Konwerter XYZ / Gaussian na strukturę 2D

W skrócie: Wklej lub prześlij plik XYZ, Gaussian .gjf, .com albo tekst ze współrzędnymi i wygeneruj edytowalną kanwę ze strukturą cząsteczki 2D z odtworzonymi wiązaniami. Jest darmowy, działa w przeglądarce i nie wymaga pobierania.

Wklej lub prześlij plik XYZ, plik wejściowy Gaussian lub tekst ze współrzędnymi kartezjańskimi i wygeneruj edytowalną kanwę struktury 2D z odtworzonymi wiązaniami.

Szybka odpowiedź: to narzędzie odczytuje współrzędne atomów, odtwarza prawdopodobne wiązania na podstawie promieni kowalencyjnych, rzutuje geometrię 3D na 2D, wczytuje wynik do osadzonego edytora i eksportuje SVG, PNG lub odtworzony plik MOL.

Współrzędne wejściowe

Gotowe. Wklej współrzędne i konwertuj.

Edytowalna struktura 2D

Wczytywanie edytora...
Statyczny podgląd SVG odtworzonej struktury
Tu pojawi się podgląd struktury 2D.

Wywnioskowany blok MOL

MOL output appears here.

Formaty plików w skrócie

XYZ przechowuje symbole atomów i współrzędne 3D, zwykle bez rzędów wiązań, ładunków, aromatyczności i stereochemii. Jest popularny w chemii obliczeniowej i kwantowej.

Pliki wejściowe Gaussian, takie jak .gjf i .com, często zawierają wiersz ładunku/multipletowości, po którym następują współrzędne kartezjańskie. Narzędzie w miarę możliwości wyodrębnia te bloki współrzędnych.

Ponieważ pliki współrzędnych XYZ i Gaussian zwykle nie przechowują rzędów wiązań, wynik jest przybliżoną strukturą 2D. Popraw odtworzone wiązania na osadzonej kanwie 2D przed publikacją, dokowaniem lub dalszą analizą chemoinformatyczną.

Ostatnia aktualizacja: