MolDraw › Scheikundetools › Massaspectrumviewer
Gratis massaspectrumviewer
Kort gezegd: Open JCAMP-DX-, CSV-, mzML- of mzXML-bestanden, label pieken, leg het isotooppatroon van een formule, SMILES of peptide eroverheen, controleer adducten, ppm-fout en neutrale verliezen, en exporteer als PNG of CSV. Gratis, werkt in je webbrowser en zonder download.
Open een massaspectrum, label de pieken en vergelijk het met het isotooppatroon van je formule, SMILES of peptide. Controleer adducten, ppm-fout en neutrale verliezen. Je bestanden blijven op je apparaat.
of sleep het hierheen. JCAMP-DX (.jdx, .dx), CSV/TXT (m/z, intensiteit), mzML of mzXML (eerste spectrum).
De voorbeelden zijn gesimuleerd en vrij te hergebruiken. Download het voorbeeld-.jdx-bestand.
Hoofdpieken
Tik op een rij om die als gemeten m/z te gebruiken.
Neutrale verliezen
ppm-fout
Gangbare adducten
Formule, SMILES of peptide
Zo gebruik je de massaspectrumviewer
- Open je bestand of druk op een voorbeeldknop.
- Kies Staafjes of Profiel, zoom in op het gebied dat je wilt en vink Basispiek = 100% aan om te normaliseren.
- Typ een formule, SMILES of peptide en kies het ion, zoals [M+H]+. De rode staafjes tonen het theoretische isotooppatroon.
- Tik op de gemeten piek om de ppm-fout te krijgen. De adducttabel laat zien welke gangbare ionen aanwezig zijn.
- Lees de labels voor neutrale verliezen tussen de hoofdpieken.
- Exporteer een PNG of CSV.
Een massaspectrum lezen
Elke piek is een ion bij zijn m/z (massa gedeeld door lading). De hoogste piek is de basispiek en wordt op 100% gezet. In EI-spectra is het molecuulion M+• vaak klein en vertellen de fragmenten het verhaal. In ESI zie je vooral [M+H]+, [M+Na]+ of [M-H]-, en grote moleculen zoals peptiden tonen ook 2+- en 3+-ionen, met isotooppieken op 0,5 of 0,33 van elkaar.
Isotopen: koolstof-13 geeft een piek 1 boven M, ongeveer 1,1% per koolstofatoom. Chloor en broom geven sterke pieken 2 boven M. Neutrale verliezen zoals −18 (H2O), −28 (CO), −44 (CO2) of −35 (Cl) tussen pieken laten zien welke groepen afsplitsen.
Veelgestelde vragen
Worden mijn gegevens geüpload?
Nee. Bestanden worden alleen in je browser gelezen en getekend.
Welke bestanden kan ik openen?
JCAMP-DX-massaspectra (piektabellen en continue gegevens), CSV of TXT met kolommen voor m/z en intensiteit, en mzML of mzXML. Bij mzML en mzXML wordt het eerste spectrum getoond. Gecomprimeerde (zlib-)arrays werken in actuele browsers.
Wat is het verschil tussen monoisotopische, gemiddelde en exacte massa?
De monoisotopische massa gebruikt het meest voorkomende isotoop van elk element (12C, 1H, 35Cl). De gemiddelde massa gebruikt de natuurlijke abundanties en is wat je op een balans weegt. De exacte m/z is de monoisotopische massa van het ion dat je ziet, met de toegevoegde of verwijderde atomen en de elektronmassa.
Hoe controleer ik op chloor of broom?
Vul de formule in en bekijk het patroon. Eén Cl geeft een M+2-piek van ongeveer een derde van M (3:1). Eén Br geeft M en M+2 ongeveer even hoog (1:1). Twee Br geven 1:2:1. De rode staafjes tonen de theorie over je gegevens.
Hoe wordt de ppm-fout berekend?
ppm = (gemeten − theoretisch) / theoretisch × 1 000 000. Tik op een piek om die als gemeten waarde te gebruiken. Bij gegevens met hoge resolutie is binnen ongeveer 5 ppm een goede overeenkomst.
Wat zijn de labels voor neutrale verliezen?
De tool bekijkt de afstanden tussen de hoofdpieken en benoemt gangbare kleine neutrale verliezen zoals H2O, NH3, CO, CO2, CH3, HCl, Cl en Br. Isotooppieken worden overgeslagen. Bij eenheidsresolutie zien CO en C2H4 er hetzelfde uit, dus kunnen ze allebei worden vermeld.
Waar komen de isotoopgegevens vandaan?
Isotoopmassa's en natuurlijke abundanties zijn openbare referentiewaarden van IUPAC (CIAAW) en NIST. Het patroon wordt berekend door de isotopen van elk atoom te combineren.
Laatst bijgewerkt: