Kalkulator TPSA
Singkatnya: Kalkulator TPSA untuk SMILES atau nama senyawa. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Masukkan string SMILES atau nama senyawa (dalam bahasa Inggris) untuk mendapatkan luas permukaan polar topologis (TPSA), sifat kimia medisinal yang umum untuk penapisan permeabilitas dan bioavailabilitas oral.
Apa yang Ditunjukkan TPSA
TPSA memperkirakan luas permukaan polar yang disumbangkan heteroatom dan hidrogen yang terikat padanya. Dalam pedoman bioavailabilitas oral gaya Veber, TPSA sekitar 140 A^2 atau kurang sering dianggap menguntungkan, meskipun konteks tetap penting.
Menafsirkan TPSA
Luas permukaan polar topologis (TPSA) menjumlahkan kontribusi permukaan dari atom polar, terutama oksigen dan nitrogen serta hidrogen yang terikat padanya. Ertl dan rekan memperkenalkan metode berbasis fragmen ini pada tahun 2000 sehingga nilainya dapat dihitung hanya dari struktur 2D, tanpa membuat model 3D. Karena itu, metode ini cukup cepat untuk menapis pustaka besar.
Ambang batas yang umum dipakai
- 140 Å2 atau kurang: bagian dari kriteria Veber yang dikaitkan dengan bioavailabilitas oral yang baik pada tikus.
- Sekitar 90 Å2 atau kurang: sering disebut untuk senyawa yang ditujukan menembus sawar darah–otak.
Contoh
- Aspirin: sekitar 63,6 Å2 (satu ester dan satu asam karboksilat).
- Ibuprofen: sekitar 37,3 Å2 (satu asam karboksilat).
- Glukosa: sekitar 110 Å2 (lima gugus hidroksil dan satu oksigen cincin).
Ingat: TPSA dalam bentuk standarnya mengabaikan belerang dan fosforus, dan nilainya hanya panduan, bukan pengukuran permeabilitas. Gunakan bersama logP dan berat molekul, misalnya di Kalkulator Kemiripan Obat.
Terakhir diperbarui: