Chuyển MOL sang InChIKey
Tóm tắt: Chuyển khối cấu trúc MOL hoặc SDF thành mã định danh InChIKey chuẩn. Miễn phí, chạy trên trình duyệt web và không cần tải xuống.
Dán khối MOL hoặc SDF và chuyển thành giá trị InChIKey chuẩn.
Định dạng đầu vào và đầu ra
| Đầu vào: tệp MOL | Đầu ra: InChIKey | |
|---|---|---|
| Tên đầy đủ | Tệp MOL (MDL Molfile) | InChIKey |
| Nội dung lưu trữ | Danh sách nguyên tử với tọa độ 2D hoặc 3D và bảng liên kết cho một phân tử. | Chuỗi băm 27 ký tự của InChI, tạo ra để tìm kiếm trên web và cơ sở dữ liệu. Không thể chuyển ngược thành cấu trúc nếu không có cơ sở dữ liệu tra cứu. |
| Tệp hoặc dạng | .mol | Văn bản dạng XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Giải thích định dạng tệp
MOL là tệp cấu trúc với khối nguyên tử và khối liên kết. Nó có thể giữ tọa độ đã vẽ và cấu trúc phân tử có thể chỉnh sửa.
InChIKey là khóa có độ dài cố định tạo từ InChI. Nó được thiết kế để tra cứu nhanh, đối chiếu cơ sở dữ liệu và phát hiện trùng lặp trong các bộ sưu tập hóa chất.
Dùng MOL khi cần tệp cấu trúc có thể chỉnh sửa. Dùng InChIKey khi cần mã định danh gọn để tìm kiếm hoặc đối chiếu.
Khi nào nên chọn đầu ra InChIKey
Nếu bạn có cấu trúc dạng tệp MOL và muốn tìm nó trên mạng, ghi vào bảng tính, hoặc kiểm tra hai tệp có mô tả cùng một hợp chất không, InChIKey là mã định danh thực tế nhất. Đây là chuỗi có độ dài cố định, nên vừa gọn trong một cột cơ sở dữ liệu và dùng được làm từ khóa tìm kiếm.
Cách sử dụng
- Xuất hoặc mở cấu trúc của bạn dưới dạng tệp .mol.
- Sao chép toàn bộ văn bản, từ dòng tiêu đề đầu tiên đến
M END. - Dán và chuyển đổi, rồi sao chép khóa 27 ký tự.
Ví dụ ứng dụng
- Kiểm tra trùng lặp: tạo khóa cho cả thư mục tệp MOL rồi sắp xếp; khóa giống nhau nghĩa là cấu trúc giống nhau, kể cả khi nguyên tử được đánh số khác.
- Tra cứu tài liệu: tìm khóa trên công cụ tìm kiếm để thấy các mục cơ sở dữ liệu và bài báo nhắc đến hợp chất.
- So sánh lập thể: so sánh khối đầu tiên để xem hai đồng phân lập thể có cùng khung hay không.
Cần cả mã định danh đầy đủ? Dùng MOL sang InChI. Có SMILES thay vì MOL? Dùng SMILES sang InChIKey.
Cập nhật lần cuối: