Kalkulator TPSA

W skrócie: kalkulator TPSA dla SMILES lub nazw związków. Jest darmowy, działa w przeglądarce i nie wymaga instalacji.

Wpisz ciąg SMILES lub nazwę związku (po angielsku), aby pobrać topologiczną polarną powierzchnię cząsteczki (TPSA), popularną w chemii medycznej właściwość do oceny przenikalności i biodostępności po podaniu doustnym.

Co mówi TPSA

TPSA szacuje polarną powierzchnię pochodzącą od heteroatomów i przyłączonych do nich wodorów. W wytycznych biodostępności doustnej w stylu Vebera TPSA na poziomie ok. 140 A^2 lub mniej jest często uznawana za korzystną, choć liczy się kontekst.

Interpretacja TPSA

Topologiczna polarna powierzchnia cząsteczki (TPSA) sumuje udziały powierzchni atomów polarnych, głównie tlenu i azotu oraz przyłączonych do nich wodorów. Ertl i współpracownicy wprowadzili tę metodę fragmentową w 2000 roku, aby wartość można było obliczyć z samej struktury 2D, bez generowania modelu 3D. Dzięki temu jest wystarczająco szybka do przesiewania dużych bibliotek.

Często stosowane progi

• 140 Ų lub mniej: część kryteriów Vebera związanych z dobrą biodostępnością doustną u szczurów.
• Ok. 90 Ų lub mniej: często podawane dla związków, które mają przenikać przez barierę krew–mózg.

Przykłady

• Aspiryna: ok. 63,6 Ų (ester i kwas karboksylowy).
• Ibuprofen: ok. 37,3 Ų (jeden kwas karboksylowy).
• Glukoza: ok. 110 Ų (pięć grup hydroksylowych i tlen pierścienia).

Pamiętaj: w standardowej postaci TPSA pomija siarkę i fosfor i jest wskazówką, a nie pomiarem przenikalności. Używaj jej razem z logP i masą cząsteczkową, np. w kalkulatorze podobieństwa do leku.