Handgetekende schetsen omzetten in chemische structuren met Smart Draw
Kort antwoord: Installeer Smart Draw via Settings › Plugins en kies het hulpmiddel Smart Draw in de linkerwerkbalk. Schets bindingen, ringen en letters met een stylus, je vinger of de muis en druk daarna op Convert of Enter. MolDraw maakt van de lijnen een nette structuur die je kunt bewerken en exporteren zoals elke andere tekening. De herkenning draait in je browser.
Waarom schetsen in plaats van klikken?
Chemici leren structuren met de hand te tekenen. Een skeletformule zet je snel op papier: elke hoek en elk lijneinde is een koolstofatoom, waterstofatomen op koolstof zijn impliciet en alleen heteroatomen krijgen een letter. De meeste structuureditors dwingen je die gewoonte te vertalen in toolkeuzes en klikken.
Op een tablet of een digibord is die vertaling traag. Voor één molecuul wissel je vaak tussen het bindingsgereedschap, het ringgereedschap en het atoommenu. Met Smart Draw teken je zoals je op papier zou doen. Het leest elke lijn als binding, ring of letter en bouwt de structuur voor je op.
Het resultaat is geen afbeelding van je handschrift. Het is een gewoon MolDraw-molecuul met atomen en bindingen, dus je kunt het opschonen, een naam geven, de SMILES kopiëren of het met andere plug-ins analyseren.
Wat Smart Draw herkent
| Rechte lijn | Een enkele binding. |
|---|---|
| Zigzaglijn | Een keten, met één binding tussen elk paar hoeken. |
| Twee evenwijdige lijnen | Een dubbele binding. |
| Gesloten vorm | Een ring met hetzelfde aantal zijden, van 3 tot 8. |
| Cirkel in een ring | Markeert een vijf- of zesring als aromatisch. |
| Letters | Atoomlabels zoals N, O, S of Cl. Letters die naast elkaar staan, zoals OH, worden samen gelezen. |
| + of − | Een positieve of negatieve lading op het dichtstbijzijnde atoom. |
Lijnen die eindigen bij een atoom dat al op het canvas staat, worden met dat atoom verbonden, zodat je een structuur kunt uitbreiden die je met de gewone tools hebt getekend.
Zo installeer je Smart Draw
- Open de MolDraw-editor en meld je aan. Een gratis account is genoeg.
- Klik op Settings (het tandwiel) en daarna op Plugins.
- Klik op Install naast Smart Draw. Het hulpmiddel Smart Draw verschijnt in de linkerwerkbalk.
Zo schets je een structuur
- Kies het hulpmiddel Smart Draw in de linkerwerkbalk.
- Teken een ring in één doorlopende lijn, bijvoorbeeld een zeshoek voor cyclohexaan. Voor gecondenseerde ringen of een exacte benzeen kun je beter ringsjablonen plaatsen met de ringtools.
- Voeg substituenten toe als rechte lijnen vanuit een hoek van de ring. Teken een zigzag voor een langere keten.
- Teken voor een dubbele binding een tweede lijn van ongeveer dezelfde lengte, dicht bij en evenwijdig aan de eerste.
- Schrijf een letter aan het eind van een binding om er een heteroatoom van te maken, bijvoorbeeld O voor een alcohol.
- Controleer het voorbeeld. De Smart Draw-balk toont wat MolDraw leest, bijvoorbeeld “3 bonds · N”, en er verandert niets tot je converteert, dus je kunt zo vaak pauzeren als je wilt. Gebruik Undo stroke (Ctrl+Z) of Clear (Esc) om een fout te herstellen.
- Klik op Convert of druk op Enter. De lijnen worden een structuur en MolDraw maakt de lay-out van het nieuwe deel netjes. Converteer je liever automatisch, zet dan Auto aan in de balk; er wordt dan na een pauze van 2,5 seconde geconverteerd.
- Schakel over naar de gewone tools om wiggen toe te voegen, bindingen te wijzigen of iets te herstellen dat verkeerd is gegaan.
Zo gebruik je het in de les en in het lab
- College geven op een touchscreen: schets een molecuul live terwijl je praat en toon meteen de nette structuur en de naam.
- Oefenen voor studenten: studenten tekenen uit het hoofd, zoals op een examen, en krijgen een echte structuur die ze kunnen controleren.
- Snelle notities in het lab: noteer een structuur op een tablet met een stylus en kopieer de SMILES naar je labjournaal.
- Volgende stappen: controleer de formule met de tool SMILES naar formule, of leer de klikmethode in benzeen, cyclohexaan en gecondenseerde ringen tekenen.
Tips en beperkingen
- Sluit elke ring in één lijn en maak de hoeken duidelijk, zodat het aantal zijden goed wordt gelezen.
- Houd bindingen redelijk recht en ongeveer even lang.
- Teken een aromatische ring als zeshoek met een cirkel erin.
- Gebruik op een iPad de Apple Pencil en zet de touchscreenopties aan in Settings › Touch screen.
Smart Draw leest vormen, geen chemie. Het tekent geen wig- of streepjesbindingen, dus voeg stereochemie achteraf toe met de gewone bindingstools. Een net handschrift is belangrijk voor letters, en ingewikkelde labels hebben mogelijk het gewone atoomgereedschap nodig. Bekijk altijd het resultaat voordat je erop vertrouwt: een ring met een extra wiebel of een verkeerd gelezen letter verandert het molecuul.
Smart Draw werkt offline omdat de herkenning lokaal draait. Je schets wordt niet naar een server gestuurd.
Vragen en antwoorden
Werkt Smart Draw offline?
Ja. De herkenning van lijnen draait in je browser en je schets wordt niet naar een server gestuurd.
Kan ik het op een telefoon of tablet gebruiken?
Ja. Je kunt tekenen met je vinger, een stylus of een muis. Een stylus geeft de netste lijnen.
Wat kan Smart Draw herkennen?
Enkele bindingen, zigzagketens, dubbele bindingen getekend als twee evenwijdige lijnen, ringen met 3 tot 8 atomen, aromatische ringen gemarkeerd met een cirkel, verbindingen met atomen die al op het canvas staan, eenvoudige atoomlabels en plus- of minladingen.
Wat gebeurt er als een lijn niet wordt herkend?
De lijn blijft als grijze inkt op het canvas. Kan niets in de schets worden gelezen, dan toont MolDraw een korte melding. Verwijder de inkt en teken opnieuw, of gebruik de gewone tools.