Ketcher 在线分子编辑器指南
Ketcher 是浏览器化学结构编辑领域最知名的名字之一。本指南介绍 Ketcher 是什么、化学结构编辑器应具备哪些功能、哪些文件格式重要，以及如何为课堂、科研或计算化学选择实用的绘图流程。
概述
你来找 Ketcher，多半是想在线快速绘制分子。任务通常很简单：画出结构、修正原子和化学键、复制 SMILES 字符串、导出图片，或者为其他化学工具准备分子。
Ketcher 是什么？
Ketcher 是一款开源化学结构编辑器，用于在网页环境中绘制和编辑分子结构。人们通常在分子绘图器、化学信息学界面、电子实验记录本（ELN）系统、数据库检索表单和化学网页应用的语境下讨论它。
Ketcher 这类编辑器通常侧重精确的 2D 化学绘图，而不是艺术插图。主要目的是绘制有化学意义的结构，并能转换成 SMILES、MOL 或反应格式等机器可读格式。
一手资料请参阅 Ketcher 官方项目页面和 Ketcher GitHub 仓库。
化学工作者为什么使用 Ketcher
- 他们需要一个能在浏览器中运行的免费分子编辑器。
- 他们想画出一个化合物并复制 SMILES 或 MOL 数据。
- 他们需要为有机化学工作绘制反应。
- 他们想把 Ketcher 与 ChemDraw、Marvin 以及更新的浏览器工具进行比较。
- 他们想要一个快速的编辑器，用于教学、作业、实验记录或数据库检索。
在线分子编辑器的工作流程
好的在线分子编辑器应该让用户无需安装桌面软件，就能把粗略的化学构想变成可用的数字结构。典型流程如下：
- 绘制原子、化学键、环、电荷、立体化学和官能团。
- 整理布局，使结构清晰易读。
- 生成或复制 SMILES 或 InChI 等化学标识符。
- 导出图片或化学文件，用于报告、幻灯片、笔记本或下游工具。
- 可选：以 3D 方式查看结构，或运行相关转换器。
Ketcher 这类编辑器的重要功能
2D 结构绘制
原子、单键/双键/三键、环、电荷、芳香结构、模板和立体楔形键，是任何正经分子编辑器的基础。
标识符支持
SMILES、InChI、InChIKey、常用名和 IUPAC 命名流程，把绘图与数据库和计算工具连接起来。
导出格式
实用的编辑器支持图片导出，以及 MOL、SDF、RXN、PDB 等化学格式，有时还支持对接或量子化学文件。
浏览器的便利
在线编辑器的主要优势是快：打开网页、绘图、复制、导出，然后继续工作，无需配置许可证或安装桌面软件。
Ketcher 和在线编辑器常用的格式
只有当结构能以其他工具能理解的格式离开编辑器时，化学绘图才最有用。以下是用户应该了解的常见格式：
| 格式 | 最佳用途 |
|---|---|
| SMILES | 简洁的分子标识符，用于数据库、检索、脚本和快速分享。 |
| MOL / SDF | 包含原子块和键块的结构文件，适用于化学信息学和批处理流程。 |
| RXN | 包含反应物、试剂和产物的反应结构。 |
| SVG / PNG | 用于演示文稿、论文、报告和教学幻灯片的图片。 |
| PDB / PDBQT | 3D 坐标与对接流程，尤其适用于结构生物学和对接准备。 |
Ketcher 替代工具与浏览器绘图选择
在线绘制化学结构并非只有 Ketcher 一种方式。根据任务不同，你还可以使用免费化学绘图软件、ChemDraw 替代品、结构转换器、分子查看器或轻量级浏览器编辑器。
如果你需要一个集成 3D 查看、PubChem 式名称检索、复制/导出选项、分子参考、反应指南和化学转换器的在线结构绘图工作区，MolDraw 会很有用。
如果你需要在自己的网页、课程或应用中放一个绘图框，又不想自己托管编辑器，可以用一个 iframe 嵌入 MolDraw 编辑器。
Ketcher 常见问题
Ketcher 用来做什么？
Ketcher 在基于网页的化学工作流程中用于绘制和编辑化学结构、反应、原子、化学键、立体化学、模板和结构文件。
Ketcher 和 ChemDraw 是一样的吗？
不是。Ketcher 和 ChemDraw 是不同的工具。ChemDraw 是商业桌面套件，而 Ketcher 是用于网页工作流程的开源化学结构编辑器。
不安装软件可以在线绘制分子吗？
可以。MolDraw 等浏览器工具让用户无需安装桌面程序，就能在线绘制分子、查看结构、使用转换器并导出常见化学格式。
如果我现在就需要一个编辑器，该用什么？
如果你眼下的目标是绘制或编辑分子，请打开 MolDraw 编辑器。如果目标是格式转换，请使用 MolDraw 化学工具。