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構造式からIUPAC名を生成
概要:化学構造式を描くと、すぐにIUPAC名がわかります。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。
エディターで分子を描く(またはSMILESを貼り付ける)と、体系的なIUPAC名、分子式、PubChemのレコードが得られます。描いた立体化学(くさび形結合、E/Z)も名前に含まれます。
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構造式からIUPAC名へのツールの使い方
- 結合ツールと原子ツールを使ってエディターで分子を描くか、ボックスにSMILES文字列を入力します。
- 描くとSMILESが更新され、少し待つと自動的に名前が検索されます。IUPAC名を取得をクリックすることもできます。
- IUPAC名、分子式、分子量を確認します。PubChemのリンクから物性、同義語、安全性データを参照できます。
- MolDrawエディターを開くをクリックすると、構造式の編集を続けたり、反応スキームに追加したり、画像を書き出したりできます。
例題
アスピリン
CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O
2-acetyloxybenzoic acid
(E)-クロトン酸
C/C=C/C(=O)O
(E)-but-2-enoic acid
E表示は、描いた二重結合の幾何配置から決まります。
イブプロフェン
CC(C)Cc1ccc(cc1)C(C)C(=O)O
2-[4-(2-methylpropyl)phenyl]propanoic acid
IUPAC名の生成方法
エディターは描画をSMILES文字列に変換します。その文字列をPubChemに送ると、PubChemが構造を標準化し、その化合物について計算済みのIUPAC名を返します(PubChemには1億を超える化合物が登録されています)。描画の立体化学は保持されます。PubChemに完全に一致する立体異性体がない場合、ツールは立体情報なしで再検索してその旨を表示するので、R/SやE/Zは自分で追加できます。
有機化合物を手作業で命名する方法(簡易版)
- 主となる官能基を見つけます(カルボン酸 > エステル > アミド > ニトリル > アルデヒド > ケトン > アルコール > アミン)。これで接尾語が決まります:-oic acid(〜酸)、-al(〜アール)、-one(〜オン)、-ol(〜オール)…
- 主鎖または環を選びます。その官能基を含み、最も長いものを選びます:meth-(メタ)、eth-(エタ)、prop-(プロパ)、but-(ブタ)、pent-(ペンタ)、hex-(ヘキサ)…
- 主鎖に番号をつけます。主となる官能基、次に多重結合、次に置換基の順に、位置番号ができるだけ小さくなるようにします。
- 置換基を命名します。位置番号をつけてアルファベット順に並べ(2-methyl、4-chloro)、繰り返しにはdi-、tri-を使います。
- 立体表示記号(R/S、E/Z)を先頭に加えます。
SMILES文字列がすでにある場合はSMILESからIUPAC名への変換ツールを使ってください。逆方向にはIUPAC名からSMILESへを使います。
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MolDrawエディタを開くよくある質問
構造式からIUPAC名を求めるには?
このページのエディターで構造式を描くか、SMILESを貼り付けます。ツールがPubChemから体系的なIUPAC名を検索し、分子式と分子量とともに表示します。
このIUPAC名ジェネレーターは無料ですか?
はい。無料のMolDrawエディターと公開されているPubChemのデータを使ってブラウザ上で動作します。登録は不要です。
立体化学も含まれますか?
はい。くさび形結合や二重結合の幾何配置はSMILESに記録され、PubChemにその立体異性体がある場合は、名前にR/SやE/Zとして反映されます。
「IUPAC名が見つかりません」と表示されるのはなぜですか?
PubChemが命名できるのは、データベースにある構造だけです。原子価の誤りや電荷の付け忘れなど、描画ミスがないか確認してください。本当に新しい化合物は手作業で命名する必要があります。
構造式の画像から名前を求められますか?
直接はできません。エディターで構造式を描き直す(ほとんどの分子は数秒で描けます)か、先に画像をSMILESに変換してください。
IUPAC名と慣用名の違いは何ですか?
IUPAC名は体系的で、構造を表します(2-acetyloxybenzoic acid)。アスピリンのような慣用名や商品名は短いものの、構造の情報は含みません。
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