Chuyển XYZ / Gaussian sang cấu trúc 2D

Tóm tắt: Dán hoặc tải lên XYZ, Gaussian .gjf, .com hoặc văn bản tọa độ và tạo canvas cấu trúc phân tử 2D có thể chỉnh sửa với liên kết được suy ra. Miễn phí, chạy trên trình duyệt web và không cần tải xuống.

Dán hoặc tải lên XYZ, input Gaussian hoặc văn bản tọa độ Descartes và tạo canvas cấu trúc 2D có thể chỉnh sửa với liên kết được suy ra.

Trả lời nhanh: công cụ đọc tọa độ nguyên tử, suy ra các liên kết khả dĩ từ bán kính cộng hóa trị, chiếu hình học 3D xuống 2D, nạp kết quả vào trình soạn thảo nhúng, và xuất SVG, PNG hoặc tệp MOL suy ra.

Tọa độ đầu vào

Sẵn sàng. Dán tọa độ và chuyển đổi.

Cấu trúc 2D có thể chỉnh sửa

Đang tải trình soạn thảo...
Xem trước SVG suy ra (tĩnh)
Bản xem trước cấu trúc 2D hiển thị ở đây.

Khối MOL suy ra

MOL output appears here.

Giải thích định dạng tệp

XYZ lưu ký hiệu nguyên tử và tọa độ 3D, thường không có bậc liên kết, điện tích, tính thơm hay lập thể. Định dạng này phổ biến trong hóa tính toán và hóa lượng tử.

Tệp input Gaussian như .gjf và .com thường có một dòng điện tích/độ bội theo sau là tọa độ Descartes. Công cụ này trích các khối tọa độ đó khi có thể.

Vì tệp tọa độ XYZ và Gaussian thường không lưu bậc liên kết, đầu ra là cấu trúc 2D gần đúng nhất. Hãy dùng canvas 2D nhúng để sửa các liên kết suy ra trước khi công bố, docking hoặc xử lý tin học hóa học tiếp theo.

Cập nhật lần cuối: