Chuyển InChIKey sang SMILES
Tóm tắt: Chuyển mã định danh InChIKey sang chuỗi SMILES chuẩn. Miễn phí, chạy trên trình duyệt web và không cần tải xuống.
Chuyển mã định danh InChIKey sang SMILES chuẩn bằng PubChem PUG REST.
Định dạng đầu vào và đầu ra
| Đầu vào: InChIKey | Đầu ra: SMILES | |
|---|---|---|
| Tên đầy đủ | InChIKey | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Nội dung lưu trữ | Chuỗi băm 27 ký tự của InChI, tạo ra để tìm kiếm trên web và cơ sở dữ liệu. Không thể chuyển ngược thành cấu trúc nếu không có cơ sở dữ liệu tra cứu. | Nguyên tử, liên kết, vòng, điện tích và lập thể trên một dòng văn bản. Không có tọa độ. |
| Tệp hoặc dạng | Văn bản dạng XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z | .smi hoặc văn bản thuần |
Giải thích định dạng tệp
InChIKey là mã định danh hóa học dạng băm, gọn, thường dùng để tra cứu cơ sở dữ liệu và tìm kiếm trên web. Bản thân nó không phải ký hiệu cấu trúc có thể chỉnh sửa.
SMILES là chuỗi cấu trúc một dòng có thể chỉnh sửa. Công cụ này dùng InChIKey để tìm bản ghi hợp chất khớp rồi trả về biểu diễn SMILES.
Vì tra cứu InChIKey phụ thuộc vào bản ghi cơ sở dữ liệu, các muối ít gặp, hỗn hợp, đồng phân lập thể hoặc hợp chất không khớp có thể không cho kết quả rõ ràng.
Vì sao tra SMILES từ InChIKey
InChIKey xuất hiện trong nhiều cơ sở dữ liệu, bằng sáng chế và tệp bổ sung vì ngắn và dễ tìm kiếm. Để vẽ hoặc sửa hợp chất, bạn cần một định dạng cấu trúc; SMILES là tiện nhất. Công cụ này tìm bản ghi khớp với khóa và trả về SMILES của nó.
Cách sử dụng
- Dán InChIKey đầy đủ, ví dụ
BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-Ncho aspirin. - Chuyển đổi để nhận SMILES, ở đây là
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O. - Dán SMILES vào MolDraw hoặc SMILES sang cấu trúc để xem.
Hỏi đáp
Vì sao tra cứu đôi khi trống? Khóa phải có trong một cơ sở dữ liệu công khai. Khóa của hợp chất chưa công bố hoặc độc quyền sẽ không tra được. Chữ cái cuối có quan trọng không? Có. Nó ghi trạng thái proton hóa, nên acid trung hòa và dạng đã tách proton có khóa khác nhau. Còn đồng phân lập thể? Các đối quang có chung 14 ký tự đầu nhưng khác ở khối thứ hai, nên hãy dùng khóa đầy đủ để có đúng đồng phân.
Cập nhật lần cuối: