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Visualizador de espectros de massas grátis

Em resumo: abra arquivos JCAMP-DX, CSV, mzML ou mzXML, rotule picos, sobreponha o padrão isotópico de uma fórmula, SMILES ou peptídeo, verifique adutos, erro em ppm e perdas neutras, e exporte em PNG ou CSV. É grátis, funciona no navegador e não precisa de download.

Abra um espectro de massas, rotule os picos e compare-o com o padrão isotópico da sua fórmula, SMILES ou peptídeo. Verifique adutos, erro em ppm e perdas neutras. Seus arquivos ficam no seu dispositivo.

ou solte-o aqui. JCAMP-DX (.jdx, .dx), CSV/TXT (m/z, intensidade), mzML ou mzXML (primeiro espectro).

Carregar exemplo:

Os exemplos são simulados e podem ser reutilizados livremente. Baixe o exemplo .jdx.

Fórmula, SMILES ou peptídeo

Como usar o visualizador de espectros de massas

  1. Abra seu arquivo ou clique em um botão de exemplo.
  2. Escolha Barras ou Perfil, dê zoom na região desejada e marque Pico base = 100% para normalizar.
  3. Digite uma fórmula, SMILES ou peptídeo e escolha o íon, como [M+H]+. As barras vermelhas mostram o padrão isotópico teórico.
  4. Toque no pico medido para obter o erro em ppm. A tabela de adutos mostra quais íons comuns estão presentes.
  5. Leia os rótulos de perda neutra entre os picos principais.
  6. Exporte em PNG ou CSV.

Como ler um espectro de massas

Cada pico é um íon no seu m/z (massa dividida pela carga). O pico mais alto é o pico base e é definido como 100%. Em espectros de IE, o íon molecular M+• costuma ser pequeno e os fragmentos contam a história. Em ESI você vê principalmente [M+H]+, [M+Na]+ ou [M-H]-, e moléculas grandes como peptídeos também mostram íons 2+ e 3+, com picos isotópicos espaçados de 0,5 ou 0,33.

Isótopos: o carbono-13 adiciona um pico 1 acima de M, cerca de 1,1% por carbono. Cloro e bromo adicionam picos fortes 2 acima de M. Perdas neutras como −18 (H2O), −28 (CO), −44 (CO2) ou −35 (Cl) entre os picos mostram quais grupos se desprendem.

Perguntas frequentes

Meus dados são enviados para algum servidor?

Não. Os arquivos são lidos e desenhados apenas no seu navegador.

Quais arquivos posso abrir?

Espectros de massas JCAMP-DX (tabelas de picos e dados contínuos), CSV ou TXT com colunas de m/z e intensidade, e mzML ou mzXML. Para mzML e mzXML é exibido o primeiro espectro. Arrays comprimidos (zlib) funcionam nos navegadores atuais.

Qual a diferença entre massa monoisotópica, média e exata?

A massa monoisotópica usa o isótopo mais comum de cada elemento (12C, 1H, 35Cl). A massa média usa as abundâncias naturais e é o que você pesa na balança. O m/z exato é a massa monoisotópica do íon observado, com os átomos adicionados ou removidos e a massa do elétron.

Como verifico a presença de cloro ou bromo?

Digite a fórmula e observe o padrão. Um Cl dá um pico M+2 de cerca de um terço de M (3:1). Um Br dá M e M+2 praticamente iguais (1:1). Dois Br dão 1:2:1. As barras vermelhas mostram a teoria sobre seus dados.

Como o erro em ppm é calculado?

ppm = (medido − teórico) / teórico × 1 000 000. Toque em um pico para usá-lo como valor medido. Para dados de alta resolução, até cerca de 5 ppm é uma boa concordância.

O que são os rótulos de perda neutra?

A ferramenta analisa as diferenças entre os picos principais e nomeia perdas neutras pequenas comuns, como H2O, NH3, CO, CO2, CH3, HCl, Cl e Br. Os picos isotópicos são ignorados. Em resolução unitária, CO e C2H4 parecem iguais, então ambos podem aparecer.

De onde vêm os números dos isótopos?

As massas isotópicas e as abundâncias naturais são valores de referência públicos da IUPAC (CIAAW) e do NIST. O padrão é calculado combinando os isótopos de todos os átomos.

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