Tính TPSA
Tóm tắt: Công cụ tính TPSA cho SMILES hoặc tên hợp chất. Miễn phí, chạy trên trình duyệt web và không cần tải về.
Nhập chuỗi SMILES hoặc tên hợp chất (tiếng Anh) để lấy diện tích bề mặt phân cực tô pô (TPSA), một tính chất phổ biến trong hóa dược để sàng lọc khả năng thấm và sinh khả dụng đường uống.
TPSA cho biết điều gì
TPSA ước tính diện tích bề mặt phân cực do các dị tố và hydrogen gắn với chúng đóng góp. Trong các hướng dẫn về sinh khả dụng đường uống kiểu Veber, TPSA khoảng 140 A^2 trở xuống thường được coi là thuận lợi, dù còn tùy bối cảnh.
Diễn giải TPSA
Diện tích bề mặt phân cực tô pô (TPSA) cộng các đóng góp bề mặt từ nguyên tử phân cực, chủ yếu là oxygen, nitrogen và hydrogen gắn với chúng. Ertl và cộng sự giới thiệu phương pháp dựa trên mảnh này năm 2000 để có thể tính giá trị chỉ từ cấu trúc 2D, không cần tạo mô hình 3D. Nhờ đó, nó đủ nhanh để sàng lọc các thư viện lớn.
Các ngưỡng thường dùng
- 140 Å2 trở xuống: một phần trong tiêu chí Veber liên quan đến sinh khả dụng đường uống tốt ở chuột.
- Khoảng 90 Å2 trở xuống: thường được nêu cho các hợp chất cần vượt qua hàng rào máu – não.
Ví dụ
- Aspirin: khoảng 63,6 Å2 (một ester và một carboxylic acid).
- Ibuprofen: khoảng 37,3 Å2 (một carboxylic acid).
- Glucose: khoảng 110 Å2 (năm nhóm hydroxyl và một oxygen trong vòng).
Lưu ý: ở dạng chuẩn, TPSA bỏ qua lưu huỳnh và phosphorus, và nó chỉ là chỉ dẫn, không phải phép đo khả năng thấm. Hãy dùng cùng logP và khối lượng phân tử, ví dụ trong công cụ tính tính giống thuốc.
Cập nhật lần cuối: