MolDraw › Химические инструменты › Калькулятор изотопного распределения
Калькулятор изотопного распределения (масс-спектрометрия)
Коротко: калькулятор изотопного распределения для масс-спектрометрии: введите молекулярную формулу или SMILES и тип иона и получите все изотопные пики с m/z и относительной интенсивностью, моноизотопную, среднюю и номинальную массу, центроидный или профильный график, эмпирические правила для M+1 и M+2 и сравнение с наблюдаемыми пиками. Бесплатно, работает в браузере и не требует загрузки.
Распределение рассчитывается точно по природным распространённостям изотопов каждого элемента, включая Cl, Br, S, Si и металлы, такие как Fe, Cu, Zn, Se, Sn, Pt, Ru, Pd, Ag и Hg. Для зарядов и аддуктов учитывается масса электрона.
Примеры
Сравнить с наблюдаемым спектром
Список пиков
Как пользоваться калькулятором изотопного распределения
- Введите молекулярную формулу, например
C6H5Br,Pt(NH3)2Cl2илиCuSO4·5H2O, или переключите тип ввода на SMILES. Соблюдайте регистр букв (Cl, а не CL). - Выберите тип иона: M+• для электронной ионизации, [M+H]⁺ или [M+Na]⁺ для положительного электрораспыления, [M−H]⁻ для отрицательного режима. Для заряженного комплекса, например
[Pt(NH3)4]2+, выберите Ion as written (ион как записан). - Посмотрите моноизотопную, среднюю и номинальную массу, затем список пиков с m/z, относительной интенсивностью и % от M.
- Выберите профиль и разрешающую способность, чтобы увидеть, как пики сливаются или расщепляются на вашем приборе.
- Откройте Сравнить с наблюдаемым спектром и вставьте свои пики, чтобы проверить совпадение. Сохраните результат кнопкой Скачать SVG, Скачать PNG или Скачать CSV.
Как рассчитывается изотопное распределение
У большинства элементов больше одного стабильного изотопа. Углерод — это 98,93 % ¹²C и 1,07 % ¹³C; хлор — 75,76 % ³⁵Cl и 24,24 % ³⁷Cl. Поэтому молекула выглядит в масс-спектре как группа пиков — изотопное распределение.
Для одного элемента с распространённостями изотопов a и b n атомов дают члены разложения (a + b)ⁿ. Для всей формулы распределения всех элементов перемножаются. Это свёртка многочленов. Калькулятор выполняет её точно, со всеми изотопами всех элементов, и отбрасывает только члены меньше 10⁻¹² от наибольшего пика.
Cl₂: (0,7576 + 0,2424)² = 0,574 (M) + 0,367 (M+2) + 0,059 (M+4) → 100 : 64 : 10
Три разные массы
- Моноизотопная масса: рассчитывается по самому распространённому изотопу каждого элемента (¹²C, ¹H, ¹⁴N, ¹⁶O, ³⁵Cl, ⁷⁹Br, ⁵⁶Fe, ¹⁹⁵Pt). Кофеин C₈H₁₀N₄O₂ = 194,0804.
- Средняя масса: рассчитывается по стандартным атомным массам, как молярная масса. Кофеин = 194,19 g/mol.
- Номинальная масса: целочисленная масса по самым распространённым изотопам. Кофеин = 194.
Для ионов учитывается масса удалённых или добавленных электронов (по 0,000549 Da), а m/z — это масса, делённая на |z|. Профильный спектр рисует каждый изотопный пик с шириной FWHM = m/R, где R — разрешающая способность.
Эмпирические правила для M+1 и M+2
| Изотоп | Эффект | Быстрое правило |
|---|---|---|
| ¹³C (1,07 %) | M+1 | около 1,1 % от M на атом углерода: C₁₀ даёт M+1 ≈ 11 % |
| ¹⁵N (0,36 %) | M+1 | около 0,37 % на атом азота |
| ¹⁸O (0,20 %) | M+2 | около 0,2 % на атом кислорода |
| ³⁴S (4,25 %) | M+2 | около 4,4 % на атом серы |
| ²⁹Si, ³⁰Si | M+1, M+2 | около 5,1 % и 3,4 % на атом кремния |
| ³⁷Cl (24,24 %) | M+2 | M : M+2 ≈ 3 : 1 для одного Cl |
| ⁸¹Br (49,31 %) | M+2 | M : M+2 ≈ 1 : 1 для одного Br |
Кластеры хлора и брома
| Галогены | M : M+2 : M+4 : M+6 |
|---|---|
| Cl | 100 : 32 |
| Cl₂ | 100 : 64 : 10 |
| Cl₃ | 100 : 96 : 31 : 3 |
| Cl₄ | 78 : 100 : 48 : 10 : 1 |
| Br | 100 : 97 |
| Br₂ | 51 : 100 : 49 |
| Br₃ | 34 : 100 : 97 : 32 |
| ClBr | 77 : 100 : 24 |
Разобранные примеры
CH₂Cl₂ (два атома хлора)
Ионы при m/z 84, 86 и 88 от ³⁵Cl₂, ³⁵Cl³⁷Cl и ³⁷Cl₂.
0.7576² : 2 × 0.7576 × 0.2424 : 0.2424²
M : M+2 : M+4 = 100 : 64 : 10
Бромбензол C₆H₅Br
⁷⁹Br и ⁸¹Br почти равны: 50,69 % и 49,31 %.
M (m/z 156) и M+2 (m/z 158) также содержат вклад ¹³C.
M : M+2 = 100 : 97,5, M+1 = 6,5 %
CHBr₃ (бромоформ)
Три атома Br дают распределение (1 + 1)³.
Пики при m/z 250, 252, 254 и 256.
34 : 100 : 97 : 32 (близко к 1 : 3 : 3 : 1)
C₆₀ (бакминстерфуллерен)
60 атомов углерода: M+1 ≈ 60 × 1,08 % от M.
Моноизотопная масса равна ровно 720,0000 (¹²C определяет единицу массы).
M : M+1 : M+2 = 100 : 65 : 21
Кофеин при положительной ESI
C₈H₁₀N₄O₂ + H⁺ = C₈H₁₁N₄O₂⁺.
194,0804 + 1,00728 (протон) = 195,0877.
[M+H]⁺ m/z 195,0877, M+1 = 10,3 %
Ванкомицин [M+H]⁺
C₆₆H₇₅Cl₂N₉O₂₄: 66 атомов углерода и 2 атома хлора.
¹³C делает M+1 ≈ 77 %, а два Cl делают M+2 почти таким же высоким, как M.
m/z 1448,4375; M : M+1 : M+2 = 100 : 77 : 98
Цисплатин Pt(NH₃)₂Cl₂
У платины ¹⁹⁴Pt 32,9 %, ¹⁹⁵Pt 33,8 %, ¹⁹⁶Pt 25,2 % и ¹⁹⁸Pt 7,4 %, что смешивается с распределением Cl₂.
Широкий кластер от m/z 296 до 306, максимум при 300
Частые ошибки
- Путаница моноизотопной и средней массы. Масс-спектрометрия высокого разрешения измеряет моноизотопный m/z; молярная масса рассчитывается по средним атомным массам.
- Ожидание, что моноизотопный пик самый высокий. Примерно выше 90 атомов углерода или при наличии Br, Pt, Sn или Hg самым интенсивным часто оказывается M+1, M+2 или выше.
- Забытый аддукт. При электрораспылении сам M виден редко: ищите [M+H]⁺ (+1,00728), [M+Na]⁺ (+22,98922) или [M−H]⁻.
- M+2 только как два атома ¹³C. Высокий M+2 (более 30 % от M) указывает скорее на Cl, Br или S, чем на углерод.
- Игнорирование зарядового состояния. Для иона 2+ изотопные пики отстоят на 0,5 m/z, а не на 1.
- Неверный регистр. CO — это монооксид углерода, Co — кобальт. Пишите Cl, Br и Si со второй строчной буквой.
Нужна структура, стоящая за формулой? Нарисуйте молекулу в MolDraw — бесплатном онлайн-редакторе химических структур — и скопируйте её формулу или SMILES в калькулятор.
Открыть редактор MolDrawЧасто задаваемые вопросы
Что такое пик M+2 и чем он вызван?
Пик M+2 находится на 2 единицы массы выше моноизотопного иона. Большие пики M+2 дают ³⁷Cl (около трети от M на каждый Cl), ⁸¹Br (примерно равен M на каждый Br) и ³⁴S (около 4,4 % на каждый S). Небольшие пики M+2 дают два атома ¹³C или ¹⁸O.
Почему CH₂Cl₂ даёт пики в соотношении 100 : 64 : 10?
Каждый атом хлора — это ³⁵Cl (75,76 %) или ³⁷Cl (24,24 %). Для двух атомов хлора соотношение равно 0,7576² : 2 × 0,7576 × 0,2424 : 0,2424², то есть 100 : 64 : 10 для M, M+2 и M+4.
Как оценить число атомов углерода по пику M+1?
Разделите интенсивность M+1 (в % от M) на 1,1. M+1 в 11 % соответствует примерно 10 атомам углерода. Азот добавляет около 0,37 % на атом, поэтому для молекул, богатых азотом, оценка приблизительна.
Чем моноизотопная масса отличается от средней?
Моноизотопная масса рассчитывается по самому распространённому изотопу каждого элемента; именно её измеряет масс-спектрометрия высокого разрешения. Средняя масса рассчитывается по стандартным атомным массам и используется для молярной массы. Для кофеина это 194,0804 и 194,19.
Почему у больших молекул моноизотопный пик не самый высокий?
Каждый атом углерода с вероятностью 1,07 % является ¹³C. Примерно при 90 и более атомах углерода вероятность того, что молекула содержит хотя бы один ¹³C, превышает вероятность, что не содержит ни одного, поэтому самым высоким становится пик M+1.
Как разрешение меняет изотопное распределение?
При низкой разрешающей способности пики с одной номинальной массой сливаются в один. При высокой разрешающей способности (выше примерно 50 000 около m/z 500) появляется тонкая структура: например, пики ¹³C₂ и ³⁴S при M+2 расходятся примерно на 0,011 Da.
Какие распространённости изотопов использует калькулятор?
Он использует представительные изотопные распространённости IUPAC и атомные массы всех стабильных изотопов каждого элемента, включая металлы Fe, Cu, Zn, Se, Sn, Pt, Ru, Pd, Ag и Hg.
Похожие химические инструменты
Последнее обновление: