,張力曲線上的圓點也會跟著移動。四個按鈕可以直接跳到兩個最大基團的教科書構形。
在重疊構形中,後方的鍵恰好位於前方的鍵後面。MolDraw 像教科書一樣把它畫得偏開幾度,這樣你仍能看到並標註兩個基團。標籤中的二面角是真實值。
張力能曲線
該曲線顯示化學鍵旋轉一整圈時能量的變化。它是根據每對重疊或間扭基團的標準教科書增量估算的:
| 重疊 H / H | 1.0 kcal/mol |
|---|---|
| 重疊 H / CH₃ | 1.4 kcal/mol |
| 重疊 CH₃ / CH₃ | 2.6 kcal/mol(基團大於甲基時為 3.0) |
| 間扭 CH₃ / CH₃ | 0.9 kcal/mol |
對丁烷而言,這些增量給出:反式 0.0、間扭 0.9、重疊(CH₃ 對 H)3.8、全重疊 4.6 kcal/mol(0、3.8、16 與 19 kJ/mol),與有機化學教科書中的數值一致(間扭約 0.9、重疊約 3.6、全重疊約 4.5–5 kcal/mol)。對乙烷而言,三對重疊的 H/H 給出熟悉的 3.0 kcal/mol 能壘。
這些數值是教學用的估算,不是力場計算。要按能量對整個分子的真實構形異構物排序,請使用 3D 面板中的 Conformers…,它會用 MMFF94 最佳化每一個構形。
易讀的基團標籤
每個基團都按教科書的寫法書寫,所用的氫來自 3D 模型:
- 一個重原子:CH₃、OH、NH₂、Cl。
- 短鏈:CH₂CH₃、CH₂OH、CH₂CH₂CH₃。
- 由相同基團構成的支鏈:CH(CH₃)₂。
- 更大的基團以 R 結尾,例如 CH₂R。
- 繪圖中帶有別名或縮寫的原子(Ph、OTs、Boc)保留該標籤。
環上的鍵與分子的其餘部分
點選 Show rest of molecule,還會畫出構成該鍵的兩個碳原子以外的原子。後半部分會隨滑桿轉動。這對環最有用。在椅式環己烷中,每個環鍵都是間扭,投影式會顯示環在圓圈後方閉合。
Swap front and back 從另一端沿同一個鍵觀察。構形不變,但前後基團互換位置,這是常見的考題。
把投影式放進練習題
- Add to canvas 把投影式作為圖片放到結構旁邊。可以像其他物件一樣移動與縮放,它會隨繪圖一起儲存與匯出。
- Download PNG 儲存一張高解析度圖片(螢幕尺寸的三倍),用於文件、投影片與線上學習平台測驗。
範例解析
1. 乙烷:交錯式與重疊式
畫出兩個碳原子並開啟紐曼投影式。只有氫時,標籤顯示 Staggered 或 Eclipsed。曲線有三個相等的峰,均為 3.0 kcal/mol,每轉 120° 出現一個。
2. 沿 C2–C3 觀察丁烷
從 3D 姿態(反式)開始,然後依次點一下 Gauche、Eclipsed 與 Syn。能量依次為 0.0 → 0.9 → 3.8 → 4.6 kcal/mol。反式是全域最低點,兩個間扭構形是局部極小值。
3. 沿 C1–C2 觀察丁烷
改為按右鍵點選末端的鍵。前方碳上有三個氫,所以只有交錯式與重疊式。這說明了為什麼只有丁烷的中間鍵才有反式與間扭構形。
4. 環己烷
按右鍵點選任何環鍵,點選 Show rest of molecule。標籤顯示 Gauche,二面角接近 55–60°,這就是椅式構形沒有重疊張力的原因。
摘要
| 開啟 | 按右鍵點選單鍵 → Newman Projection(觸控螢幕上長按 → Newman) |
|---|---|
| 旋轉 | 滑桿、Anti / Gauche / Eclipsed / Syn 按鈕,或點選張力曲線 |
| 讀取 | 構形名稱、二面角、以 kcal/mol 表示的估算張力 |
| 檢視 | Swap front and back、Show rest of molecule |
| 分享 | Add to canvas、Download PNG |
常見錯誤
- 選擇了連接端基碳的鍵。CH₃ 端的一側只有氫,所以不存在反式或間扭。請選擇內部的鍵。
- 混淆前後。圓點是前方碳原子;從圓圈出發的鍵屬於後方碳原子。可以用 Swap front and back 檢查。
- 把所有交錯式都叫作反式。反式指最大基團相隔 180°。在 60° 時是間扭,儘管它仍然是交錯式。
- 把錯開的畫法當成實際角度。為了清晰,重疊的後方鍵畫得略微偏開;標籤中的二面角才是真實角度。
- 把張力當作精確能量。它是根據增量得到的估算值,非常適合比較構形,但不是計算得到的能量。
考試技巧
- 先畫出最穩定的構形:交錯式,兩個最大基團處於對位。
- 數相互作用:每個間扭的 CH₃/CH₃ 增加約 0.9 kcal/mol,每對重疊基團增加相應的增量。
- 旋轉 120° 時,交錯式仍為交錯式,重疊式仍為重疊式;旋轉 60° 則在兩者之間切換。
- 練習方法:先預測名稱與能量,再點一下鈕核對。
問題與解答
如何線上畫紐曼投影式?
在免費的 MolDraw 編輯器中畫出分子,按右鍵點選要沿其觀察的單鍵,選擇 Newman Projection。MolDraw 會根據結構的 3D 模型產生投影式,前方碳原子畫成圓點,後方碳原子畫成圓圈。
丁烷的哪種構形最穩定?
反式構形,兩個甲基相隔 180°。間扭(60°)約高 0.9 kcal/mol,甲基與氫重疊的重疊構形約高 3.6–3.8 kcal/mol,甲基與甲基重疊的全重疊構形能量最高,約為 4.5–5 kcal/mol。
交錯式與重疊式有什麼不同?
在交錯式構形中,後方碳原子上的鍵位於前方碳原子上的鍵之間,相隔 60°。在重疊式構形中,它們前後對齊,夾角為 0°。重疊的鍵之間相互排斥,稱為扭轉張力,因此交錯式能量較低。
紐曼投影式中的二面角是什麼?
二面角(扭轉角)是沿 C–C 鍵觀察時,前方碳上的一個鍵與後方碳上的一個鍵之間的夾角。MolDraw 測量的是每個碳上最大基團之間的夾角,並顯示在構形名稱旁邊。
MolDraw 中的張力能是如何計算的?
它是根據教科書中的增量估算的:每對重疊的 H/H 增加 1.0 kcal/mol,每對 H/CH₃ 增加 1.4,每對 CH₃/CH₃ 增加 2.6,每對間扭的 CH₃/CH₃ 增加 0.9。它用於教學與比較構形,而不是力場或量子計算。
可以為環上的鍵畫紐曼投影式嗎?
可以。按右鍵點選環上的鍵並選擇 Newman Projection。點選 Show rest of molecule,可以看到環在投影式後方延續。在椅式環己烷中,每個環鍵都是間扭,二面角約為 55–60°。
如何把紐曼投影式放進我的練習題?
點選 Add to canvas,把投影式作為圖片放到結構旁邊,你可以移動與縮放它,並匯出整個繪圖。或者點選 Download PNG,儲存一張高解析度圖片,用於文件與投影片。