เครื่องคำนวณ TPSA

สรุปสั้น ๆ: เครื่องคำนวณ TPSA สำหรับ SMILES หรือชื่อสารประกอบ ใช้งานฟรี ทำงานในเว็บเบราว์เซอร์ และไม่ต้องดาวน์โหลด

ป้อนสตริง SMILES หรือชื่อสารประกอบ (ภาษาอังกฤษ) เพื่อดึงพื้นที่ผิวมีขั้วเชิงทอพอโลยี (TPSA) ซึ่งเป็นสมบัติที่ใช้บ่อยในเคมีทางยาสำหรับคัดกรองการซึมผ่านและชีวปริมาณออกฤทธิ์เมื่อรับประทาน

TPSA บอกอะไร

TPSA ประมาณพื้นที่ผิวมีขั้วที่มาจากเฮเทอโรอะตอมและไฮโดรเจนที่ต่ออยู่ ตามแนวทางชีวปริมาณออกฤทธิ์ทางปากแบบ Veber ค่า TPSA ไม่เกินประมาณ 140 A^2 มักถือว่าเหมาะสม แม้ว่าบริบทจะมีผลด้วย

การแปลผล TPSA

พื้นที่ผิวมีขั้วเชิงทอพอโลยี (TPSA) รวมส่วนของพื้นที่ผิวจากอะตอมที่มีขั้ว ส่วนใหญ่เป็นออกซิเจนและไนโตรเจน และไฮโดรเจนที่ต่ออยู่กับอะตอมเหล่านั้น Ertl และคณะเสนอวิธีแบบอิงชิ้นส่วนนี้ในปี 2000 เพื่อให้คำนวณค่าได้จากโครงสร้าง 2 มิติเพียงอย่างเดียว โดยไม่ต้องสร้างแบบจำลอง 3 มิติ จึงเร็วพอสำหรับคัดกรองคลังสารขนาดใหญ่

เกณฑ์ที่ใช้บ่อย

• ไม่เกิน 140 Ų: เป็นส่วนหนึ่งของเกณฑ์ของ Veber ที่สัมพันธ์กับชีวปริมาณออกฤทธิ์ทางปากที่ดีในหนู
• ไม่เกินประมาณ 90 Ų: มักอ้างถึงสำหรับสารประกอบที่ต้องการให้ผ่านเครื่องกีดขวางระหว่างเลือดและสมอง

ตัวอย่าง

• แอสไพริน: ประมาณ 63.6 Ų (เอสเทอร์และกรดคาร์บอกซิลิก)
• ไอบูโพรเฟน: ประมาณ 37.3 Ų (กรดคาร์บอกซิลิกหนึ่งหมู่)
• กลูโคส: ประมาณ 110 Ų (หมู่ไฮดรอกซิลห้าหมู่และออกซิเจนในวง)

โปรดจำไว้: TPSA รูปแบบมาตรฐานไม่นับกำมะถันและฟอสฟอรัส และเป็นเพียงแนวทาง ไม่ใช่การวัดการซึมผ่าน ควรใช้ร่วมกับ logP และมวลโมเลกุล เช่น ในเครื่องคำนวณความเหมือนยา