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단백질 분자량 계산기

요약: 서열로 단백질이나 펩타이드의 분자량을 계산하세요: Da/kDa 단위의 평균 질량과 단일 동위 원소 질량, 아미노산 조성, 280 nm 흡광 계수. 무료이며 웹 브라우저에서 바로 작동하고 다운로드가 필요 없습니다.

단백질이나 펩타이드 서열(한 글자 코드 또는 FASTA)을 붙여 넣으세요. 평균 및 단일 동위 원소 분자량, 아미노산 조성, UV 농도 측정을 위한 몰 흡광 계수와 1 mg/mL 용액의 A₂₈₀을 얻을 수 있습니다.

간단한 답: 단백질 MW = 잔기 질량의 합 + 물 한 분자(18.015 Da). 인슐린 A 사슬(잔기 21개)은 평균 2383.71 Da, 단일 동위 원소 2382.00 Da입니다.

단백질 / 펩타이드 서열 (FASTA 헤더, 공백, 숫자는 무시됨)

결과가 여기에 표시됩니다.

단백질 분자량 계산기 사용 방법

한 글자 코드로 서열을 붙여 넣으세요. 헤더 줄, 공백, 숫자, 줄 바꿈이 제거되므로 FASTA 형식도 괜찮습니다.
모든 아미노산의 평균(또는 단일 동위 원소) 잔기 질량을 더하고 자유 N-말단과 C-말단을 위해 물 한 분자를 더합니다.
Da와 kDa 단위의 분자량을 확인하세요. SDS-PAGE와 완충 용액에는 평균 질량을, 펩타이드의 고분해능 질량 분석에는 단일 동위 원소 질량을 사용하세요.
흡광 계수를 비어–람베르트 식(c = A₂₈₀ / ε·l)에 넣으면 UV 측정값으로 농도를 구할 수 있습니다.

풀이 예제

인슐린 A 사슬 (21 aa)

GIVEQCCTSICSLYQLENYCN

평균 2383.71 Da · 단일 동위 원소 2382.00 Da

ε₂₈₀ = Tyr 2개 × 1490 + 시스틴 2개 × 125 = 3230 M⁻¹cm⁻¹

사람 유비퀴틴 (76 aa)

8564.84 Da (8.56 kDa)

Tyr 1개, Trp 없음: ε₂₈₀ = 1490 M⁻¹cm⁻¹

A₂₈₀으로 농도 구하기

ε = 43,824 M⁻¹cm⁻¹인 단백질이 1 cm 큐벳에서 A₂₈₀ = 0.55를 나타냅니다.

c = 0.55 ÷ 43,824 = 12.6 µM

단백질 분자량의 계산 원리

아미노산이 연결될 때 펩타이드 결합마다 물 한 분자가 빠지므로, 단백질은 잔기(아미노산 − H₂O)의 사슬에 말단 H와 OH에 해당하는 물 한 분자를 더한 것입니다.

MW = Σ (잔기 질량) + 18.015 Da (평균) MW_mono = Σ (단일 동위 원소 잔기 질량) + 18.011 Da

평균 잔기 질량은 자연 동위 원소 존재비를 사용하며 SDS-PAGE, 젤 여과, 무게 측정과 관련됩니다. 단일 동위 원소 질량은 가장 풍부한 동위 원소(¹²C, ¹H, ¹⁴N, ¹⁶O, ³²S)만 사용하며 펩타이드 고분해능 질량 스펙트럼의 첫 번째 피크와 일치합니다. 간단히 어림하면 잔기당 110 Da입니다.

280 nm에서의 흡광 계수

280 nm 흡광은 Trp, Tyr, 이황화 결합한 시스테인에서 나옵니다. Pace 등(1995)의 값을 사용합니다:

ε₂₈₀ = 5500 × n(Trp) + 1490 × n(Tyr) + 125 × n(시스틴)

계산된 질량은 변형되지 않은 폴리펩타이드 사슬 기준입니다. 당화, 인산화, 이황화 결합(각 −2.016 Da), 신호 펩타이드 제거, N-말단 Met 가공은 모두 실제 질량을 바꿉니다. 모호한 코드(B, Z, X)는 받지 않으며, U(셀레노시스테인)와 O(피롤라이신)는 받습니다.

작은 분자에는 분자량 계산기를 사용하세요. PDB의 단백질 구조를 보려면 MolDraw 단백질 뷰어를 여세요.

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자주 묻는 질문

단백질의 분자량은 어떻게 계산하나요?

서열에 있는 모든 아미노산의 잔기 질량을 더하고 물 한 분자 18.015 Da를 더합니다. 평균 잔기 질량은 약 110 Da이므로 잔기 300개는 대략 33 kDa입니다.

평균 질량과 단일 동위 원소 질량은 어떻게 다른가요?

평균 질량은 자연 동위 원소 존재비를 사용하며 대량 측정에 맞습니다. 단일 동위 원소 질량은 가장 가벼운 안정 동위 원소만 사용하며 펩타이드의 고분해능 질량 분석 결과와 일치합니다.

Da를 kDa로 어떻게 바꾸나요?

1000으로 나누세요. 8564.84 Da = 8.56 kDa. 1 달톤은 1 g/mol과 같습니다.

흡광 계수는 어떻게 계산하나요?

ε280 = 5500 × Trp + 1490 × Tyr + 125 × 시스틴 (M−1 cm−1). 시스테인이 이황화 결합을 이루는지에 따라 두 값을 제공합니다.

SDS-PAGE에서 단백질 크기가 왜 다르게 나오나요?

번역 후 변형, 특이한 전하, 불완전한 풀림이 젤 이동도를 바꿉니다. 계산값은 변형되지 않은 사슬 기준입니다.

계산기가 FASTA 형식을 처리하나요?

네. '>'로 시작하는 헤더 줄은 무시되며, 공백, 줄 바꿈, 숫자, 종결 기호(*)도 무시됩니다.