Превращайте рисунки от руки в химические структуры со Smart Draw
Коротко: установите Smart Draw в Settings › Plugins и выберите инструмент Smart Draw на левой панели инструментов. Набросайте связи, циклы и буквы стилусом, пальцем или мышью, затем нажмите Convert или Enter. MolDraw превратит штрихи в аккуратную структуру, которую можно редактировать и экспортировать, как любой другой рисунок. Распознавание выполняется в браузере.
Зачем рисовать, а не щёлкать?
Химики учатся рисовать структуры от руки. На бумаге скелетная формула пишется быстро: каждый угол и конец линии — атом углерода, атомы водорода при углероде подразумеваются, а буквой обозначаются только гетероатомы. Большинство редакторов структур заставляют переводить эту привычку в выбор инструментов и щелчки.
На планшете или интерактивной доске такой перевод медленный. Для одной молекулы приходится много раз переключаться между инструментом связей, инструментом циклов и меню атомов. Smart Draw позволяет рисовать так, как на бумаге. Он читает каждый штрих как связь, цикл или букву и строит структуру за вас.
Результат — не картинка вашего почерка. Это обычная молекула MolDraw с атомами и связями, поэтому её можно выровнять, получить название, скопировать SMILES или проанализировать другими плагинами.
Что распознаёт Smart Draw
| Прямой штрих | Одинарная связь. |
|---|---|
| Зигзагообразная линия | Цепь, по одной связи между каждой парой углов. |
| Два параллельных штриха | Двойная связь. |
| Замкнутая фигура | Цикл с тем же числом сторон, от 3 до 8. |
| Кружок внутри цикла | Отмечает пяти- или шестичленный цикл как ароматический. |
| Буквы | Метки атомов, например N, O, S или Cl. Буквы, написанные рядом, например OH, читаются вместе. |
| + или − | Положительный или отрицательный заряд на ближайшем атоме. |
Штрихи, заканчивающиеся рядом с атомом, который уже есть на холсте, присоединяются к нему, поэтому можно достраивать структуру, нарисованную обычными инструментами.
Как установить Smart Draw
- Откройте редактор MolDraw и войдите в систему. Достаточно бесплатной учётной записи.
- Нажмите Settings (шестерёнка), затем Plugins.
- Нажмите Install рядом со Smart Draw. На левой панели инструментов появится инструмент Smart Draw.
Как набросать структуру
- Выберите инструмент Smart Draw на левой панели инструментов.
- Нарисуйте цикл одним непрерывным штрихом, например шестиугольник для циклогексана. Для конденсированных циклов или точного бензола лучше ставить шаблоны циклов инструментами циклов.
- Добавляйте заместители прямыми штрихами от угла цикла. Для длинной цепи нарисуйте зигзаг.
- Для двойной связи нарисуйте вторую линию примерно той же длины близко и параллельно первой.
- Напишите букву на конце связи, чтобы сделать его гетероатомом, например O для спирта.
- Проверьте предпросмотр. Панель Smart Draw показывает, что прочитал MolDraw, например «3 bonds · N», и ничего не меняется до преобразования, так что можно делать паузы сколько угодно. Чтобы исправить ошибку, используйте Undo stroke (Ctrl+Z) или Clear (Esc).
- Нажмите Convert или Enter. Штрихи станут структурой, а MolDraw выровняет новую часть рисунка. Если удобнее преобразовывать автоматически, включите на панели Auto — преобразование будет происходить после паузы в 2,5 секунды.
- Переключитесь на обычные инструменты, чтобы добавить клинья, изменить связи или исправить то, что получилось неправильно.
Как использовать плагин на занятиях и в лаборатории
- Лекции на сенсорном экране: рисуйте молекулу вживую по ходу рассказа и сразу показывайте её аккуратную структуру и название.
- Практика студентов: студенты рисуют по памяти, как на экзамене, и получают настоящую структуру, которую можно проверить.
- Быстрые заметки в лаборатории: набросайте структуру стилусом на планшете и скопируйте её SMILES в лабораторный журнал.
- Дальше: проверьте формулу с помощью инструмента «SMILES в формулу» или освойте способ с щелчками в статье как нарисовать бензол, циклогексан и конденсированные кольца.
Советы и ограничения
- Замыкайте каждый цикл одним штрихом и делайте углы чёткими, чтобы число сторон читалось правильно.
- Рисуйте связи достаточно прямыми и примерно одной длины.
- Ароматическое кольцо рисуйте шестиугольником с кружком внутри.
- На iPad используйте Apple Pencil и включите параметры сенсорного экрана в Settings › Touch screen.
Smart Draw читает фигуры, а не химию. Он не рисует клиновидные и штриховые связи, поэтому стереохимию добавляйте потом обычными инструментами связей. Для букв важен аккуратный почерк, а сложные метки могут потребовать обычного инструмента атомов. Всегда проверяйте результат, прежде чем на него полагаться: цикл с лишним изгибом или неверно прочитанная буква меняют молекулу.
Smart Draw работает офлайн, потому что распознавание выполняется локально. Ваш набросок не отправляется на сервер.
Вопросы и ответы
Работает ли Smart Draw офлайн?
Да. Распознавание штрихов выполняется в браузере, и ваш набросок не отправляется на сервер.
Можно ли пользоваться им на телефоне или планшете?
Да. Рисовать можно пальцем, стилусом или мышью. Самые чистые штрихи даёт стилус.
Что распознаёт Smart Draw?
Одинарные связи, зигзагообразные цепи, двойные связи в виде двух параллельных линий, циклы из 3–8 атомов, ароматические кольца, отмеченные кружком, соединения с атомами, уже находящимися на холсте, простые метки атомов и заряды «плюс» или «минус».
Что будет, если штрих не распознан?
Штрих остаётся на холсте серыми «чернилами». Если в наброске ничего не удаётся прочитать, MolDraw покажет короткое сообщение. Удалите чернила и нарисуйте заново или воспользуйтесь обычными инструментами.