단백질 뷰어

요약: ID나 파일로 PDB를 불러오고, 아미노산 서열을 살펴보고, 사슬별 스타일과 선택한 서열 구간의 스타일을 지정하세요. 무료이며 웹 브라우저에서 바로 작동하고 다운로드가 필요 없습니다.

PDB ID로 단백질을 불러오거나 `.pdb`를 업로드하고, 아미노산 서열을 살펴보고, 사슬별로 스타일을 지정하고, 선택한 서열 구간을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭해 스타일을 바꾸거나 숨기세요.

단백질 구조 살펴보기

단백질 데이터 은행(PDB)에는 실험으로 결정된 단백질, 핵산 및 그 복합체의 3D 구조가 담겨 있습니다. 각 항목에는 네 글자 ID가 있습니다. 예를 들어 1CRN은 예제로 자주 쓰이는 작은 식물 단백질 크람빈이고, 4HHB는 사람 탈산소 헤모글로빈입니다.

표시 스타일 고르기

• 카툰: 나선은 리본이나 나선형으로, β-가닥은 화살표로 나타내 2차 구조를 보여 줍니다. 전체 접힘 구조를 보기에 가장 좋습니다.
• 막대: 개별 결합을 보여 줍니다. 곁사슬, 리간드, 활성 부위를 보기에 가장 좋습니다.
• 구: 원자를 공간 채움으로 나타내 모양과 밀집 상태를 보여 줍니다.
• 선: 가벼운 와이어프레임으로, 큰 구조에 유용합니다.

사슬과 서열 다루기

많은 구조에는 여러 사슬이 있습니다. 예를 들어 헤모글로빈에는 α 사슬 두 개와 β 사슬 두 개가 있습니다. 사슬마다 다른 스타일을 지정하면 서로 어떻게 맞물리는지 볼 수 있습니다. 아미노산 서열의 일부를 선택해 스타일을 바꾸면 그림에서 결합 루프나 돌연변이 부위를 빠르게 강조할 수 있습니다.

팁: 슬라이드용으로는 PNG를, 다른 프로그램에서 좌표나 메시가 필요하면 PDB/XYZ/OBJ를 내보내세요. 결합된 리간드를 SMILES로 바꾸려면 PDB → SMILES를 참고하세요.