IUPAC-naam naar SMILES omzetten
Kort gezegd: Zet systematische namen om naar SMILES of importeer verbindingen uit PubChem op naam/CID. Gratis, werkt in je webbrowser en vereist geen download.
Zet IUPAC-namen of PubChem-stofnamen om naar SMILES. Handig om namen uit de literatuur om te zetten in structuurstrings.
Invoer- en uitvoerformaten
| Invoer: IUPAC-naam | Uitvoer: SMILES | |
|---|---|---|
| Volledige naam | IUPAC-naam | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Wat het bevat | De systematische chemische naam, opgesteld volgens de IUPAC-naamgevingsregels. | Atomen, bindingen, ringen, ladingen en stereo als één regel tekst. Geen coördinaten. |
| Bestand of vorm | Tekst | .smi of platte tekst |
Bestandsformaat uitgelegd
IUPAC-namen zijn formele chemische namen die de structuur systematisch beschrijven. Ze zijn handig in publicaties en onderwijs, maar lange namen zijn lastig in software te plakken.
SMILES is een compacte structuurstring die wordt gebruikt door tekenprogramma's, databases, cheminformaticascripts en converters. IUPAC omzetten naar SMILES maakt van een naam uit de literatuur een machineleesbare structuur.
Naamherkenning werkt het best voor eenduidige, erkende namen. Zouten, mengsels, stereochemie, triviale namen en spellingsvarianten kunnen geen resultaat of een ander record opleveren.
Tips voor het omzetten van naam naar SMILES
Systematische IUPAC-namen leggen een structuur precies vast, maar ze zijn lang en gemakkelijk verkeerd te typen. Een naam omzetten naar SMILES geeft je een compacte, machineleesbare structuur die je in tekenprogramma's of spreadsheets kunt plakken.
Voorbeelden
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid (aspirine) →
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid (L-alanine) →
C[C@@H](C(=O)O)N
Goede resultaten krijgen
- Kopieer namen exact, inclusief plaatsnummers, komma's, streepjes en haakjes: 1,2-dichloroethane is niet hetzelfde als 1,1-dichloroethane.
- Voeg stereodescriptoren zoals (R), (S), (E) of (Z) toe als je een bepaald isomeer nodig hebt; anders blijft de stereochemie mogelijk ongedefinieerd.
- Triviale namen zoals caffeine werken vaak ook (in het Engels), maar zeer nieuwe of zeldzame merknamen misschien niet.
- Let op typografische tekens uit pdf's, zoals speciale streepjes of accenten, en vervang ze door gewone streepjes en apostroffen.
De andere kant op? Gebruik SMILES naar IUPAC-naam.
Laatst bijgewerkt: