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Visualiseur de spectres de masse gratuit
En bref : ouvrez des fichiers JCAMP-DX, CSV, mzML ou mzXML, annotez les pics, superposez le massif isotopique d'une formule, d'un SMILES ou d'un peptide, vérifiez les adduits, l'erreur en ppm et les pertes neutres, et exportez en PNG ou CSV. C'est gratuit, cela fonctionne dans votre navigateur et ne nécessite aucun téléchargement.
Ouvrez un spectre de masse, annotez les pics et comparez-le au massif isotopique de votre formule, de votre SMILES ou de votre peptide. Vérifiez les adduits, l'erreur en ppm et les pertes neutres. Vos fichiers restent sur votre appareil.
ou déposez-le ici. JCAMP-DX (.jdx, .dx), CSV/TXT (m/z, intensité), mzML ou mzXML (premier spectre).
Les exemples sont simulés et librement réutilisables. Télécharger le fichier .jdx d'exemple.
Pics principaux
Touchez une ligne pour l'utiliser comme m/z mesuré.
Pertes neutres
Erreur en ppm
Adduits courants
Formule, SMILES ou peptide
Comment utiliser le visualiseur de spectres de masse
- Ouvrez votre fichier, ou appuyez sur un bouton d'exemple.
- Choisissez Bâtons ou Profil, zoomez sur la zone voulue et cochez Pic de base = 100 % pour normaliser.
- Saisissez une formule, un SMILES ou un peptide et choisissez l'ion, par exemple [M+H]+. Les bâtons rouges montrent le massif isotopique théorique.
- Touchez le pic mesuré pour obtenir l'erreur en ppm. Le tableau des adduits indique quels ions courants sont présents.
- Lisez les annotations de pertes neutres entre les pics principaux.
- Exportez un PNG ou un CSV.
Lire un spectre de masse
Chaque pic est un ion à son rapport m/z (masse divisée par la charge). Le pic le plus intense est le pic de base, fixé à 100 %. En IE, l'ion moléculaire M+• est souvent faible et ce sont les fragments qui renseignent. En ESI, on observe surtout [M+H]+, [M+Na]+ ou [M-H]-, et les grosses molécules comme les peptides montrent aussi des ions 2+ et 3+, avec des pics isotopiques espacés de 0,5 ou 0,33.
Isotopes : le carbone 13 ajoute un pic à M+1, d'environ 1,1 % par carbone. Le chlore et le brome ajoutent des pics intenses à M+2. Les pertes neutres comme −18 (H2O), −28 (CO), −44 (CO2) ou −35 (Cl) entre les pics indiquent quels groupes se détachent.
Questions fréquentes
Mes données sont-elles envoyées ?
Non. Les fichiers sont lus et tracés uniquement dans votre navigateur.
Quels fichiers puis-je ouvrir ?
Spectres de masse JCAMP-DX (tables de pics et données continues), CSV ou TXT avec des colonnes m/z et intensité, ainsi que mzML ou mzXML. Pour mzML et mzXML, le premier spectre est affiché. Les tableaux compressés (zlib) fonctionnent dans les navigateurs actuels.
Quelle différence entre masse monoisotopique, masse moyenne et masse exacte ?
La masse monoisotopique utilise l'isotope le plus abondant de chaque élément (12C, 1H, 35Cl). La masse moyenne utilise les abondances naturelles : c'est celle que l'on pèse sur une balance. Le m/z exact est la masse monoisotopique de l'ion observé, en tenant compte des atomes ajoutés ou retirés et de la masse de l'électron.
Comment repérer le chlore ou le brome ?
Saisissez la formule et observez le massif. Un Cl donne un pic M+2 d'environ un tiers de M (3:1). Un Br donne M et M+2 à peu près égaux (1:1). Deux Br donnent 1:2:1. Les bâtons rouges superposent la théorie à vos données.
Comment l'erreur en ppm est-elle calculée ?
ppm = (mesuré − théorique) / théorique × 1 000 000. Touchez un pic pour l'utiliser comme valeur mesurée. Pour des données haute résolution, un écart inférieur à environ 5 ppm est une bonne correspondance.
Que sont les annotations de pertes neutres ?
L'outil examine les écarts entre les pics principaux et nomme les petites pertes neutres courantes comme H2O, NH3, CO, CO2, CH3, HCl, Cl et Br. Les pics isotopiques sont ignorés. À résolution unitaire, CO et C2H4 se confondent : les deux peuvent donc être proposés.
D'où viennent les données isotopiques ?
Les masses isotopiques et les abondances naturelles sont des valeurs de référence publiques de l'IUPAC (CIAAW) et du NIST. Le massif est calculé en combinant les isotopes de chaque atome.
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