Transformer des esquisses à main levée en structures chimiques avec Smart Draw
Réponse courte : installez Smart Draw depuis Settings › Plugins et choisissez l'outil Smart Draw dans la barre d'outils de gauche. Esquissez liaisons, cycles et lettres au stylet, au doigt ou à la souris, puis appuyez sur Convert ou Entrée. MolDraw transforme les traits en une structure propre que vous pouvez modifier et exporter comme n'importe quel autre dessin. La reconnaissance s'exécute dans votre navigateur.
Pourquoi esquisser plutôt que cliquer ?
Les chimistes apprennent à dessiner les structures à la main. Une formule topologique est rapide sur papier : chaque angle et chaque extrémité de trait est un carbone, les hydrogènes portés par les carbones sont implicites, et seuls les hétéroatomes reçoivent une lettre. La plupart des éditeurs de structures vous obligent à traduire cette habitude en choix d'outils et en clics.
Sur une tablette ou un tableau blanc interactif, cette traduction est lente. On passe de nombreuses fois de l'outil liaison à l'outil cycle puis au menu des atomes pour une seule molécule. Smart Draw vous permet de dessiner comme sur papier. Il lit chaque trait comme une liaison, un cycle ou une lettre et construit la structure pour vous.
Le résultat n'est pas une image de votre écriture. C'est une molécule MolDraw normale avec des atomes et des liaisons, que vous pouvez mettre au propre, nommer, dont vous pouvez copier le SMILES ou que vous pouvez analyser avec d'autres plugins.
Ce que Smart Draw reconnaît
| Trait droit | Une liaison simple. |
|---|---|
| Ligne en zigzag | Une chaîne, avec une liaison entre chaque paire d'angles. |
| Deux traits parallèles | Une liaison double. |
| Forme fermée | Un cycle ayant le même nombre de côtés, de 3 à 8. |
| Cercle dans un cycle | Marque un cycle à cinq ou six chaînons comme aromatique. |
| Lettres | Symboles d'atomes comme N, O, S ou Cl. Les lettres écrites côte à côte, comme OH, sont lues ensemble. |
| + ou − | Une charge positive ou négative sur l'atome le plus proche. |
Les traits qui se terminent près d'un atome déjà présent sur le canevas se rattachent à cet atome, ce qui permet de prolonger une structure dessinée avec les outils habituels.
Comment installer Smart Draw
- Ouvrez l'éditeur MolDraw et connectez-vous. Un compte gratuit suffit.
- Cliquez sur Settings (la roue dentée), puis sur Plugins.
- Cliquez sur Install à côté de Smart Draw. L'outil Smart Draw apparaît dans la barre d'outils de gauche.
Comment esquisser une structure
- Sélectionnez l'outil Smart Draw dans la barre d'outils de gauche.
- Dessinez un cycle d'un seul trait continu, par exemple un hexagone pour le cyclohexane. Pour des cycles fusionnés ou un benzène exact, placez plutôt des modèles de cycles avec les outils de cycles.
- Ajoutez des substituants sous forme de traits droits partant d'un angle du cycle. Dessinez un zigzag pour une chaîne plus longue.
- Pour une liaison double, dessinez un second trait de longueur similaire, proche et parallèle au premier.
- Écrivez une lettre au bout d'une liaison pour en faire un hétéroatome, par exemple O pour un alcool.
- Vérifiez l'aperçu. La barre Smart Draw indique ce que MolDraw lit, par exemple « 3 bonds · N », et rien ne change avant la conversion : vous pouvez donc faire des pauses aussi souvent que vous voulez. Utilisez Undo stroke (Ctrl+Z) ou Clear (Échap) pour corriger une erreur.
- Appuyez sur Convert ou Entrée. Les traits deviennent une structure et MolDraw met en forme la nouvelle partie. Si vous préférez la conversion automatique, activez Auto dans la barre pour convertir après une pause de 2,5 secondes.
- Passez aux outils habituels pour ajouter des liaisons en coin, changer des liaisons ou corriger ce qui est mal sorti.
Utilisations en cours et au laboratoire
- Cours sur écran tactile : esquissez une molécule en direct pendant que vous parlez, puis montrez aussitôt sa structure propre et son nom.
- Entraînement des étudiants : les étudiants dessinent de mémoire, comme à un examen, et obtiennent une vraie structure qu'ils peuvent vérifier.
- Notes rapides au laboratoire : notez une structure sur une tablette avec un stylet et copiez son SMILES dans votre cahier.
- Étapes suivantes : vérifiez la formule avec l'outil SMILES en formule brute, ou apprenez la méthode par clics dans comment dessiner le benzène, le cyclohexane et les cycles fusionnés.
Conseils et limites
- Fermez chaque cycle d'un seul trait et marquez bien les angles, pour que le nombre de côtés soit lu correctement.
- Gardez les liaisons raisonnablement droites et à peu près de même longueur.
- Dessinez un cycle aromatique sous forme d'hexagone avec un cercle à l'intérieur.
- Sur iPad, utilisez l'Apple Pencil et activez les options d'écran tactile dans Settings › Touch screen.
Smart Draw lit des formes, pas de la chimie. Il ne dessine pas de liaisons en coin plein ou hachurées : ajoutez la stéréochimie ensuite avec les outils de liaison habituels. Une écriture soignée compte pour les lettres, et les symboles complexes peuvent nécessiter l'outil atome habituel. Regardez toujours le résultat avant de vous y fier : un cycle avec une ondulation en trop ou une lettre mal lue change la molécule.
Smart Draw fonctionne hors ligne car la reconnaissance s'exécute localement. Votre esquisse n'est pas envoyée à un serveur.
Questions et réponses
Smart Draw fonctionne-t-il hors ligne ?
Oui. La reconnaissance des traits s'exécute dans votre navigateur, et votre esquisse n'est pas envoyée à un serveur.
Puis-je l'utiliser sur téléphone ou tablette ?
Oui. Vous pouvez dessiner au doigt, au stylet ou à la souris. Un stylet donne les traits les plus nets.
Que peut reconnaître Smart Draw ?
Les liaisons simples, les chaînes en zigzag, les liaisons doubles dessinées par deux traits parallèles, les cycles de 3 à 8 chaînons, les cycles aromatiques marqués d'un cercle, les connexions aux atomes déjà présents sur le canevas, les symboles d'atomes simples et les charges plus ou moins.
Que se passe-t-il si un trait n'est pas reconnu ?
Le trait reste sur le canevas sous forme d'encre grise. Si rien dans l'esquisse ne peut être lu, MolDraw affiche un court message. Effacez l'encre et redessinez, ou utilisez les outils habituels.