Chuyển tên IUPAC sang SMILES
Tóm tắt: Chuyển tên hệ thống sang SMILES hoặc nhập hợp chất từ PubChem theo tên/CID. Miễn phí, chạy ngay trên trình duyệt và không cần tải về.
Chuyển tên IUPAC hoặc tên hợp chất trên PubChem sang SMILES. Hữu ích để biến tên trong tài liệu thành chuỗi cấu trúc.
Định dạng đầu vào và đầu ra
| Đầu vào: tên IUPAC | Đầu ra: SMILES | |
|---|---|---|
| Tên đầy đủ | Tên IUPAC | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Nội dung lưu trữ | Tên hóa học hệ thống được đặt theo quy tắc danh pháp IUPAC. | Nguyên tử, liên kết, vòng, điện tích và lập thể trên một dòng văn bản. Không có tọa độ. |
| Tệp hoặc dạng | Văn bản | .smi hoặc văn bản thuần |
Giải thích định dạng tệp
Tên IUPAC là tên hóa học chính thức được thiết kế để mô tả cấu trúc một cách có hệ thống. Chúng hữu ích trong bài báo và giảng dạy, nhưng tên dài có thể khó dán vào các quy trình phần mềm.
SMILES là chuỗi cấu trúc ngắn gọn được dùng bởi công cụ vẽ, cơ sở dữ liệu, script tin hóa học và công cụ chuyển đổi. Chuyển IUPAC sang SMILES giúp biến tên trong tài liệu thành cấu trúc mà máy đọc được.
Phân giải tên hoạt động tốt nhất với tên rõ ràng, được công nhận. Muối, hỗn hợp, hóa học lập thể, tên thông thường và các biến thể chính tả có thể không cho kết quả hoặc trả về một bản ghi khác.
Mẹo chuyển tên sang SMILES
Tên IUPAC hệ thống mã hóa cấu trúc một cách chính xác, nhưng chúng dài và dễ gõ sai. Chuyển tên sang SMILES cho bạn một cấu trúc ngắn gọn, máy đọc được, có thể dán vào công cụ vẽ hoặc bảng tính.
Ví dụ
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid (aspirin) →
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid (L-alanine) →
C[C@@H](C(=O)O)N
Để có kết quả tốt
- Sao chép tên chính xác, kể cả chỉ số vị trí, dấu phẩy, dấu gạch nối và dấu ngoặc: 1,2-dichloroethane không giống 1,1-dichloroethane.
- Thêm ký hiệu lập thể như (R), (S), (E) hoặc (Z) nếu bạn cần một đồng phân cụ thể; nếu không, hóa học lập thể có thể không được xác định.
- Tên thông thường như caffeine cũng thường dùng được, nhưng tên thương mại rất mới hoặc hiếm có thể không.
- Chú ý các ký tự in ấn từ PDF, như dấu gạch đặc biệt hoặc dấu phẩy trên, và thay bằng dấu gạch nối và dấu nháy đơn thông thường.
Muốn chuyển theo chiều ngược lại? Dùng SMILES sang tên IUPAC.
Cập nhật lần cuối: