TPSA Hesaplayıcı
Kısaca: SMILES veya bileşik adları için TPSA hesaplayıcı. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
Geçirgenlik ve oral biyoyararlanım taramasında yaygın kullanılan bir farmasötik kimya özelliği olan topolojik polar yüzey alanını (TPSA) almak için bir SMILES dizesi veya bileşik adı girin (adlar İngilizce olmalıdır).
TPSA Size Ne Söyler
TPSA, heteroatomların ve onlara bağlı hidrojenlerin katkıda bulunduğu polar yüzeyi tahmin eder. Veber tarzı oral biyoyararlanım kurallarında yaklaşık 140 A^2 veya altındaki TPSA genellikle olumlu kabul edilir, ancak bağlam önemlidir.
TPSA’yı yorumlama
Topolojik polar yüzey alanı (TPSA), başta oksijen ve azot olmak üzere polar atomların ve onlara bağlı hidrojenlerin yüzey katkılarını toplar. Ertl ve arkadaşları bu parça tabanlı yöntemi 2000 yılında, değer 3B model oluşturmadan yalnızca 2B yapıdan hesaplanabilsin diye geliştirdi. Bu sayede büyük kütüphaneleri taramaya yetecek kadar hızlıdır.
Yaygın kullanılan eşik değerler
- 140 Å2 veya daha az: sıçanlarda iyi oral biyoyararlanımla ilişkilendirilen Veber ölçütlerinin bir parçası.
- Yaklaşık 90 Å2 veya daha az: kan–beyin bariyerini geçmesi amaçlanan bileşikler için sıkça belirtilir.
Örnekler
- Aspirin: yaklaşık 63,6 Å2 (bir ester ve bir karboksilik asit).
- İbuprofen: yaklaşık 37,3 Å2 (bir karboksilik asit).
- Glukoz: yaklaşık 110 Å2 (beş hidroksil grubu ve bir halka oksijeni).
Unutmayın: TPSA standart hâlinde kükürt ve fosforu hesaba katmaz; geçirgenliğin bir ölçümü değil, bir yol göstericidir. Onu logP ve molekül ağırlığıyla birlikte kullanın, örneğin İlaç Benzerliği Hesaplayıcı ile.
Son güncelleme: