Chuyển SMILES sang công thức phân tử

Tóm tắt: Dán chuỗi SMILES và nhận công thức phân tử, khối lượng phân tử, tên IUPAC và PubChem CID khi có. Miễn phí, chạy trên trình duyệt web và không cần tải về.

Dán chuỗi SMILES để nhận công thức phân tử và siêu dữ liệu bổ sung từ PubChem.

Về SMILES và công thức phân tử

SMILES mô tả sự liên kết trong phân tử bằng một chuỗi văn bản gọn. Công thức phân tử tóm tắt số nguyên tử trong phân tử, như C9H8O4 với aspirin.

• Dùng công thức đầu ra cho báo cáo, kiểm tra khối lượng chính xác và tính thành phần.
• Dùng công cụ tính khối lượng phân tử khi bạn cần g/mol từ công thức.

Cách xác định công thức

SMILES liệt kê tường minh các nguyên tử nặng, nhưng hầu hết hydrogen được ngầm hiểu: mỗi nguyên tử nhận đủ hydrogen để đạt hóa trị thông thường. Để lập công thức, công cụ đếm mọi nguyên tử tường minh, cộng thêm hydrogen ngầm định và viết kết quả theo thứ tự Hill: carbon trước, hydrogen thứ hai, rồi các nguyên tố khác theo thứ tự chữ cái.

Ví dụ có lời giải

Với ethyl acetate, CCOC(=O)C:

• Carbon: 4. Oxygen: 2.
• Hydrogen: CH₃ (3) + CH₂ (2) + carbon ester (0) + CH₃ (3) = 8.
• Công thức: C₄H₈O₂.

Những điều cần lưu ý

• Điện tích: CC(=O)[O-] (acetate) cho C₂H₃O₂⁻, ít hơn acetic acid một hydrogen.
• Nguyên tử trong ngoặc vuông: nguyên tử trong ngoặc vuông chỉ có số hydrogen được viết, nên [CH2] là carbon có đúng hai hydrogen.
• Muối: SMILES có dấu chấm như [Na+].[Cl-] gộp mọi thành phần.

Cần cả khối lượng? Dùng SMILES sang khối lượng phân tử hoặc công cụ tính khối lượng chính xác.