MOL-naar-SMILES-converter
Kort gezegd: Plak MOL/SDF-inhoud en zet die online om in SMILES. Gratis, werkt in je webbrowser en zonder download.
Plak, upload of importeer een MOL/SDF-blok uit PubChem en zet het daarna om in SMILES. Deze tool probeert eerst de omzetting via PubChem en valt indien mogelijk terug op NCI Cactus.
Plak MOL/SDF-inhoud, upload een bestand of importeer een 2D-SDF-record uit PubChem (zoek op Engelse naam of CID).
Invoer- en uitvoerformaten
| Invoer: MOL-bestand | Uitvoer: SMILES | |
|---|---|---|
| Volledige naam | MOL-bestand (MDL Molfile) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Wat het bevat | Een atoomlijst met 2D- of 3D-coördinaten en een bindingstabel voor één molecuul. | Atomen, bindingen, ringen, ladingen en stereo als één regel tekst. Geen coördinaten. |
| Bestand of vorm | .mol | .smi of platte tekst |
Bestandsformaat uitgelegd
MOL- en SDF-bestanden slaan atoom- en bindingsblokken op, vaak met 2D- of 3D-coördinaten. Ze zijn handig om bewerkbare structuren uit te wisselen en stofgegevens vast te leggen.
SMILES zet die structuur om in een compacte tekstnotatie van één regel. Handig om te zoeken en voor identificaties, scripts en webtools.
Controleer bij het omzetten van MOL of SDF naar SMILES de stereochemie, ladingen, zouten en aromaticiteit. Sommige coördinaten of eigenschappen uit het bronbestand blijven in SMILES niet bewaard.
Laatst bijgewerkt: