---
title: "ดูโครงสร้างโปรตีนจาก PDB แบบ 3D ในเบราว์เซอร์: ปลั๊กอิน Protein Viewer | บล็อก MolDraw"
url: https://www.moldraw.com/th/blog/protein-viewer-plugin-pdb-3d.html
description: "โหลดรายการ PDB ใดก็ได้ด้วย ID สี่อักขระ แสดงเป็นการ์ตูนหรือพื้นผิว ปรับสไตล์เรซิดิวจากลำดับ และส่งออกภาพ คู่มือใช้งานโปรแกรมดูโปรตีนฟรีของ MolDraw"
lang: th
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-26
---
# ดูโครงสร้างโปรตีนจาก PDB แบบ 3D ด้วย Protein Viewer ของ MolDraw

เผยแพร่: 15 ต.ค. 2026 · ผู้เขียน: Scidart Academy · เวลาอ่าน: ~5 นาที

![โปรตีนแบบการ์ตูนที่มีริบบอนเกลียวแอลฟาและลูกศรสายเบตา อยู่เหนือแถบลำดับกรดอะมิโนที่มีช่วงเรซิดิวไฮไลต์](https://www.moldraw.com/blog/thumbs/protein-viewer-plugin.webp)

โปรแกรมดูโปรตีนแสดงโครงสร้าง PDB เป็นการ์ตูน และให้คุณเลือกเรซิดิวจากลำดับได้

**คำตอบสั้น ๆ:** เปิดแท็บ **Protein** ข้าง Structure พิมพ์ PDB ID สี่อักขระ เช่น 1HHO แล้วกด **Go** โครงสร้างจะโหลดเป็นการ์ตูนที่ใส่สีตามสายโซ่ ใช้ **Display** และ **Surface** เพื่อเปลี่ยนมุมมอง เลือกเรซิดิวในแถบลำดับเพื่อปรับสไตล์ และใช้ **Export** เพื่อบันทึกภาพหรือไฟล์ โปรแกรมดูเปิดไว้เป็นค่าเริ่มต้นและไม่ต้องใช้บัญชี

## ทำไมต้องดูโปรตีนแบบ 3D

หน้าที่ของโปรตีนขึ้นกับรูปร่าง ลำดับกรดอะมิโนพับเป็นเกลียวและแผ่น ซึ่งอัดตัวเป็นโครงสร้างสามมิติที่มีร่องและโพรง ยาโมเลกุลเล็กมักทำงานโดยเข้าไปพอดีกับโพรงเหล่านั้น สิ่งเหล่านี้มองไม่เห็นในลำดับหรือภาพวาด 2D

[Protein Data Bank](https://www.rcsb.org/) (PDB) เป็นคลังข้อมูลสาธารณะของโครงสร้างที่ได้จากการทดลองของโปรตีน DNA และ RNA แต่ละรายการมี ID สี่อักขระ เช่น 1HHO สำหรับฮีโมโกลบิน Protein Viewer ของ MolDraw โหลดรายการเหล่านี้ไว้ข้างภาพวาดของคุณ คุณจึงไปจากลิแกนด์สู่เป้าหมายได้โดยไม่ต้องเปิดโปรแกรมอื่น

มุมมองต่างกันตอบคำถามต่างกัน **การ์ตูน**ไล่ตามโครงหลักและแสดงโครงสร้างทุติยภูมิ: เกลียวเป็นขดสปริงและสาย β เป็นลูกศร **แท่ง**แสดงอะตอมแต่ละตัว ซึ่งจำเป็นสำหรับโซ่ข้างและจุดสัมผัสในการจับ **พื้นผิว**แสดงรูปร่างภายนอกของโมเลกุล ทำให้เห็นโพรงและร่องได้ง่าย

## สิ่งที่โปรแกรมดูมีให้

![Protein Viewer ของ MolDraw แสดงฮีโมโกลบิน PDB 1HHO เป็นสายโซ่การ์ตูนสีเขียวและน้ำเงิน พร้อมตัวควบคุม Open, ID, Go, Display, Surface และ Export และแถบลำดับกรดอะมิโนด้านล่าง](https://www.moldraw.com/docs/img/plugin-proteins-annotated-screenshot.webp)

ฮีโมโกลบิน (PDB 1HHO) เป็นการ์ตูนโดยแต่ละสายโซ่มีสีของตัวเอง แถบลำดับอยู่ใต้โปรแกรมดู

| โหลด | พิมพ์ PDB ID แล้วกด **Go** เพื่อดึงจาก RCSB กด **Open** สำหรับไฟล์ PDB ในเครื่อง หรือวางไฟล์ลงบนโปรแกรมดู |
| --- | --- |
| การแสดงผล | Cartoon, Ribbon, Stick, Ball & stick, Sphere, Line หรือ Cross ใส่สีตาม Chain, Amino acid, Shapely, Secondary structure, Hydrophobicity, B-factor หรือ Spectrum หรือเลือกสีเอง และตั้งค่าความทึบ |
| พื้นผิว | แสดงหรือซ่อนพื้นผิว เลือก SAS, SES, VDW หรือ MS และตั้งค่าความทึบ |
| แถบลำดับ | ลำดับแบบอักษรเดียวของแต่ละสายโซ่ เลือกเรซิดิวเพื่อกำหนดสไตล์เฉพาะ |
| ส่งออก | GLB, PNG, JPG, PDB, SDF, XYZ, X3D และ OBJ พร้อมตัวเลือก Hi-res |

## วิธีเปิดใช้ Protein Viewer

ต้องการดูอย่างรวดเร็วโดยไม่เปิดตัวแก้ไข? [โปรแกรมดูโครงสร้างโปรตีนแบบสแตนด์อโลนปรับสไตล์ ใส่สี และซ่อนแต่ละสายโซ่แยกกันได้](https://www.moldraw.com/th/blog/protein-structure-viewer-guide.html)

ไม่ต้องติดตั้งอะไร Protein Viewer เปิดไว้เป็นค่าเริ่มต้นและใช้งานได้โดยไม่ต้องมีบัญชี ถ้าคุณปิดไว้ก่อนหน้านี้:

1. เปิด[ตัวแก้ไข MolDraw](https://www.moldraw.com/th/)
2. คลิก **Settings** (ไอคอนเฟือง) แล้วคลิก **Plugins**
3. คลิก **Install** ข้าง Proteins แท็บ **Protein** จะปรากฏข้าง Structure

## วิธีโหลดและปรับสไตล์โปรตีน

1. คลิกแท็บ **Protein** โครงสร้างตัวอย่างขนาดเล็ก แครมบิน (1CRN) จะโหลดก่อน
2. พิมพ์ PDB ID ในช่อง **ID** เช่น `1HHO` แล้วกด **Go** หรือ Enter
3. เปิด **Display** คงไว้ที่ Cartoon แล้วเลือก **Secondary structure** เพื่อใส่สีเกลียวและสายต่างกัน หรือเลือก **Chain** เพื่อแยกหน่วยย่อย
4. เปิด **Surface** กด **Show** แล้วลดความทึบเพื่อให้ยังเห็นการ์ตูนด้านใต้
5. ในแถบลำดับ คลิกเรซิดิวหนึ่งตัว ลากผ่านช่วง หรือ Ctrl/Cmd+คลิก เพื่อเพิ่มหรือเอาเรซิดิวออก ในแผงสไตล์ที่เปิดขึ้น ตั้ง **Style** เป็น Stick แล้วเลือกสี
6. เปิด **Export** เลือก **Hi-res** ถ้าต้องการภาพขนาดใหญ่ แล้วเลือก PNG

## วิธีใช้ในชั้นเรียนและงานวิจัย

- **สอนโครงสร้างโปรตีน:** โหลด 1HHO ใส่สีตามโครงสร้างทุติยภูมิแล้วชี้ให้เห็นเกลียว จากนั้นใส่สีตามสายโซ่เพื่อแสดงว่าฮีโมโกลบินมีสี่หน่วยย่อย
- **แกนไม่ชอบน้ำ:** ใส่สีตาม Hydrophobicity เพื่อแสดงว่าเรซิดิวไม่มีขั้วมักอยู่ด้านในของการพับ
- **เป้าหมายยา:** โหลด 6LU7 ซึ่งเป็นเอนไซม์โปรตีเอสหลักของ SARS-CoV-2 เพิ่มพื้นผิว แล้วอภิปรายว่าตัวยับยั้งจะจับที่ใด
- **ภาพประกอบ:** ปรับเรซิดิวสำคัญบางตัวเป็นแท่งบนพื้นหลังการ์ตูน แล้วส่งออกภาพความละเอียดสูงสำหรับสไลด์หรือรายงาน
- **ขั้นต่อไป:** คำนวณมวลของสายโซ่ด้วย[เครื่องคำนวณมวลโมเลกุลโปรตีน](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/protein-molecular-weight-calculator.html) หรือเตรียมรีเซปเตอร์สำหรับด็อกกิงด้วย[PDB เป็น PDBQT](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/pdb-to-pdbqt-converter.html)

## เคล็ดลับและข้อจำกัด

- ID ที่เหมาะสำหรับเริ่มต้น: 1HHO (ฮีโมโกลบิน) 1BNA (B-DNA) 6LU7 (โปรตีเอสหลักของ SARS-CoV-2) และ 1GFL (โปรตีนเรืองแสงสีเขียว)
- แต่ละส่วนที่เลือกและปรับสไตล์จะกลายเป็นบริเวณของตัวเอง คุณจึงใส่สีหลายตำแหน่งต่างกันได้ ใช้ **Remove style** หรือ **Clear selection** ในแผงสไตล์เพื่อยกเลิก
- การใส่สีตาม B-factor แสดงว่าตำแหน่งอะตอมในแบบจำลองแปรผันมากเพียงใด ค่าสูงมักบ่งบอกลูปที่ยืดหยุ่น
- หากต้องการเปิดโครงสร้างที่บันทึกไว้ก่อนหน้า ให้ลากไฟล์ .pdb จากคอมพิวเตอร์มาวางบนโปรแกรมดู

การดึงด้วย ID ต้องเชื่อมต่ออินเทอร์เน็ต เพราะไฟล์มาจาก RCSB โปรแกรมดูต้องใช้ WebGL และจะแสดงข้อความหากเบราว์เซอร์ของคุณไม่รองรับ แถบลำดับแสดงเฉพาะเรซิดิวกรดอะมิโน ลิแกนด์ น้ำ และกรดนิวคลีอิกจึงไม่ปรากฏที่นั่น รายการ PDB เป็นแบบจำลองจากการทดลอง คุณภาพขึ้นกับวิธีและความละเอียด ซึ่งตรวจได้ที่หน้า RCSB ของรายการนั้น

ต้องการดูโมเลกุลขนาดเล็กแบบ 3D แทน? ดู[วิธีดูโมเลกุลแบบ 3D](https://www.moldraw.com/docs/analyze/how-to-view-molecules-in-3d/)

## คำถามและคำตอบ

### ต้องมีบัญชีเพื่อดูโปรตีนไหม

ไม่ต้อง Protein Viewer ติดตั้งไว้เป็นค่าเริ่มต้นและใช้งานได้โดยไม่ต้องลงชื่อเข้าใช้

### โครงสร้างมาจากไหน

เมื่อคุณพิมพ์ PDB ID แล้วกด Go ปลั๊กอินจะดาวน์โหลดรายการจาก RCSB Protein Data Bank คุณยังเปิดไฟล์ PDB จากคอมพิวเตอร์ได้ด้วย

### จะไฮไลต์บริเวณเร่งหรือเรซิดิวไม่กี่ตัวได้อย่างไร

เลือกเรซิดิวในแถบลำดับใต้โปรแกรมดู แผงสไตล์ขนาดเล็กจะเปิดขึ้น ซึ่งคุณเปลี่ยนเป็นแท่ง เปลี่ยนสี หรือเพิ่มพื้นผิวได้

### ส่งออกเป็นรูปแบบใดได้บ้าง

เมนู Export มี GLB, PNG, JPG, PDB, SDF, XYZ, X3D และ OBJ เลือก Hi-res เพื่อให้ได้ภาพที่ใหญ่ขึ้น

## ปลั๊กอิน MolDraw เพิ่มเติม

[เอกสาร Protein Viewer](https://www.moldraw.com/docs/plugins/protein-viewer-plugin-view-pdb-structures-in-3d/) [ค้นหาฤทธิ์ทางชีวภาพจาก ChEMBL](https://www.moldraw.com/th/blog/chembl-plugin-bioactivity-lookup.html) [pKa และไมโครสปีชีส์](https://www.moldraw.com/th/blog/pka-plugin-protonation-states-microspecies.html) [สมมาตรและหมู่จุด](https://www.moldraw.com/th/blog/symmetry-plugin-point-groups-3d.html) [ปลั๊กอินทั้งหมด](https://www.moldraw.com/docs/plugins/moldraw-plugins-overview-and-how-to-install/)

อัปเดตล่าสุด: 15 ตุลาคม 2026