用 NMR 分析器由你的绘图预测 1H、13C 和 2D NMR 谱图
简答:在 Settings › Plugins 中安装 NMR Analyser,画出结构,打开 NMR 标签页,选择 1H、13C、COSY、HSQC 或 HMBC,然后点击 Predict。你会得到带字母标记峰的模拟谱图、包含化学位移、积分、峰形和耦合常数的信号表,以及绘图上的原子高亮。请把它当作归属的参考,而不是实测谱图。
为什么要在归属之前先预测谱图?
归属 NMR 谱图就是把每个信号对应到结构中的原子上。面对一张真实谱图,难点在于不知道从哪里下手。预测谱图为每个信号提供了第一个猜测。
预测还可以帮你检验提出的结构。如果预测谱图与实测谱图相差很大,就需要重新审视结构或归属。学生也可以这样练习:预测、比较,然后解释每一处差异。
各种实验告诉你什么
- 1H NMR:化学位移反映每个质子所处的环境。积分显示有多少个质子产生该信号。裂分模式和耦合常数(J,单位 Hz)告诉你相邻质子的情况。
- 13C NMR:通常每组等价碳给出一个信号,分布的 ppm 范围比 1H 宽得多。这是数碳环境的快速方法。
- COSY:交叉峰把相互耦合的质子联系起来,通常相隔两到三个键。用它可以沿着一串 CH 基团逐个推进。
- HSQC:把每个质子与它所连的碳关联起来(一个键)。
- HMBC:把质子与相隔两到三个键的碳关联起来。它能跨越季碳和杂原子把各个片段连接起来。
常用的思路是:先读 1H 谱,用 HSQC 把每个质子归到它的碳上,用 COSY 建立自旋体系,再用 HMBC 把它们连接起来。刚接触基础知识?请先阅读如何解读 NMR 谱图。
插件显示的内容
| 一维谱图 | 带字母标记峰的 1H 和 13C 谱图。打开 Labels,可以把字母与结构上的原子对应起来。 |
|---|---|
| 信号 | 每个信号的标记、化学位移(ppm)、积分、峰形和耦合常数(Hz)。把鼠标悬停在某一行上,可在画布上高亮对应原子。 |
| 二维谱图 | 以等高线图显示的 COSY、HSQC 和 HMBC。 |
| 谱仪 | 60 至 800 MHz 的预设值,或最高 1200 MHz 的自定义值。 |
| History and Overlay | 每次预测都保存在 History 中。可以用 Overlay 叠加多个一维预测进行比较。 |
| 下载 | 谱图的 PNG 或 SVG,或谱图数据的 CSV。 |
如何安装 NMR 分析器
- 打开 MolDraw 编辑器并登录。免费账户即可。
- 点击 Settings(齿轮图标),然后点击 Plugins。
- 点击 NMR Analyser 旁边的 Install。分析面板中会出现 NMR 标签页。
如何预测并使用谱图
- 画出结构,或用 Paste SMILES 粘贴 SMILES。
- 打开 NMR 标签页并选择实验:1H、13C、COSY、HSQC 或 HMBC。
- 点击 Predict。一维谱图需要几秒钟;二维谱图可能需要更长时间。
- 把 Spectrometer 设置为你所用仪器的场强,这样多重峰的样子会与你的真实数据一致。
- 拖出方框可放大某个 ppm 范围,滚动鼠标可缩放峰高,双击可复原。
- 打开 Labels 和 Signals。把鼠标悬停在某一行上,查看它属于哪些原子。
- 用下载按钮保存谱图或数据。
课堂和实验室中的用法
- 实验报告:预测产物的谱图,然后与实测谱图比较,解释位置发生变化的信号。要处理实测文件,可以在浏览器 NMR 查看器中进行定标、积分和选峰。
- 异构体问题:预测两个候选异构体,叠加它们的 1H 谱图,找出能区分二者的信号。
- 讲解裂分:在 60 MHz 和 600 MHz 之间切换。以 Hz 为单位的同一个 J 在低场下占据更多 ppm,因此多重峰看起来更宽、重叠更多。这解释了为什么台式核磁的谱图看起来很拥挤。
- 二维谱练习:为一个小分子预测 HSQC 和 HMBC,让学生自己把各个片段连接起来。
- 例题讲解:导出 SVG 谱图,用于幻灯片和讲义。
技巧与实际局限
- 预测来自 nmrdb.org:1H 使用 Spinus 模型,13C 使用 nmrshiftdb2 数据(HOSE 码)。需要联网。
- 预测器没有溶剂选项。尤其是 OH 和 NH 的化学位移会随溶剂、浓度和温度变化。
- 在需要的地方画出立体化学。非对映异位质子可能给出不同的预测化学位移。
- 把 R 基团和连接点(*)替换为真实原子。预测器对中性有机分子效果最好,所以请去掉金属和盐。
- 预测只是一种假设。请用自己的数据确认归属,尤其是二维谱图。
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问题与解答
预测的 NMR 谱图有多准确?
对于常见有机分子,它是有用的参考,但不是实测结果。可交换的 OH 和 NH 质子以及不常见的环系偏差可能更大,而且预测器没有溶剂选项。务必用实验谱图确认归属。
NMR 分析器需要账户或联网吗?
都需要。预测时要登录免费的 MolDraw 账户,每次预测都来自在线的 nmrdb.org 服务。已经做过的预测会保留在你设备上的 History 中。
它能预测哪些 2D NMR 实验?
COSY、HSQC 和 HMBC。它们以等高线图显示,你可以在绘图上高亮相关的原子。
可以导出预测的谱图吗?
可以。下载按钮可以把谱图保存为 PNG 或 SVG,或把谱图数据保存为 CSV。