ดู อินทิเกรต และจัดสเปกตรัม NMR ให้สะอาดในเบราว์เซอร์
คำตอบสั้น ๆ: เปิดโปรแกรมดู NMR ของ MolDrawที่ใช้ฟรี แล้ววางไฟล์ 1H หรือ 13C แบบ JCAMP-DX, CSV/TXT หรือ Bruker คุณซูม เลือกพีก อินทิเกรต อ้างอิงสเกลเคมิคัลชิฟต์กับตัวทำละลาย หาพีกของตัวทำละลายและจาระบีที่พบบ่อย และส่งออกไฟล์ PNG, CSV หรือ JCAMP-DX ได้ ไฟล์ถูกอ่านในเบราว์เซอร์และไม่ถูกอัปโหลด
ลองใช้โปรแกรมดู NMR ที่นี่
ทำไมต้องใช้โปรแกรมดู NMR บนเบราว์เซอร์
ข้อมูล NMR ส่วนใหญ่ประมวลผลด้วยซอฟต์แวร์ที่มีไลเซนส์บนคอมพิวเตอร์ของสเปกโทรมิเตอร์ ซึ่งไม่สะดวกเมื่อต้องการตรวจสเปกตรัมที่บ้านหรือบนแล็ปท็อปที่ไม่มีไลเซนส์
โปรแกรมดูบนเบราว์เซอร์เติมช่องว่างนั้น เปิดไฟล์ที่ส่งออกมา อ่านเคมิคัลชิฟต์ ตรวจอินทิกรัล และดูว่าพีก "ส่วนเกิน" เป็นแค่เอทิลแอซีเตตหรือจาระบีหรือไม่ แล้วบันทึกภาพที่สะอาดสำหรับรายงานการทดลอง
สเปกตรัม 1H หรือ 13C บอกอะไร
เคมิคัลชิฟต์ (δ, ppm) แสดงสภาพแวดล้อมทางอิเล็กตรอนของนิวเคลียส โปรตอนแอโรมาติกอยู่ใกล้ 7–8 ppm โปรตอนที่อยู่ติดออกซิเจนใกล้ 3.5–4.5 ppm และโปรตอนแอลคิลต่ำกว่าประมาณ 2 ppm เพราะ ppm เป็นอัตราส่วน สารเดียวกันจึงให้เคมิคัลชิฟต์เท่ากันบนแม่เหล็ก 60 MHz หรือ 600 MHz
การแยกสัญญาณเกิดจากการคู่ควบกับโปรตอนใกล้เคียงและวัดเป็น Hz CH2 ที่อยู่ติด CH3 จะแสดงเป็นควอร์เท็ต ความกว้างเป็น Hz ของมัลติเพล็ตไม่เปลี่ยนตามความแรงสนาม จึงครอบคลุม ppm มากขึ้นบนแม่เหล็กตั้งโต๊ะสนามต่ำ
การอินทิเกรตคือพื้นที่ใต้สัญญาณ 1H ซึ่งแปรผันตามจำนวนโปรตอน อัตราส่วนจึงบอกได้ เช่น สัญญาณหนึ่งเป็น 2H และอีกสัญญาณเป็น 3H ในสเปกตรัม 13C ทั่วไป พื้นที่ไม่น่าเชื่อถือ
การอ้างอิงกำหนดจุดศูนย์ของสเกล TMS ตั้งเป็น 0 ppm คนส่วนใหญ่ใช้พีกของตัวทำละลายที่หลงเหลือแทน เช่น CHCl3 ที่ 7.26 ppm ใน CDCl3 หรือ DMSO-d5 ที่ 2.50 ppm ใน DMSO-d6 สเกลที่อ้างอิงผิดอาจนำไปสู่การระบุสัญญาณที่ผิด
เปิดไฟล์ใดได้บ้าง
| JCAMP-DX | ไฟล์ .jdx, .dx หรือ .jcamp รวมถึงข้อมูลที่บีบอัด (ASDF) ซอฟต์แวร์ NMR ส่วนใหญ่ส่งออกรูปแบบนี้ได้ |
|---|---|
| CSV หรือ TXT | สองคอลัมน์: ppm และความเข้ม |
| Bruker | ข้อมูลที่ประมวลผลแล้ว: ไฟล์ zip ของโฟลเดอร์การทดลอง หรือไฟล์ 1r และ procs ที่เลือกพร้อมกัน |
ถ้าไฟล์มีความถี่ของสเปกโทรมิเตอร์ โปรแกรมดูจะใช้ค่านั้น ถ้าไม่มี ให้ตั้งค่าใต้ สเปกโทรมิเตอร์
วิธีวิเคราะห์สเปกตรัม
- กด เปิดไฟล์สเปกตรัม หรือวางไฟล์ลงในกล่อง หากต้องการฝึกก่อน ให้กด เอทิลเบนโซเอตใน CDCl3
- ตั้งความแรงสนามใต้ สเปกโทรมิเตอร์ ด้วยปุ่ม 60 ถึง 800 MHz หากไฟล์ไม่มีค่านี้ ตารางพีกจะให้ค่า Hz ที่ถูกต้อง
- ใต้ การอ้างอิง (การสอบเทียบค่าการเลื่อน) เลือกตัวทำละลายในกล่องสิ่งเจือปนแล้วกด อ้างอิงกับตัวทำละลาย ถ้าใช้ TMS ให้กด TMS = 0 ppm หากต้องการตั้งพีกใดเอง ให้พิมพ์ใน พีกที่ และ ควรเป็น แล้วกด ใช้
- ซูมเข้าแต่ละช่วง ใช้แถบเลื่อน เกณฑ์ หรือ เลือกในมุมมอง เพื่อจัดรายการพีกให้เรียบร้อย
- เลือก อินทิเกรต แล้วลากผ่านสัญญาณที่คุณรู้จัก เช่น ทริปเล็ตของ CH3 พิมพ์ 3 ใน อินทิกรัลแรก = อินทิเกรตสัญญาณอื่นแล้วอ่านพื้นที่
- กด หาสิ่งเจือปน เปรียบเทียบผลที่พบกับพีกของคุณก่อนลบสิ่งใด
- ส่งออกด้วยปุ่ม ส่งออก PNG, ส่งออก CSV หรือ ส่งออก JCAMP-DX
โปรแกรมดูทำอะไรได้บ้าง
| มุมมอง | ซูม เลื่อน + และ − Y+ และ Y− สำหรับความสูงพีก และรีเซ็ตมุมมอง การเลื่อนล้อเมาส์และการถ่างนิ้วก็ซูมได้ |
|---|---|
| พีก | การเลือกพีกอัตโนมัติด้วยเกณฑ์ เลือกพีกเพื่อเพิ่มด้วยการคลิก และตารางของ δ ppm, Hz และความสูง |
| อินทิกรัล | ลากเพื่ออินทิเกรต พื้นที่จะปรับสเกลตามอินทิกรัลแรก |
| การอ้างอิง | อ้างอิงกับตัวทำละลาย, TMS = 0 ppm หรือคลิก อ้างอิงค่า แล้วเลือกพีก |
| สิ่งเจือปน | จับคู่พีกกับตารางสิ่งเจือปนปริมาณน้อยของ Fulmer et al. (2010) สำหรับตัวทำละลายดิวเทอเรต 12 ชนิด แสดงรายการที่น่าจะตรงและตรงบางส่วนพร้อมสัญญาณที่คาดไว้ |
| ภาพที่ทำความสะอาด | Remove, Remove all likely, Undo, Restore all และแสดงต้นฉบับ กราฟจะถูกทำเครื่องหมายว่า Edited for display |
| ส่งออก | PNG, CSV และ JCAMP-DX ของสิ่งที่อยู่บนหน้าจอ |
วิธีใช้งานในชั้นเรียนและในห้องปฏิบัติการ
- ห้องปฏิบัติการเพื่อการสอน: ให้ไฟล์ JCAMP-DX ของผลิตภัณฑ์แก่นักศึกษา ให้อ้างอิง อินทิเกรต และรายงานเคมิคัลชิฟต์และจำนวนโปรตอนพร้อมภาพประกอบ
- สาธิตความแรงสนาม: โหลด เอทิลเบนโซเอตใน CDCl3 แล้วตามด้วย เครื่องตั้งโต๊ะ 80 MHz มัลติเพล็ตเดียวกันจะเบียดกันที่สนามต่ำ
- ตรวจความบริสุทธิ์: ก่อนส่งสาร ให้รัน หาสิ่งเจือปน เพื่อระบุพีกเล็ก ๆ จากตัวทำละลายในขั้นทำงานต่อ น้ำ หรือจาระบี
- ตรวจผลทำนาย: เปรียบเทียบพีกของคุณกับสเปกตรัมที่ทำนายจากเครื่องมือทำนาย SMILES เป็น NMR สำหรับ 13C และการทดลอง 2D ให้ทำนายสเปกตรัม COSY, HSQC และ HMBC ด้วยปลั๊กอิน NMR Analyser
เคล็ดลับและข้อจำกัด
- อ้างอิงก่อนรัน หาสิ่งเจือปน การจับคู่ใช้หน้าต่าง ppm แคบ สเกลที่เลื่อนไปจึงให้ผลไม่ดี
- การจับคู่หมายความเพียงว่ามีพีกอยู่ตรงตำแหน่งที่คาดว่าจะมีสิ่งเจือปน ให้ตรวจว่ามีสัญญาณครบทุกสัญญาณและมัลติเพล็ตดูถูกต้อง
- เคมิคัลชิฟต์ของสิ่งเจือปนเลื่อนเล็กน้อยตามความเข้มข้นและอุณหภูมิ ขยายช่อง ± ppm อย่างระมัดระวัง เพราะผลที่ผิดจะเพิ่มขึ้น
- โปรแกรมดูแสดงสเปกตรัม 1D ไม่มีการแปลงฟูริเยร์หรือการแก้เฟส จึงต้องประมวลผล FID ก่อน
- ถ้าเบราว์เซอร์แตกไฟล์โฟลเดอร์ Bruker ไม่ได้ ให้แตกไฟล์เองแล้วเลือกไฟล์
1rและprocsพร้อมกัน - การลบพีกเป็นการแก้ไขการแสดงผล ให้เก็บไฟล์ต้นฉบับไว้เป็นข้อมูล
เพิ่งเริ่มเรียน NMR? คู่มือวิธีอ่านสเปกตรัม NMRของเราอธิบายเคมิคัลชิฟต์ การแยกสัญญาณ และอินทิกรัลทีละขั้น
คำถามและคำตอบ
เปิดสเปกตรัม 13C ได้ด้วยนอกจาก 1H ไหม
ได้ โปรแกรมดูอ่านชนิดนิวเคลียสจากไฟล์ ถ้าไฟล์ไม่ระบุ จะเดาจากช่วง ppm ตารางสิ่งเจือปนมีค่าเคมิคัลชิฟต์ทั้ง 1H และ 13C
ทำไมอินทิกรัล 13C ไม่ตรงกับจำนวนคาร์บอน
สเปกตรัม 13C ทั่วไปบันทึกแบบ proton decoupling คาร์บอนผ่อนคลายด้วยอัตราต่างกันและได้การเสริมจาก NOE ต่างกัน คาร์บอนจตุรภูมิจึงมักดูเล็ก เชื่อถืออินทิกรัล 13C ได้เฉพาะจากสเปกตรัมที่วัดภายใต้สภาวะเชิงปริมาณ
ประมวลผล FID ดิบในโปรแกรมดูได้ไหม
ไม่ได้ โปรแกรมดูเปิดสเปกตรัมที่ประมวลผลแล้ว: JCAMP-DX, CSV หรือ TXT สองคอลัมน์ และข้อมูลที่ประมวลผลแล้วของ Bruker (ไฟล์ 1r และ procs) ให้ทำการแปลงฟูริเยร์และปรับเฟสในซอฟต์แวร์ของสเปกโทรมิเตอร์ก่อน
ควรซ่อนพีกสิ่งเจือปนก่อนใส่สเปกตรัมในวิทยานิพนธ์หรือไม่
เก็บสเปกตรัมต้นฉบับไว้เป็นข้อมูล และรายงานสิ่งเจือปนที่พบ กราฟที่ทำความสะอาดแล้วเป็นเพียงการแก้ไขการแสดงผล โปรแกรมดูจะติดป้ายว่าแก้ไขแล้ว และคุณควรระบุในคำบรรยายภาพหากนำไปใช้