MolDraw対Ketcher：あなたに合う無料の分子エディターは？
KetcherとMolDrawは、どちらもウェブブラウザで動き、どちらも無料です。ただし、解決する課題が違います。Ketcherは、開発者が他のソフトに組み込むオープンソースのエディターです。MolDrawは、化学を描いて学びたい人のための完成したアプリです。
その他の比較：MolDraw対ChemSketch · MolDraw対MarvinSketch · 無料のChemDraw代替ベスト（2026） · ChemDraw対MolDraw。
MolDraw対Ketcher早わかり
| 特徴 | MolDraw | Ketcher |
|---|---|---|
| 開発元 | Scidart Academy | EPAM Systems |
| 料金 | 無料。オプションのProプランあり | 無料、オープンソース |
| ライセンス | 無料で利用可（利用規約を参照） | Apache 2.0 |
| 位置づけ | すぐ使える化学アプリ | ホストまたは組み込んで使うエディターコンポーネント |
| 動作環境 | 最新のブラウザならどれでも。Windowsデスクトップアプリ | ホストすれば、最新のブラウザならどれでも |
| 2D構造式と反応式 | はい | はい |
| ペプチド、DNA、RNA | 配列から構造式へのツール | はい、高分子モード（HELM、FASTA） |
| 巻き矢印による反応機構 | はい、片羽矢印も対応 | 重視していない |
| MOL、SDF、SMILES、InChI | はい | はい |
| CDXML | CDXとCDXMLの読み込みとエクスポート | はい |
| 名前検索 | はい、PubChem経由（オンライン） | 標準エディターにはなし |
| 3D表示 | はい、標準搭載 | 重視していない |
| NMR予測とスペクトルビューア | はい | No |
| 教育用ツール | Teachingメニュー、ルイス表示、レッスン | No |
| ソースコードの変更 | No | はい |
Ketcherの情報は、EPAMのGitHubリポジトリとプロジェクトページで2026年10月に確認したものです。確認できた最新リリースはKetcher 3.18.0（2026年9月）でした。
価格とライセンス
KetcherはApache 2.0ライセンスの無料オープンソースソフトです。コードを読み、改変し、自分の製品に組み込んで配布できます。EPAMはサポート付きの商用提供も行っています。EPAMのIndigoツールキットを使っており、こちらもApache 2.0です。
MolDraw：ブラウザでは無料。描画にアカウントは不要です。MolDraw Pro（月額$12または年額$99、インドでは₹299または₹2,999）では、AIアシスタント、構造式スキャン、クラウド保存、テンプレートや実験器具を含む図のエクスポートが追加されます。MolDrawはオープンソースではありません。ホスト版アプリ、Windowsアプリを使うか、iframeでエディターを埋め込みます。
プラットフォームとセットアップ
Ketcherはブラウザで動きますが、主に部品として使われます。開発者がウェブサイト、電子実験ノート、データベース検索ページに組み込みます。Indigoを内蔵したスタンドアロンモードでも、重い処理にIndigoサーバーを使うリモートモードでも動かせます。多くの学生は、Ketcher単体のページではなく、別のアプリの中でKetcherに出会います。
MolDrawはmoldraw.comにある完成したアプリです。開いてすぐ描けます。無料のWindowsアプリならオフラインでも使えます。
描画機能
Ketcherはすっきりした正確な2Dエディターです。原子、結合、環、立体化学、Rグループ、Sグループ、反応を扱えます。最近のリリースは高分子に力を入れており、ペプチド、核酸、HELM表記に対応しています。
MolDrawは描く人を中心に設計されています。巻き矢印による反応機構、非共有電子対、学術誌スタイルのプリセット、実験用ガラス器具、LaTeX用のchemfig、コマンドパレットを備えています。無料の配列から構造式へのツールで、配列からペプチドやDNAを組み立てることもできます。
ファイル形式：MOL、SDF、CDXML、SMILES、InChI
MolDrawはMOL、SDF、RXN、SMILES、CML、XYZ、ChemDrawのCDX・CDXMLファイルを開けます。ChemDrawファイルの反応矢印、キャプション、括弧は描かれたとおりに保たれます。ダウンロード形式はPNG、JPEG、SVG、PDF、SMILES、MOL、SDF、CDXML、CDX、RXN、InChI、SMARTS、CML、XYZ、LaTeX用のchemfigで、3DパネルからはGLB、OBJ、X3Dも出力できます。詳しくはダウンロードとファイル形式をご覧ください。
KetcherはMolfile、SDF、RDF、SMILES、SMARTS、InChI、CDXMLに対応し、生体分子用にFASTAとHELMも扱えます。どちらのツールもMOL、SDF、SMILESに対応しているので、構造式を両者の間で簡単にやり取りできます。
名前から構造式、構造式から名前
MolDrawでは、検索ボックスに名前またはCAS番号を入力すると、PubChemから構造式が取得されます。逆方向は、分子を選択してInfoをクリックすると、IUPAC名、分子式、分子量、SMILES、InChIが表示されます。名前はPubChemで検索するため、インターネット接続が必要で、既知の化合物で最もうまく機能します。無料の名前から構造式ツールとSMILESからIUPAC名ツールなら、エディターを開かずに同じことができます。
Ketcherの標準エディターは、PubChemで名前を検索しません。開発者がこの機能を追加することはでき、Ketcherを組み込んだアプリの中には対応しているものもあります。
3D表示
MolDrawには、キャンバスの横に3Dビューアがあります。モデルは2Dの描画に追従します。表示スタイルの切り替え、分子表面の表示、結合長と結合角の測定、GLBやOBJモデルのエクスポートができます。Protein ViewerプラグインではIDでPDB構造を読み込めます。
Ketcherはまず2Dエディターです。描画の横に3Dが必要なら、MolDrawなら同じタブで表示できます。
スペクトルとNMR予測
NMR Analyserプラグインは、無料アカウントで1Hと13Cのスペクトル、さらにCOSY、HSQC、HMBCのプロットを予測します。これはモデルによる予測で、測定スペクトルではありません。MolDrawには、手持ちのデータファイル用の無料ビューアもあります：NMR、IR、マススペクトル、UV-Vis、ラマンなど。ファイルはブラウザ内で読み込まれ、アップロードされません。チャットによるマススペクトルとUV-VisスペクトルのAI予測はMolDraw Proの機能です。
Ketcherはスペクトルの予測も表示もしません。あくまでエディターで、実験用のワークスペースではありません。
反応式と反応機構
MolDrawは、試薬と条件を含む反応スキームや、両羽矢印と片羽矢印を使った巻き矢印の反応機構を描けます。化学量論表、自動原子マッピング、既製の反応機構テンプレートもあります。テンプレートと実験器具はキャンバス上で無料で使えます。それらを含む図のエクスポートはProの機能です。
Ketcherは反応スキームを描けて、原子マッピングもできます。ただし、授業向けの巻き矢印の反応機構用には作られていません。
教育での利用
教育用に、MolDrawにはTeachingメニューがあり、Educationalレイアウト、すべての非共有電子対を表示するルイス表示、ツールチップ付きのエラー表示、Free sketch modeを備えています。Learn MolDrawコースには、実際のエディターで動き、学生の描画をチェックする短いレッスンがあります。インターフェースは18言語に対応しています。
Ketcher自体には教育機能がありません。学校が周辺に作り込むことはできますが、開発者の時間が必要です。
オフラインでの利用
ウェブエディターの読み込みには接続が必要です。無料のWindowsアプリ（Windows 10以降）なら、描画、クリーンアップ、エクスポート、3Dをオフラインで使えます。PubChem検索、サインイン、AIチャットにはインターネットが必要です。MacとLinux版はまだ出ていないため、これらのシステムではブラウザ版を使います。
スタンドアロンモードのKetcherは、自分のマシンやネットワークでホストすれば、サーバーなしで動かせます。セルフホストする研究室に向いています。
プライバシー
描画、クリーンアップ、解析、エクスポートはブラウザ内で実行されます。構造式がデバイスの外に出るのは、PubChem検索、IUPAC名の検索、AIチャット、オンラインデータを取得するプラグインを使ったときだけです。デザインはデバイスのブラウザストレージに保存されます。プライバシーと保存場所をご覧ください。未発表の研究では、手で描いてオンライン検索を使わないようにしましょう。
Ketcherではホスティングを自分で管理できます。自分のサーバーで動かせば、構造式はネットワーク内にとどまります。データ管理のルールが厳しい場合、これはKetcherを選ぶ大きな理由になります。
Ketcherを選ぶべき場合
Ketcherが適しているのは、次のような場合です：
- 化学系のウェブサイト、ノートブック、データベースを開発していて、その中にエディターが必要な場合。
- コードを改変して配布できるオープンソースライセンスが必要な場合。
- ペプチド、オリゴヌクレオチド、HELMを多く扱う場合。
- 構造式がネットワークの外に出ないよう、セルフホストする必要がある場合。
描画、名前、3D、スペクトル、教育のための完成した無料アプリが欲しいなら、MolDrawを使いましょう。
FAQ
Ketcherは無料ですか？
はい。KetcherはEPAM Systemsが開発した、Apache 2.0ライセンスの無料オープンソースソフトです。EPAMはサポート付きの商用提供も行っています。
Ketcherの開発元は？
EPAM Systemsです。コードはGitHubのgithub.com/epam/ketcherで公開されています。EPAMのケモインフォマティクスツールキットIndigoを使っています。
MolDrawはKetcherのようにオープンソースですか？
いいえ。MolDrawは無料で使えますが、オープンソースではありません。iframeを使えば、MolDrawエディターを自分のサイトに埋め込めます。
Ketcherは何もインストールせずにオンラインで使えますか？
Ketcherはブラウザで動きますが、誰かがホストする必要があります。多くの場合、別のウェブサイト、ノートブック、データベースの中で使われています。MolDrawはmoldraw.comでホストされているので、そのまま使えます。
学生にはKetcherとMolDrawのどちらが向いていますか？
ほとんどの学生にはMolDrawです。巻き矢印による反応機構、名前検索、3D、NMR予測、教育用ツールがあります。Ketcherは、自分のソフトにエディターを組み込みたい開発者に向いています。
KetcherとMolDrawは同じファイルを開けますか？
はい。どちらもMOL、SDF、SMILESの読み書きができ、CDXMLも扱えます。一方で保存して、もう一方で開けます。
出典
競合製品の情報は、2026年10月にこれらのページで確認しました。製品、価格、ライセンスは変わることがあるので、決める前に開発元のサイトを確認してください。
- GitHub上のEPAM Ketcher（Apache 2.0）
- GitHub上のKetcherリリース
- EPAM Life Sciences：Ketcherプロジェクトページ
- GitHub上のEPAM Indigoツールキット
MolDrawの情報はMolDrawドキュメント、料金ページ、概要ページによるものです。ChemDraw、ChemSketch、Marvin、MarvinSketch、Marvin JS、Ketcherなどの名称は各所有者の商標です。MolDrawはこれらと提携していません。