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構造式からIUPAC名を生成

概要:化学構造式を描くと、すぐにIUPAC名がわかります。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。

エディターで分子を描く(またはSMILESを貼り付ける)と、体系的なIUPAC名、分子式、PubChemのレコードが得られます。描いた立体化学(くさび形結合、E/Z)も名前に含まれます。

要点:構造式を描いてIUPAC名を取得をクリックします。たとえばアスピリンの構造式からは2-acetyloxybenzoic acidが得られます。

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構造式を描くかSMILESを貼り付けて、「IUPAC名を取得」をクリックしてください。
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構造式からIUPAC名へのツールの使い方

  1. 結合ツールと原子ツールを使ってエディターで分子を描くか、ボックスにSMILES文字列を入力します。
  2. 描くとSMILESが更新され、少し待つと自動的に名前が検索されます。IUPAC名を取得をクリックすることもできます。
  3. IUPAC名、分子式、分子量を確認します。PubChemのリンクから物性、同義語、安全性データを参照できます。
  4. MolDrawエディターを開くをクリックすると、構造式の編集を続けたり、反応スキームに追加したり、画像を書き出したりできます。

例題

アスピリン

CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O

2-acetyloxybenzoic acid

(E)-クロトン酸

C/C=C/C(=O)O

(E)-but-2-enoic acid

E表示は、描いた二重結合の幾何配置から決まります。

イブプロフェン

CC(C)Cc1ccc(cc1)C(C)C(=O)O

2-[4-(2-methylpropyl)phenyl]propanoic acid

IUPAC名の生成方法

エディターは描画をSMILES文字列に変換します。その文字列をPubChemに送ると、PubChemが構造を標準化し、その化合物について計算済みのIUPAC名を返します(PubChemには1億を超える化合物が登録されています)。描画の立体化学は保持されます。PubChemに完全に一致する立体異性体がない場合、ツールは立体情報なしで再検索してその旨を表示するので、R/SやE/Zは自分で追加できます。

制限事項:自動命名はPubChemに存在する化合物で機能します。自分で合成したまったく新しい構造では名前が返されないことがあります。その場合は以下の規則を使うか、よく似た類縁体の名前を調べて応用してください。

有機化合物を手作業で命名する方法(簡易版)

  1. 主となる官能基を見つけます(カルボン酸 > エステル > アミド > ニトリル > アルデヒド > ケトン > アルコール > アミン)。これで接尾語が決まります:-oic acid(〜酸)、-al(〜アール)、-one(〜オン)、-ol(〜オール)…
  2. 主鎖または環を選びます。その官能基を含み、最も長いものを選びます:meth-(メタ)、eth-(エタ)、prop-(プロパ)、but-(ブタ)、pent-(ペンタ)、hex-(ヘキサ)…
  3. 主鎖に番号をつけます。主となる官能基、次に多重結合、次に置換基の順に、位置番号ができるだけ小さくなるようにします。
  4. 置換基を命名します。位置番号をつけてアルファベット順に並べ(2-methyl、4-chloro)、繰り返しにはdi-、tri-を使います。
  5. 立体表示記号(R/S、E/Z)を先頭に加えます。

SMILES文字列がすでにある場合はSMILESからIUPAC名への変換ツールを使ってください。逆方向にはIUPAC名からSMILESへを使います。

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よくある質問

構造式からIUPAC名を求めるには?

このページのエディターで構造式を描くか、SMILESを貼り付けます。ツールがPubChemから体系的なIUPAC名を検索し、分子式と分子量とともに表示します。

このIUPAC名ジェネレーターは無料ですか?

はい。無料のMolDrawエディターと公開されているPubChemのデータを使ってブラウザ上で動作します。登録は不要です。

立体化学も含まれますか?

はい。くさび形結合や二重結合の幾何配置はSMILESに記録され、PubChemにその立体異性体がある場合は、名前にR/SやE/Zとして反映されます。

「IUPAC名が見つかりません」と表示されるのはなぜですか?

PubChemが命名できるのは、データベースにある構造だけです。原子価の誤りや電荷の付け忘れなど、描画ミスがないか確認してください。本当に新しい化合物は手作業で命名する必要があります。

構造式の画像から名前を求められますか?

直接はできません。エディターで構造式を描き直す(ほとんどの分子は数秒で描けます)か、先に画像をSMILESに変換してください。

IUPAC名と慣用名の違いは何ですか?

IUPAC名は体系的で、構造を表します(2-acetyloxybenzoic acid)。アスピリンのような慣用名や商品名は短いものの、構造の情報は含みません。

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