Bancos de dados químicos gratuitos: guia prático para estudantes e pesquisadores

Publicado: 6 de outubro de 2026 · Por Rafeeque Mavoor · Categoria: Guias · Dados verificados: outubro de 2026

Todo estudante de química enfrenta o mesmo problema mais cedo ou mais tarde: você tem uma molécula e precisa das suas propriedades, da sua atividade biológica, de uma estrutura cristalina, de um espectro de referência ou de uma patente. Cada uma dessas perguntas mora em um banco de dados diferente. Este guia explica o que é cada grande banco de dados químico gratuito, para que serve, qual o seu tamanho, o que a licença permite e como consultá-lo, com URLs de exemplo reais que testamos antes de publicar.

Todos os números abaixo foram verificados em outubro de 2026 nos sites ou APIs oficiais. O tamanho dos bancos de dados muda a cada versão, então trate-os como retratos do momento, não como constantes.

O que é um banco de dados químico?

Um banco de dados químico é uma coleção pesquisável de estruturas químicas ligadas a dados sobre elas: nomes, identificadores, propriedades calculadas, medidas experimentais, atividades biológicas, coordenadas 3D, espectros ou os documentos em que foram relatadas. A maioria dos bancos de dados modernos pode ser pesquisada por nome, por identificador (número CAS, InChIKey, SMILES) ou desenhando uma estrutura, e muitos oferecem uma API REST gratuita para acesso programático.

O principal a entender é que nenhum banco de dados faz tudo. Eles diferem no foco:

• Enciclopédias de compostos (PubChem, ChEBI) respondem "que molécula é esta?"
• Bancos de dados de bioatividade (ChEMBL, DrugBank) respondem "o que esta molécula faz com uma proteína?"
• Bibliotecas de triagem (ZINC) respondem "que moléculas parecidas posso comprar ou fazer docking?"
• Bancos de dados estruturais (RCSB PDB) respondem "como esta molécula se encaixa no seu alvo?"
• Bancos de dados espectrais (nmrshiftdb2, MassBank, NIST WebBook) respondem "como deveria ser o seu espectro?"
• Coleções especializadas (COCONUT para produtos naturais, SureChEMBL para patentes) cobrem nichos que os grandes deixam de fora.

Como os bancos de dados químicos gratuitos se comparam?

O que é o PubChem? O maior banco de dados químico gratuito

O PubChem é o maior banco de dados de química gratuito do mundo, mantido pelo Centro Nacional de Informação Biotecnológica dos EUA (NCBI). Ele agrega dados de mais de mil colaboradores em coleções interligadas: Substance (o que os depositantes enviaram), Compound (estruturas únicas padronizadas), BioAssay, Protein, Gene, Pathway e Patent.

• Tamanho: cerca de 124 milhões de compostos e 349 milhões de substâncias na página inicial do PubChem (verificado em outubro de 2026). A atualização PubChem 2025, revisada por pares, relatou 118,6 milhões de compostos em setembro de 2024.
• Usado para: consultar nomes, sinônimos, números CAS, fórmulas, propriedades calculadas (XLogP, TPSA), dados de segurança, fornecedores e literatura.
• Quem usa: estudantes, professores, químicos analíticos, toxicologistas, quimioinformatas e qualquer pessoa que precise de um identificador rápido e confiável.
• Acesso: busca web com editor de estruturas e a API gratuita PUG-REST. O PubChem pede que usuários programáticos fiquem abaixo de 5 requisições por segundo.
• Licença: uso gratuito; os direitos de reutilização seguem cada fonte de dados, então verifique a fonte antes de redistribuir dados.

Consulta em linguagem simples: "Dê-me a fórmula, a massa molecular, o SMILES e o InChIKey da aspirina."

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/name/aspirin/property/MolecularFormula,MolecularWeight,SMILES,InChIKey/JSON

Resposta real (resumida):

{"PropertyTable": {"Properties": [{
  "CID": 2244,
  "MolecularFormula": "C9H8O4",
  "MolecularWeight": "180.16",
  "SMILES": "CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O",
  "InChIKey": "BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N"}]}}

Mais consultas testadas no PubChem:

• De InChIKey para CID: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/inchikey/BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N/cids/JSON retorna 2244.
• Similaridade 2D (≥90%) com a cetirizina: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/fastsimilarity_2d/cid/2678/cids/JSON?Threshold=90&MaxRecords=10
• Busca por subestrutura a partir de SMILES: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/fastsubstructure/smiles/c1ccc(cc1)C(c1ccc(Cl)cc1)N1CCNCC1/cids/JSON?MaxRecords=10

O que é o ChEMBL? O banco de dados de referência para bioatividade

O ChEMBL é um banco de dados com curadoria manual de moléculas bioativas com perfil de fármaco, mantido pelo Instituto Europeu de Bioinformática do EMBL (EMBL-EBI). Seu núcleo são dados de atividade medidos, como valores de IC50, Ki e EC50, extraídos de artigos científicos e conjuntos de dados depositados, cada um ligado a um composto, um ensaio e um alvo biológico.

• Tamanho (ChEMBL 37, maio de 2026): 2.921.148 compostos distintos, 24.527.044 atividades, 18.552 alvos e 101.100 publicações, segundo o endpoint de status da API do ChEMBL.
• Usado para: relações estrutura–atividade (SAR), encontrar ativos conhecidos para um alvo, montar conjuntos de treino para aprendizado de máquina e verificar a fase de aprovação de fármacos.
• Quem usa: químicos medicinais, farmacologistas, químicos computacionais e cientistas de dados.
• Acesso: interface web e uma API REST gratuita (JSON ou XML), além de downloads completos (SQLite, PostgreSQL, SDF).
• Licença: CC BY-SA 3.0. O ChEMBL pede que os IDs do ChEMBL e o número da versão sejam mantidos quando você reutiliza seus dados.

Consulta em linguagem simples: "Encontre a aspirina no ChEMBL."

https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/molecule/search.json?q=aspirin

O primeiro resultado é CHEMBL25 (ASPIRIN, fase máxima 4, ou seja, aprovado), com SMILES CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O.

Consulta em linguagem simples: "Quais valores de potência o ChEMBL tem para a cetirizina (CHEMBL1000) no receptor H1 de histamina humano (CHEMBL231)?"

https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/activity.json?molecule_chembl_id=CHEMBL1000&target_chembl_id=CHEMBL231&pchembl_value__isnull=false

Resposta real (reduzida a dois dos 12 registros retornados):

{"activities": [
  {"standard_type": "Ki", "standard_value": "14.0", "standard_units": "nM",
   "pchembl_value": "7.85", "target_pref_name": "Histamine H1 receptor"},
  {"standard_type": "Ki", "standard_value": "5.89", "standard_units": "nM",
   "pchembl_value": "8.23", "target_pref_name": "Histamine H1 receptor"}]}

PubChem vs ChEMBL: qual a diferença?

O PubChem é amplo; o ChEMBL é profundo. O PubChem tenta incluir toda substância química que alguém já depositou, então é o melhor lugar para identificar um composto. O ChEMBL tem muito menos compostos, mas faz a curadoria da atividade biológica em um formato consistente (unidades padrão, valores pChEMBL, alvos mapeados), então é o melhor lugar para perguntar "quão potente ele é, e sobre o quê?" Na prática, você usa os dois: o PubChem para confirmar a estrutura e os identificadores, o ChEMBL para ler a farmacologia.

O que é o ChEBI? Um dicionário curado de moléculas pequenas

O ChEBI (Chemical Entities of Biological Interest) é um dicionário e ontologia de moléculas pequenas com curadoria manual, mantido pelo EMBL-EBI. As entradas curadas têm definição, estrutura, sinônimos e ligações de ontologia que dizem o que a molécula é (por exemplo, "um membro da classe dos ácidos benzoicos") e que papel ela tem (por exemplo, "anti-inflamatório não esteroidal").

• Tamanho: 201.471 entradas, das quais 61.961 são entradas "3 estrelas" totalmente curadas (versão 244, relatada no artigo de 2026 da Nucleic Acids Research).
• Usado para: nomenclatura e classificação consistentes, anotação de dados de metabolômica e biologia de sistemas e ensino de grupos funcionais e classes de compostos.
• Acesso: o ChEBI 2.0 (lançado em outubro de 2025) tem um novo site e uma API REST; os antigos serviços SOAP foram desativados.
• Licença: CC BY 4.0.

Consulta em linguagem simples: "O que é CHEBI:15365?"

https://www.ebi.ac.uk/chebi/backend/api/public/compound/CHEBI:15365/

A resposta traz "name": "acetylsalicylic acid", a fórmula C9H8O4, a massa monoisotópica 180.04226 e o texto da definição. Uma busca por texto também funciona: https://www.ebi.ac.uk/chebi/backend/api/public/es_search/?term=aspirin.

O que é o ZINC? Bilhões de compostos para triagem virtual

O ZINC é um banco de dados gratuito de compostos disponíveis comercialmente ("tangíveis") preparados para triagem virtual, criado pelos laboratórios de Irwin e Shoichet na UCSF. O ZINC-22 foca em enormes catálogos sob encomenda da Enamine, WuXi e Mcule, enquanto o banco irmão ZINC20 cobre catálogos menores de compostos em estoque. O ZINC15 é a geração anterior, que muitos tutoriais ainda mencionam.

• Tamanho: cerca de 54,9 bilhões de moléculas em 2D e 5,9 bilhões em formatos 3D prontos para docking (página inicial do CartBlanche22, verificado em outubro de 2026). O artigo do ZINC-22 relatou 37 bilhões de moléculas 2D na publicação, o que mostra a rapidez com que ele cresce.
• Usado para: campanhas de docking, encontrar análogos compráveis e baixar arquivos 3D prontos para docking, com cargas e conformações.
• Quem usa: químicos computacionais, biólogos estruturais e grupos acadêmicos de triagem.
• Acesso: a interface web CartBlanche (busca por similaridade, subestrutura e ID), downloads em massa e cópias na nuvem.
• Licença: "free to use and download for everyone" (gratuito para todos usarem e baixarem); você não pode redistribuir partes substanciais sem permissão por escrito (licença do ZINC da UCSF).

Consulta em linguagem simples: "Encontre compostos compráveis parecidos com a cetirizina." Cole o SMILES OC(=O)COCCN1CCN(CC1)C(c1ccccc1)c1ccc(Cl)cc1 na busca por similaridade em cartblanche22.docking.org.

O que é o RCSB PDB? Estruturas 3D de proteínas e ligantes

O Protein Data Bank (PDB) é o arquivo global único de estruturas 3D determinadas experimentalmente de proteínas, ácidos nucleicos e seus complexos; o RCSB PDB é seu centro de dados e portal de busca nos EUA. Para químicos, seu valor está nos ligantes ligados: você vê exatamente como uma molécula pequena se encaixa no sítio de ligação.

• Tamanho: 260.724 entradas atuais (API de acervo do RCSB, verificado em outubro de 2026).
• Usado para: estudar modos de ligação, preparar receptores para docking, ensinar estrutura de proteínas e encontrar todas as estruturas que contêm um dado ligante.
• Acesso: web, a Data API (data.rcsb.org) e a Search API (search.rcsb.org), que aceita buscas por texto, sequência e química.
• Licença: os dados do PDB são liberados sob CC0 1.0 (domínio público).

Consulta em linguagem simples: "Mostre o registro do ligante da aspirina (ID de componente AIN)."

https://data.rcsb.org/rest/v1/core/chemcomp/AIN

Isso retorna o nome 2-(ACETYLOXY)BENZOIC ACID e a fórmula C9 H8 O4.

Consulta em linguagem simples: "Quais entradas do PDB contêm aspirina?" (Search API; cole no navegador, que codifica o JSON na URL para você):

https://search.rcsb.org/rcsbsearch/v2/query?json={"query":{"type":"terminal","service":"text","parameters":{"attribute":"rcsb_nonpolymer_instance_annotation.comp_id","operator":"exact_match","value":"AIN"}},"return_type":"entry"}

Resposta real (resumida): "total_count": 8, com entradas como 1OXR, 1TGM e 3GCL. Uma busca química enviada com o SMILES da aspirina (service: "chemical") também retornou AIN como melhor correspondência. Você pode carregar qualquer uma dessas entradas pelo PDB ID no visualizador de proteínas do MolDraw ou abri-la em rcsb.org.

O que é o UniChem? Tradução de IDs entre bancos de dados

O UniChem é o serviço de referência cruzada de identificadores do EMBL-EBI: você fornece um identificador de estrutura e ele devolve os IDs correspondentes em outros bancos de dados. Ele liga registros pelo InChI/InChIKey padrão, então funciona sempre que dois bancos de dados têm a mesma estrutura.

• Tamanho: 25 fontes listadas pela API do UniChem, entre elas ChEMBL, PubChem, ChEBI, DrugBank, RCSB PDB, PDBe, SureChEMBL, HMDB, BindingDB e nmrshiftdb2 (verificado em outubro de 2026).
• Usado para: mesclar conjuntos de dados, passar de um ID do ChEMBL para um código de ligante do PDB e verificar onde mais um composto aparece.
• Acesso: web e API REST (/unichem/api/v1/).
• Licença: uso gratuito sob os termos de uso do EMBL-EBI; os dados por trás de cada ID mapeado mantêm a licença da sua fonte.

Consulta em linguagem simples: "Onde mais aparece o InChIKey da aspirina?"

curl -X POST https://www.ebi.ac.uk/unichem/api/v1/compounds \
  -H "Content-Type: application/json" \
  -d '{"type":"inchikey","compound":"BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N"}'

A resposta o mapeia para CHEMBL25, CHEBI:15365, CID do PubChem 2244, DrugBank DB00945, ligante do PDB AIN e Guide to Pharmacology 4139, entre outros.

O que é o nmrshiftdb2? Um banco de dados gratuito de espectros de RMN

O nmrshiftdb2 é um banco de dados web aberto e revisado por pares de estruturas orgânicas e seus espectros de RMN, com previsão de deslocamentos de ¹H e ¹³C integrada. Seu núcleo são espectros totalmente atribuídos, muitos com dados brutos.

• Tamanho: 271.817 estruturas, 70.030 espectros medidos e 396.583 espectros calculados (contador da página inicial, verificado em outubro de 2026).
• Usado para: conferir uma atribuição, encontrar deslocamentos de referência para uma classe de compostos e ensinar a interpretação de RMN.
• Acesso: busca web por estrutura, subestrutura, espectro e outras propriedades; o site anunciou uma nova interface REST em junho de 2026 (não a testamos).
• Licença: o software é de código aberto e os dados são publicados sob uma licença de conteúdo aberto.

Consulta em linguagem simples: "Encontre espectros de ¹³C medidos de compostos que contêm um grupo 4-clorobenzidrila." Desenhe o fragmento na aba de busca do nmrshiftdb2 e faça uma busca por subestrutura. Para uma estimativa rápida antes de buscar, a ferramenta estrutura para RMN do MolDraw prevê um espectro a partir do seu desenho.

O que é o MassBank? Espectros de EM/EM experimentais

O MassBank é um repositório aberto de espectros de massas experimentais de moléculas pequenas, com contribuições de laboratórios do mundo todo. Os exemplos aqui usam o MassBank Europe (massbank.eu). Cada registro descreve um espectro: composto, instrumento, ionização, energia de colisão e lista de picos.

• Tamanho: 139.006 registros (contagem da API do MassBank, verificado em outubro de 2026).
• Usado para: identificar desconhecidos em LC-MS/MS e metabolômica, comparar padrões de fragmentação e ensinar espectrometria de massas.
• Acesso: busca web (nome, fórmula, picos) e uma API REST.
• Licença: cada registro tem sua própria licença Creative Commons (CC BY por padrão, mas alguns são CC0, CC BY-SA ou não comerciais), então confira o campo license antes de reutilizar.

Consulta em linguagem simples: "Liste os espectros do MassBank para a cafeína."

https://massbank.eu/MassBank-api/records/search?compound_name=caffeine

Isso retornou 134 identificadores de registro. Buscar um deles, https://massbank.eu/MassBank-api/records/MSBNK-ACES_SU-AS000088, dá um espectro MS2 de LC-APCI Orbitrap do [M+H]⁺, com o precursor em m/z 195,088 e um fragmento principal em m/z 138,067, licenciado como CC BY.

O que é o COCONUT? O banco de dados aberto de produtos naturais

O COCONUT (COlleCtion of Open NatUral producTs) é a maior coleção aberta de estruturas de produtos naturais, com curadoria do grupo Steinbeck da Universidade Friedrich Schiller de Jena. A versão 2.0 liga cada molécula aos organismos de origem, à literatura e às variantes estereoquímicas.

• Tamanho: 738.829 moléculas únicas de 71 coleções, com 73.137 organismos (página de estatísticas do COCONUT, verificado em outubro de 2026). O artigo do COCONUT 2.0 relatou 695.133 no lançamento, em setembro de 2024.
• Usado para: desreplicação de produtos naturais, ideias de esqueletos e montagem de conjuntos de triagem.
• Acesso: busca web (nome, estrutura, subestrutura, similaridade) e downloads completos em SDF/SQL. A API REST existe, mas exige login com uma conta gratuita, então não a usamos neste guia.
• Licença: dados CC0; código MIT.

Consulta em linguagem simples: "Mostre produtos naturais parecidos com a cafeína." Cole o SMILES da cafeína CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C na busca por estrutura em coconut.naturalproducts.net.

O que é o SureChEMBL? Química extraída de patentes

O SureChEMBL é o banco de dados gratuito de química de patentes do EMBL-EBI: ele minera o texto e as imagens de documentos de patentes e extrai as estruturas químicas mencionadas. É o jeito gratuito mais fácil de perguntar "quais patentes contêm esta estrutura?"

• Tamanho: o SureChEMBL 2.0 (maio de 2025) cobre cerca de 116,6 milhões de documentos de patentes de cinco escritórios (CNIPA, EPO, JPO, USPTO, WIPO); só o USPTO contribuiu com cerca de 19,9 milhões de compostos únicos.
• Usado para: verificação de estado da técnica, mapeamento de patentes e identificação de séries de compostos antes que apareçam em periódicos.
• Acesso: busca web por estrutura ou palavra-chave, uma API REST e arquivos Parquet em massa atualizados a cada duas semanas.
• Licença: CC BY 4.0.

Consulta em linguagem simples: "Resolva o nome cetirizine para um composto do SureChEMBL."

https://www.surechembl.org/api/chemical/name/cetirizine

Resposta real (resumida): "chemical_id": "4176", "inchi_key": "ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N". Depois você pode buscar patentes que contêm essa estrutura na interface web.

E o DrugBank e o NIST Chemistry WebBook?

O DrugBank é uma base de conhecimento detalhada sobre fármacos aprovados e em investigação, seus alvos, metabolismo e interações. É gratuito para navegar, mas os downloads exigem conta; os conjuntos de dados acadêmicos são licenciados como CC BY-NC 4.0 para uso não comercial, e o uso comercial exige uma licença paga. Trate-o como "grátis para ler, não para reutilizar".

O NIST Chemistry WebBook (NIST Standard Reference Database 69) oferece dados termoquímicos, espectros de IV em fase gasosa e espectros de massas por ionização por elétrons de muitas moléculas pequenas. A busca online é gratuita, por exemplo https://webbook.nist.gov/cgi/cbook.cgi?Name=caffeine&Units=SI, mas os dados são protegidos por direitos autorais e a redistribuição em massa exige permissão do NIST.

Qual banco de dados químico devo usar?

Como uso esses bancos de dados com o MolDraw?

A maioria dos bancos de dados busca melhor com um identificador legível por máquina do que com um nome. O MolDraw fornece esses identificadores direto de um desenho:

1. Desenhe a estrutura no editor MolDraw (ou cole um nome com nome para estrutura).
2. Copie o SMILES na linha de opções do topo. Copy as… no menu de contexto também oferece os formatos InChI e MOL (veja o capítulo de SMILES do curso do MolDraw).
3. Gere um InChIKey com o conversor de SMILES para InChIKey. O InChIKey é a chave de correspondência exata mais confiável entre PubChem, ChEMBL, ChEBI e UniChem.
4. Consulte: cole o SMILES na busca por estrutura de um banco de dados, ou coloque o InChIKey em uma das URLs REST acima.
5. Traga os resultados de volta: converta um CID do PubChem com o conversor de CID para SMILES ou um InChIKey com InChIKey para SMILES e cole no MolDraw para editar.

Exemplo resolvido: como comparo análogos da cetirizina?

Suponha que você estuda o anti-histamínico cetirizina e quer saber quais análogos próximos existem, quão potentes são e se daria para comprar novos. Aqui está um fluxo com três bancos de dados; todos os números vêm das consultas ao vivo que fizemos.

Etapa 1: identifique-a no PubChem. Desenhe a cetirizina no MolDraw, copie o SMILES e consulte:

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/name/cetirizine/property/MolecularFormula,MolecularWeight,InChIKey,XLogP,TPSA/JSON

O PubChem retorna CID 2678, C21H25ClN2O3, MM 388,9, XLogP 1,7, TPSA 53 e InChIKey ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N.

Etapa 2: encontre análogos no PubChem. A consulta de similaridade 2D (limiar 90) retorna parentes, entre eles a hidroxizina (CID 3658, o fármaco de origem da cetirizina) e a levocetirizina (CID 1549000, seu enantiômero isolado), além dos seus sais. Uma busca por subestrutura no núcleo clorobenzidril-piperazina acrescenta clorciclizina, meclizina e buclizina.

Etapa 3: compare a atividade no ChEMBL. Consulte o InChIKey no ChEMBL:

https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/molecule.json?molecule_structures__standard_inchi_key=ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N

Isso dá CHEMBL1000 (fase máxima 4, aprovado pela primeira vez em 1995). Seus registros de atividade incluem valores de Ki no receptor H1 humano entre 5,89 e 79 nM (pChEMBL 7,1–8,2) e um IC50 bem mais fraco no hERG (KCNH2), de cerca de 30 µM (pChEMBL de cerca de 4,5). Essa janela de cerca de três ordens de grandeza é o tipo de comparação de seletividade que o ChEMBL facilita. Uma busca por similaridade, https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/similarity/ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N/80.json, lista a levocetirizina e formas de sal da cetirizina para comparar do mesmo jeito.

Etapa 4: procure análogos compráveis no ZINC. Cole o SMILES na busca por similaridade do CartBlanche22 para ver compostos sob encomenda que variam a cadeia lateral ácida ou os anéis arila. Depois confira as propriedades de qualquer resultado interessante no MolDraw, por exemplo com a calculadora da regra de Lipinski.

Como buscar bem em bancos de dados químicos?

• Prefira InChIKeys para correspondências exatas e SMILES para buscas por similaridade ou subestrutura. Nomes são ambíguos ("vitamina C", sais, nomes comerciais).
• Atenção a sais e estereoisômeros. Cetirizina, dicloridrato de cetirizina e levocetirizina são registros diferentes em todos os bancos de dados.
• Anote a versão ou a data. Cite o ChEMBL com o número da versão e registre a data em que consultou o PubChem.
• Respeite os limites de requisições. O PubChem pede no máximo 5 requisições por segundo; agrupe trabalhos grandes ou baixe os arquivos em massa.
• Confira a licença antes de redistribuir. Navegar é gratuito em todos os bancos deste guia; republicar dados nem sempre é.

Perguntas frequentes

Qual é o maior banco de dados químico gratuito?

O PubChem é o maior banco de dados químico gratuito, com cerca de 124 milhões de compostos únicos e 349 milhões de substâncias depositadas (verificado em outubro de 2026). O ZINC-22 lista mais moléculas (cerca de 54,9 bilhões), mas a maioria são compostos virtuais sob encomenda para triagem, e não substâncias caracterizadas.

Qual a diferença entre o PubChem e o ChEMBL?

O PubChem é um agregador amplo que tenta cobrir toda substância química depositada, então é o melhor para identificação e propriedades. O ChEMBL é menor, mas tem curadoria manual voltada à bioatividade, com valores de potência padronizados ligados a alvos, então é o melhor para questões de estrutura–atividade e descoberta de fármacos.

O ZINC é gratuito para uso comercial?

Segundo a licença do ZINC da UCSF, o ZINC é gratuito para usar e baixar para todos, inclusive empresas. A restrição é a redistribuição: você não pode redistribuir partes substanciais do ZINC sem permissão por escrito da equipe do ZINC. Os compostos em si precisam ser comprados dos fornecedores listados.

Qual banco de dados gratuito tem espectros de RMN?

O nmrshiftdb2 é o principal banco de dados gratuito de RMN, com 70.030 espectros medidos para 271.817 estruturas (verificado em outubro de 2026) e previsão de ¹H e ¹³C integrada. As páginas de compostos do PubChem também têm links para espectros de outras fontes, e o NIST Chemistry WebBook cobre espectros de IV e de massas, não de RMN.

Qual banco de dados gratuito tem espectros de massas?

O MassBank reúne 139.006 registros de espectros de massas experimentais (verificado em outubro de 2026), principalmente espectros de EM/EM de moléculas pequenas, sob licenças Creative Commons definidas por registro. O NIST Chemistry WebBook oferece online espectros de massas por ionização por elétrons de muitas moléculas pequenas.

Posso buscar em bancos de dados químicos por estrutura?

Sim. PubChem, ChEMBL, ChEBI, ZINC, RCSB PDB, nmrshiftdb2, COCONUT e SureChEMBL aceitam busca por estrutura, geralmente desenhando ou colando um SMILES. Você pode desenhar a molécula no MolDraw, copiar o SMILES e colá-lo na busca por estrutura do banco de dados, ou usar consultas exatas, por subestrutura ou por similaridade pelas APIs.

Qual banco de dados químico é melhor para estudantes?

Comece pelo PubChem para nomes, propriedades e dados de segurança, pelo ChEBI para definições e classes de compostos e pelo RCSB PDB para estruturas 3D. Os três são gratuitos, não exigem conta e têm interfaces web claras. Acrescente o ChEMBL quando estudar farmacologia e o nmrshiftdb2 quando aprender RMN.

O que é um banco de dados de bioatividade?

Um banco de dados de bioatividade guarda efeitos medidos de compostos sobre alvos biológicos, como valores de IC50, Ki ou EC50, ligados ao ensaio e à proteína. O ChEMBL é o principal banco de dados gratuito de bioatividade; o PubChem BioAssay reúne resultados de triagem depositados por laboratórios e centros de triagem.

O DrugBank é gratuito?

O DrugBank é gratuito para navegar online, e usuários acadêmicos podem baixar conjuntos de dados sob licença CC BY-NC 4.0 depois de se registrar. O uso comercial, inclusive em produtos ou serviços comerciais, exige uma licença paga do DrugBank.

Como converto um CID do PubChem em um ID do ChEMBL?

Use o UniChem. Encontre o InChIKey do composto (o PubChem o mostra em toda página de composto) e envie-o à API de compostos do UniChem, que devolve os identificadores correspondentes do ChEMBL, ChEBI, DrugBank, PDB e outros. Para a aspirina, o InChIKey BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N mapeia o CID 2244 para CHEMBL25.

Fontes

• PubChem: pubchem.ncbi.nlm.nih.gov · Documentação do PUG-REST · Kim S. et al. PubChem 2025 update, Nucleic Acids Res. 2025, doi:10.1093/nar/gkae1059
• ChEMBL: ebi.ac.uk/chembl · Documentação da API · Licença e informações · Post de lançamento do ChEMBL 37
• ChEBI: ebi.ac.uk/chebi · Lançamento do ChEBI 2.0 · ChEBI: re-engineered for a sustainable future, Nucleic Acids Res. 2026, academic.oup.com/nar/article/54/D1/D1768/8349173
• ZINC: CartBlanche22 · Tingle B. I. et al. ZINC-22, J. Chem. Inf. Model. 2023, doi:10.1021/acs.jcim.2c01253 · Licença do ZINC da UCSF
• RCSB PDB: rcsb.org · Data API · Search API · Política de uso
• UniChem: ebi.ac.uk/unichem · Documentação da API
• nmrshiftdb2: nmrshiftdb.nmr.uni-koeln.de
• MassBank: massbank.eu · API do MassBank · Formato de registro e licenças
• COCONUT: coconut.naturalproducts.net · Chandrasekhar V. et al. COCONUT 2.0, Nucleic Acids Res. 2025, doi:10.1093/nar/gkae1063
• SureChEMBL: surechembl.org · Anúncio do SureChEMBL 2.0 · FAQ e licença
• DrugBank: go.drugbank.com · Licenciamento acadêmico
• NIST Chemistry WebBook: webbook.nist.gov/chemistry · Licenciamento do NIST SRD