MolDraw vs Ketcher : quel éditeur de molécules gratuit vous convient ?

MolDraw vs Ketcher en un coup d'œil

Les informations sur Ketcher proviennent du dépôt GitHub et de la page du projet d'EPAM, vérifiés en octobre 2026. Ketcher 3.18.0 était la dernière version trouvée (septembre 2026).

Prix et licence

Ketcher est gratuit et open source sous licence Apache 2.0. Vous pouvez lire le code, le modifier et le distribuer dans votre propre produit. EPAM le propose aussi sur une base commerciale avec assistance. Il utilise la boîte à outils Indigo d'EPAM, elle aussi sous Apache 2.0.

MolDraw : gratuit dans le navigateur. Aucun compte n'est nécessaire pour dessiner. MolDraw Pro (12 $ par mois ou 99 $ par an ; ₹299 ou ₹2 999 en Inde) ajoute l'assistant IA, la numérisation de structures, la sauvegarde dans le cloud et l'export des dessins contenant des modèles ou du matériel de laboratoire. MolDraw n'est pas open source. Vous utilisez l'application hébergée, l'application Windows ou vous intégrez l'éditeur avec un iframe.

Plateformes et installation

Ketcher fonctionne dans le navigateur, mais c'est surtout une brique logicielle. Un développeur l'ajoute à un site web, un cahier de laboratoire ou une page de recherche dans une base de données. Il peut fonctionner en mode autonome, avec Indigo intégré, ou en mode distant avec un serveur Indigo pour les tâches plus lourdes. Beaucoup d'étudiants rencontrent Ketcher dans une autre application plutôt que sur sa propre page.

MolDraw est une application complète sur moldraw.com. Ouvrez-la et dessinez. Une application Windows gratuite permet l'usage hors ligne.

Fonctions de dessin

Ketcher est un éditeur 2D propre et précis. Il gère atomes, liaisons, cycles, stéréochimie, groupes R, groupes S et réactions. Les versions récentes se concentrent sur les macromolécules : peptides, acides nucléiques et notation HELM.

MolDraw est centré sur la personne qui dessine. Il ajoute les mécanismes avec flèches courbes, les doublets non liants, des styles prédéfinis de revues, la verrerie de laboratoire, chemfig pour LaTeX et une palette de commandes. Il construit aussi des peptides et de l'ADN à partir d'une séquence avec l'outil gratuit séquence en structure.

Formats de fichier : MOL, SDF, CDXML, SMILES et InChI

MolDraw ouvre les fichiers MOL, SDF, RXN, SMILES, CML, XYZ ainsi que les CDX et CDXML de ChemDraw. Les fichiers ChemDraw conservent leurs flèches de réaction, légendes et crochets tels que dessinés. Les téléchargements incluent PNG, JPEG, SVG, PDF, SMILES, MOL, SDF, CDXML, CDX, RXN, InChI, SMARTS, CML, XYZ et chemfig pour LaTeX, plus GLB, OBJ et X3D depuis le panneau 3D. Voir téléchargement et formats de fichier.

Ketcher prend en charge Molfile, SDF, RDF, SMILES, SMARTS, InChI et CDXML, ainsi que FASTA et HELM pour les biomolécules. Les deux outils partagent MOL, SDF et SMILES : passer une structure de l'un à l'autre est donc facile.

Nom en structure et structure en nom

Dans MolDraw, saisissez un nom ou un numéro CAS dans le champ de recherche et la structure arrive depuis PubChem. Dans l'autre sens, sélectionnez une molécule et cliquez sur Info pour voir son nom IUPAC, sa formule, sa masse, son SMILES et son InChI. Le nom est recherché dans PubChem : il faut donc une connexion internet, et cela fonctionne mieux pour les composés connus. Les outils gratuits nom en structure et SMILES en nom IUPAC font la même chose sans ouvrir l'éditeur.

L'éditeur standard de Ketcher ne recherche pas de noms dans PubChem. Un développeur peut l'ajouter, et certaines applications qui intègrent Ketcher le font.

Visualisation 3D

MolDraw dispose d'un visualiseur 3D à côté du canevas. Le modèle suit votre dessin 2D. Vous pouvez changer de style, afficher les surfaces moléculaires, mesurer longueurs et angles de liaison, et exporter des modèles GLB ou OBJ. Le plugin Protein Viewer charge les structures PDB par leur identifiant.

Ketcher est avant tout un éditeur 2D. Si vous avez besoin de la 3D à côté du dessin, MolDraw vous l'offre dans le même onglet.

Spectres et prédiction RMN

Le plugin NMR Analyser prédit les spectres ¹H et ¹³C, ainsi que les cartes COSY, HSQC et HMBC, avec un compte gratuit. Ce sont des prédictions de modèle, pas des spectres mesurés. MolDraw propose aussi des visualiseurs gratuits pour vos propres fichiers de données : RMN, IR, spectres de masse, UV-Vis, Raman et plus encore. Les fichiers sont lus dans votre navigateur et ne sont pas envoyés. La prédiction par IA des spectres de masse et UV-Vis via le chat fait partie de MolDraw Pro.

Ketcher ne prédit ni n'affiche de spectres. C'est un éditeur, pas un espace de travail de laboratoire.

Réactions et mécanismes

MolDraw dessine des schémas réactionnels avec réactifs et conditions, et des mécanismes avec flèches courbes à deux électrons et demi-flèches. Il propose aussi un tableau de stœchiométrie, le mappage automatique des atomes et des modèles de mécanismes prêts à l'emploi. Vous pouvez utiliser gratuitement les modèles et le matériel de laboratoire sur le canevas. Exporter un dessin qui en contient fait partie de Pro.

Ketcher dessine des schémas réactionnels et peut mapper les atomes. Il n'est pas conçu pour les mécanismes avec flèches courbes tels qu'on les enseigne.

Usage pédagogique

Pour l'enseignement, MolDraw propose un menu Teaching avec l'Educational layout, une vue de Lewis qui montre chaque doublet non liant, des marques d'erreur avec infobulles et un mode croquis libre. Le cours Learn MolDraw propose de courtes leçons qui s'exécutent dans le véritable éditeur et vérifient le dessin de l'étudiant. L'interface est disponible en 18 langues.

Ketcher n'a pas de fonctions pédagogiques propres. Un établissement pourrait les construire autour, mais cela demande du temps de développement.

Usage hors ligne

L'éditeur web a besoin d'une connexion pour se charger. L'application Windows gratuite (Windows 10 ou ultérieur) fonctionne hors ligne pour le dessin, le nettoyage, l'export et la 3D. La recherche PubChem, la connexion au compte et le chat IA nécessitent internet. Les versions Mac et Linux ne sont pas encore sorties : sur ces systèmes, vous utilisez la version navigateur.

En mode autonome, Ketcher peut fonctionner sans serveur une fois hébergé sur votre propre machine ou réseau. Cela convient aux laboratoires qui s'auto-hébergent.

Confidentialité

Le dessin, le nettoyage, l'analyse et l'export s'exécutent dans votre navigateur. Une structure ne quitte votre appareil que si vous utilisez la recherche PubChem, la recherche du nom IUPAC, le chat IA ou un plugin qui récupère des données en ligne. Les dessins sont enregistrés dans le stockage du navigateur de votre appareil. Voir confidentialité et stockage. Pour un travail non publié, dessinez à la main et évitez les recherches en ligne.

Avec Ketcher, vous maîtrisez l'hébergement. Si vous l'exécutez sur votre propre serveur, les structures restent dans votre réseau. Avec des règles strictes sur les données, c'est une bonne raison de choisir Ketcher.

Quand choisir Ketcher

Ketcher est l'outil qu'il vous faut si :

• Vous créez un site web de chimie, un cahier de laboratoire ou une base de données et avez besoin d'un éditeur intégré.
• Vous avez besoin d'une licence open source qui permet de modifier et de distribuer le code.
• Vous travaillez beaucoup avec des peptides, des oligonucléotides ou HELM.
• Vous devez l'héberger vous-même pour que les structures ne quittent jamais votre réseau.

Si vous voulez une application gratuite et complète pour le dessin, les noms, la 3D, les spectres et l'enseignement, utilisez MolDraw.

Sources

Les informations sur les concurrents ont été vérifiées sur ces pages en octobre 2026. Produits, prix et licences changent : consultez le site de l'éditeur avant de décider.

• EPAM Ketcher sur GitHub (Apache 2.0)
• Versions de Ketcher sur GitHub
• EPAM Life Sciences : page du projet Ketcher
• Boîte à outils EPAM Indigo sur GitHub

Les informations sur MolDraw proviennent de la documentation MolDraw, de la page des tarifs et de la page À propos. ChemDraw, ChemSketch, Marvin, MarvinSketch, Marvin JS, Ketcher et d'autres noms sont des marques de leurs propriétaires. MolDraw n'est pas affilié à eux.