---
title: "ฐานข้อมูลเคมีฟรี: PubChem, ChEMBL และอื่น ๆ | MolDraw"
url: https://www.moldraw.com/th/blog/free-chemical-databases-guide.html
description: "เปรียบเทียบฐานข้อมูลเคมีฟรี 12 แห่ง (PubChem, ChEMBL, ChEBI, ZINC, PDB, UniChem และอื่น ๆ) พร้อมขนาดที่ตรวจสอบแล้ว ไลเซนส์ และตัวอย่างการเรียก API จริง"
lang: th
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-26
---
## ในหน้านี้

ฐานข้อมูลเคมีคืออะไร ฐานข้อมูลเคมีฟรีเปรียบเทียบกันอย่างไร PubChem คืออะไร ฐานข้อมูลเคมีฟรีที่ใหญ่ที่สุด ChEMBL คืออะไร ฐานข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพที่ใช้กันเป็นหลัก ChEBI คืออะไร พจนานุกรมโมเลกุลขนาดเล็กที่คัดสรรแล้ว ZINC คืออะไร สารประกอบหลายพันล้านตัวสำหรับการคัดกรองเสมือน RCSB PDB คืออะไร โครงสร้าง 3 มิติของโปรตีนและลิแกนด์ UniChem คืออะไร การแปลง ID ระหว่างฐานข้อมูล nmrshiftdb2 คืออะไร ฐานข้อมูลสเปกตรัม NMR ฟรี MassBank คืออะไร สเปกตรัม MS/MS จากการทดลอง COCONUT คืออะไร ฐานข้อมูลผลิตภัณฑ์ธรรมชาติแบบเปิด SureChEMBL คืออะไร เคมีจากสิทธิบัตร แล้ว DrugBank และ NIST Chemistry WebBook ล่ะ ควรใช้ฐานข้อมูลเคมีใด จะใช้ฐานข้อมูลเหล่านี้กับ MolDraw อย่างไร ตัวอย่างเฉลย: จะเปรียบเทียบอนุพันธ์ของเซทิริซีนได้อย่างไร จะค้นหาฐานข้อมูลเคมีให้ได้ผลดีได้อย่างไร คำถามพบบ่อย แหล่งอ้างอิง

# ฐานข้อมูลเคมีฟรี: คู่มือเชิงปฏิบัติสำหรับนักเรียนและนักวิจัย

เผยแพร่: 6 ต.ค. 2026 · โดย [Rafeeque Mavoor](https://www.moldraw.com/th/pages/authors.html) · หมวดหมู่: คู่มือ · ตรวจสอบข้อมูล: ตุลาคม 2026

![ภาพประกอบฐานข้อมูลเคมีที่เชื่อมกับข้อมูลสารประกอบของฟีนอล คาเฟอีน และไพริดีน พร้อมแว่นขยายค้นหา](https://www.moldraw.com/blog/thumbs/free-chemical-databases-guide.webp)

ฐานข้อมูลเคมีฟรีเก็บข้อมูลสารประกอบที่ค้นหาได้หลายล้านรายการ แต่ละรายการมีโครงสร้างและตัวระบุ

**คำตอบสั้น ๆ:** ฐานข้อมูลเคมีฟรีที่มีประโยชน์ที่สุดคือ **PubChem** (ฐานข้อมูลสารประกอบทั่วไปที่ใหญ่ที่สุด) **ChEMBL** (ข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพที่คัดสรรแล้วสำหรับการค้นพบยา) **ChEBI** (พจนานุกรมโมเลกุลขนาดเล็กที่คัดสรรแล้ว) **ZINC** (สารประกอบที่ซื้อได้หลายพันล้านตัวสำหรับการคัดกรองเสมือน) และ **RCSB PDB** (โครงสร้างโปรตีน–ลิแกนด์ 3 มิติ) สำหรับสเปกตรัม ใช้ **nmrshiftdb2** ([NMR](https://www.moldraw.com/th/tools/nmr-viewer/)) **MassBank** (MS/MS) และ **NIST Chemistry WebBook** สำหรับผลิตภัณฑ์ธรรมชาติใช้ **COCONUT** สำหรับสิทธิบัตรใช้ **SureChEMBL** และ **UniChem** เชื่อมตัวระบุระหว่างฐานข้อมูลเหล่านี้

นักศึกษาเคมีมักเจอปัญหาเดียวกันไม่ช้าก็เร็ว: คุณมีโมเลกุลหนึ่ง และต้องการสมบัติ ฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างผลึก สเปกตรัมอ้างอิง หรือสิทธิบัตรของมัน คำถามแต่ละข้ออยู่ในฐานข้อมูลคนละแห่ง คู่มือนี้อธิบายว่าฐานข้อมูลเคมีฟรีหลักแต่ละแห่งคืออะไร เหมาะกับอะไร ใหญ่แค่ไหน ไลเซนส์อนุญาตอะไรบ้าง และจะค้นหาอย่างไร พร้อมตัวอย่าง URL จริงที่เราทดสอบก่อนเผยแพร่

ตัวเลขทั้งหมดด้านล่าง**ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026** กับเว็บไซต์หรือ API ทางการ ขนาดของฐานข้อมูลเปลี่ยนทุกครั้งที่ออกรุ่นใหม่ จึงควรถือเป็นภาพ ณ ขณะหนึ่ง ไม่ใช่ค่าคงที่

ฐานข้อมูลเคมีฟรีจัดกลุ่มตามประเภทข้อมูล: สารประกอบ ฤทธิ์ทางชีวภาพ การคัดกรอง ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ โครงสร้าง 3 มิติ สเปกตรัม และสิทธิบัตร เชื่อมโยงด้วย UniChem

## ฐานข้อมูลเคมีคืออะไร

**ฐานข้อมูลเคมี**คือชุดโครงสร้างเคมีที่ค้นหาได้ ซึ่งเชื่อมกับข้อมูลเกี่ยวกับโครงสร้างเหล่านั้น: ชื่อ ตัวระบุ สมบัติที่คำนวณได้ ผลการวัดจากการทดลอง ฤทธิ์ทางชีวภาพ พิกัด 3 มิติ สเปกตรัม หรือเอกสารที่รายงานไว้ ฐานข้อมูลสมัยใหม่ส่วนใหญ่ค้นหาได้ด้วยชื่อ ตัวระบุ (เลข CAS, InChIKey, [SMILES](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/smiles-to-structure.html)) หรือการวาดโครงสร้าง และหลายแห่งมี REST API ฟรีสำหรับการเข้าถึงด้วยโปรแกรม

สิ่งสำคัญที่ต้องเข้าใจคือ**ไม่มีฐานข้อมูลใดทำได้ทุกอย่าง** แต่ละแห่งเน้นต่างกัน:

- **สารานุกรมสารประกอบ** (PubChem, ChEBI) ตอบคำถาม "โมเลกุลนี้คืออะไร"
- **ฐานข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพ** (ChEMBL, DrugBank) ตอบคำถาม "โมเลกุลนี้ทำอะไรกับโปรตีน"
- **คลังสารสำหรับคัดกรอง** (ZINC) ตอบคำถาม "มีโมเลกุลคล้ายกันใดที่ซื้อหรือทำ docking ได้"
- **ฐานข้อมูลโครงสร้าง** (RCSB PDB) ตอบคำถาม "โมเลกุลนี้อยู่ในเป้าหมายอย่างไร"
- **ฐานข้อมูลสเปกตรัม** (nmrshiftdb2, MassBank, NIST WebBook) ตอบคำถาม "สเปกตรัมของสารนี้ควรมีลักษณะอย่างไร"
- **คลังเฉพาะทาง** (COCONUT สำหรับผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ SureChEMBL สำหรับสิทธิบัตร) ครอบคลุมส่วนที่ฐานข้อมูลใหญ่มองข้าม

## ฐานข้อมูลเคมีฟรีเปรียบเทียบกันอย่างไร

| ฐานข้อมูล | จุดเน้น | ขนาด (ตรวจสอบ ต.ค. 2026) | เหมาะสำหรับ | API | ไลเซนส์ |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| **PubChem** | สารประกอบทั่วไป สาร และการทดสอบทางชีวภาพ | ~124 ล้านสารประกอบ, ~349 ล้านสาร | ตัวระบุ สมบัติ การค้นหาแบบกว้าง | PUG-REST, PUG-View | ฟรี เงื่อนไขการนำไปใช้ต่อแตกต่างตามผู้ฝากข้อมูล |
| **ChEMBL** | ฤทธิ์ทางชีวภาพที่คัดสรรแล้ว | 2.92 ล้านสารประกอบ 24.5 ล้านค่าฤทธิ์ 18,552 เป้าหมาย (ChEMBL 37) | SAR ความแรง เป้าหมายยา | REST (JSON/XML) | CC BY-SA 3.0 |
| **ChEBI** | พจนานุกรมโมเลกุลขนาดเล็กที่คัดสรรแล้ว + ออนโทโลยี | 201,471 รายการ คัดสรรครบถ้วน 61,961 รายการ (รุ่น 244) | คำนิยาม ประเภท บทบาททางชีวภาพ | REST (ChEBI 2.0) | CC BY 4.0 |
| **ZINC-22** | สารประกอบที่ซื้อได้แบบ "สั่งผลิตตามต้องการ" | ~54.9 พันล้าน (2D), ~5.9 พันล้าน (3D) | การคัดกรองเสมือน การซื้อสารอนุพันธ์ | เว็บ (CartBlanche) ดาวน์โหลดจำนวนมาก | ใช้ฟรี ห้ามแจกจ่ายส่วนสำคัญต่อโดยไม่ได้รับอนุญาต |
| **RCSB PDB** | โครงสร้างโมเลกุลขนาดใหญ่ 3 มิติ | 260,724 รายการ | สารเชิงซ้อนโปรตีน–ลิแกนด์ การเตรียม docking | Data API, Search API | CC0 1.0 |
| **UniChem** | การจับคู่ตัวระบุข้ามฐานข้อมูล | 25 แหล่ง | แปลง ID ระหว่างฐานข้อมูล | REST | ฟรี (เงื่อนไขของ EMBL-EBI) ใช้ไลเซนส์ของแหล่งข้อมูลต้นทาง |
| **nmrshiftdb2** | สเปกตรัม NMR + การทำนาย | 271,817 โครงสร้าง สเปกตรัมที่วัดได้ 70,030 สเปกตรัม | สเปกตรัมอ้างอิงและการทำนาย ¹H/¹³C NMR | เว็บ; อินเทอร์เฟซ REST ใหม่ | ไลเซนส์เนื้อหาแบบเปิด |
| **MassBank (Europe)** | แมสสเปกตรัมจากการทดลอง | 139,006 รายการ | การจับคู่ MS/MS เมแทบอโลมิกส์ | REST | Creative Commons รายรายการ |
| **COCONUT 2.0** | ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ | 738,829 โมเลกุลที่ไม่ซ้ำกัน 71 คอลเลกชัน | การค้นพบผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ | REST (ต้องเข้าสู่ระบบ) | CC0 (ข้อมูล) |
| **SureChEMBL** | เคมีจากสิทธิบัตร | เอกสารสิทธิบัตร 116.6 ล้านฉบับ (พ.ค. 2025) | งานที่มีมาก่อน (prior art) การสำรวจภาพรวมสิทธิบัตร | REST | CC BY 4.0 |
| **DrugBank** | ยาและเป้าหมายของยา | ไม่มีข้อมูล (ไม่ได้ตรวจสอบ) | รายละเอียดยาที่ได้รับอนุมัติ | API แบบเสียเงิน | ฟรีสำหรับงานวิชาการ CC BY-NC 4.0; ต้องมีไลเซนส์เชิงพาณิชย์ |
| **NIST Chemistry WebBook** | อุณหเคมี IR, EI-MS | ไม่มีข้อมูล (ไม่ได้ตรวจสอบ) | IR/MS อ้างอิง ข้อมูลทางกายภาพ | เว็บเท่านั้น | NIST Standard Reference Data (มีลิขสิทธิ์) |

## PubChem คืออะไร ฐานข้อมูลเคมีฟรีที่ใหญ่ที่สุด

**PubChem เป็นฐานข้อมูลเคมีฟรีที่ใหญ่ที่สุดในโลก ดำเนินการโดย National Center for Biotechnology Information (NCBI) ของสหรัฐฯ** รวบรวมข้อมูลจากผู้ร่วมให้ข้อมูลมากกว่าหนึ่งพันรายเป็นชุดข้อมูลที่เชื่อมโยงกัน: Substance (สิ่งที่ผู้ฝากส่งมา) Compound (โครงสร้างมาตรฐานที่ไม่ซ้ำกัน) BioAssay, Protein, Gene, Pathway และ Patent

- **ขนาด:** ประมาณ 124 ล้านสารประกอบและ 349 ล้านสารบนหน้าแรกของ PubChem (ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026) บทความที่ผ่านการพิจารณา [PubChem 2025 update](https://doi.org/10.1093/nar/gkae1059) รายงาน 118.6 ล้านสารประกอบ ณ กันยายน 2024
- **ใช้สำหรับ:** ค้นหาชื่อ ชื่อพ้อง เลข CAS สูตร สมบัติที่คำนวณได้ (XLogP, TPSA) ข้อมูลความปลอดภัย ผู้จำหน่าย และเอกสารอ้างอิง
- **ผู้ใช้:** นักเรียน ครู นักเคมีวิเคราะห์ นักพิษวิทยา นักเคมีสารสนเทศ และทุกคนที่ต้องการตัวระบุที่เชื่อถือได้อย่างรวดเร็ว
- **การเข้าถึง:** ค้นหาบนเว็บพร้อมเครื่องมือวาดโครงสร้าง และ PUG-REST API ฟรี PubChem ขอให้ผู้ใช้ผ่านโปรแกรมส่งคำขอไม่เกิน **5 ครั้งต่อวินาที**
- **ไลเซนส์:** ใช้ฟรี สิทธิ์ในการนำไปใช้ต่อเป็นไปตามแหล่งข้อมูลแต่ละแห่ง จึงควรตรวจสอบแหล่งที่มาก่อนแจกจ่ายข้อมูลต่อ

**คำถามภาษาธรรมดา:** "ขอสูตร [มวลโมเลกุล](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/molecular-weight-calculator.html) SMILES และ InChIKey ของแอสไพริน"

```
https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/name/aspirin/property/MolecularFormula,MolecularWeight,SMILES,InChIKey/JSON
```

ผลลัพธ์จริง (ตัดบางส่วน):

```
{"PropertyTable": {"Properties": [{
  "CID": 2244,
  "MolecularFormula": "C9H8O4",
  "MolecularWeight": "180.16",
  "SMILES": "CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O",
  "InChIKey": "BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N"}]}}
```

**ข้อควรรู้:** PubChem เปลี่ยนชื่อสมบัติ SMILES แล้ว การขอ `CanonicalSMILES` แบบเดิมยังใช้ได้ แต่คำตอบจะมาในชื่อ `ConnectivitySMILES` (ไม่มีสเตอริโอเคมี) ให้ขอ `SMILES` หากต้องการสตริงฉบับเต็มที่มีข้อมูลสเตอริโอ

คำค้น PubChem อื่นที่ทดสอบแล้ว:

- InChIKey เป็น CID: `https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/inchikey/BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N/cids/JSON` คืนค่า `2244`
- ความคล้ายคลึงแบบ 2D (≥90%) กับเซทิริซีน: `https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/fastsimilarity_2d/cid/2678/cids/JSON?Threshold=90&MaxRecords=10`
- ค้นหาโครงสร้างย่อยจาก SMILES: `https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/fastsubstructure/smiles/c1ccc(cc1)C(c1ccc(Cl)cc1)N1CCNCC1/cids/JSON?MaxRecords=10`

## ChEMBL คืออะไร ฐานข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพที่ใช้กันเป็นหลัก

**ChEMBL เป็นฐานข้อมูลโมเลกุลคล้ายยาที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพซึ่งคัดสรรด้วยมือ ดูแลโดย European Bioinformatics Institute ของ EMBL (EMBL-EBI)** แกนหลักคือข้อมูลฤทธิ์ที่วัดได้ เช่น ค่า IC50, Ki และ EC50 ที่สกัดจากบทความวารสารและชุดข้อมูลที่ถูกฝากไว้ แต่ละค่าเชื่อมกับสารประกอบ การทดสอบ และเป้าหมายทางชีวภาพ

- **ขนาด (ChEMBL 37, พ.ค. 2026):** สารประกอบที่ไม่ซ้ำกัน 2,921,148 ตัว ค่าฤทธิ์ 24,527,044 ค่า เป้าหมาย 18,552 รายการ และสิ่งพิมพ์ 101,100 ฉบับ ตามที่ endpoint สถานะของ ChEMBL API รายงาน
- **ใช้สำหรับ:** ความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างกับฤทธิ์ (SAR) การหาสารที่มีฤทธิ์ต่อเป้าหมายที่รู้จัก การสร้างชุดข้อมูลฝึกสำหรับแมชชีนเลิร์นนิง และการตรวจระยะการอนุมัติยา
- **ผู้ใช้:** นักเคมีการแพทย์ นักเภสัชวิทยา นักเคมีคำนวณ และนักวิทยาศาสตร์ข้อมูล
- **การเข้าถึง:** หน้าเว็บและ REST API ฟรี (JSON หรือ XML) พร้อมดาวน์โหลดข้อมูลทั้งหมด (SQLite, PostgreSQL, SDF)
- **ไลเซนส์:** CC BY-SA 3.0 ChEMBL ขอให้คง ChEMBL ID และหมายเลขรุ่นไว้เมื่อนำข้อมูลไปใช้ต่อ

**คำถามภาษาธรรมดา:** "หาแอสไพรินใน ChEMBL"

```
https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/molecule/search.json?q=aspirin
```

ผลลัพธ์แรกคือ `CHEMBL25` (ASPIRIN, max phase 4 คือได้รับอนุมัติแล้ว) พร้อม SMILES `CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O`

**คำถามภาษาธรรมดา:** "ChEMBL มีค่าความแรงของเซทิริซีน (CHEMBL1000) ต่อตัวรับฮิสตามีน H1 ของมนุษย์ (CHEMBL231) อะไรบ้าง"

```
https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/activity.json?molecule_chembl_id=CHEMBL1000&target_chembl_id=CHEMBL231&pchembl_value__isnull=false
```

ผลลัพธ์จริง (ตัดเหลือสองจาก 12 รายการที่ได้):

```
{"activities": [
  {"standard_type": "Ki", "standard_value": "14.0", "standard_units": "nM",
   "pchembl_value": "7.85", "target_pref_name": "Histamine H1 receptor"},
  {"standard_type": "Ki", "standard_value": "5.89", "standard_units": "nM",
   "pchembl_value": "8.23", "target_pref_name": "Histamine H1 receptor"}]}
```

### PubChem กับ ChEMBL: ต่างกันอย่างไร

**PubChem กว้าง ChEMBL ลึก** PubChem พยายามรวมสารเคมีทุกตัวที่เคยมีผู้ฝากไว้ จึงเป็นที่ที่ดีที่สุดในการระบุสารประกอบ ChEMBL มีสารประกอบน้อยกว่ามาก แต่คัดสรรฤทธิ์ทางชีวภาพในรูปแบบที่สม่ำเสมอ (หน่วยมาตรฐาน ค่า pChEMBL เป้าหมายที่จับคู่แล้ว) จึงเหมาะกว่าสำหรับคำถาม "แรงแค่ไหน และออกฤทธิ์กับอะไร" ในทางปฏิบัติคุณใช้ทั้งสอง: PubChem เพื่อยืนยันโครงสร้างและตัวระบุ ChEMBL เพื่ออ่านข้อมูลทางเภสัชวิทยา

## ChEBI คืออะไร พจนานุกรมโมเลกุลขนาดเล็กที่คัดสรรแล้ว

**ChEBI (Chemical Entities of Biological Interest) เป็นพจนานุกรมและออนโทโลยีของโมเลกุลขนาดเล็กที่คัดสรรด้วยมือ ดำเนินการโดย EMBL-EBI** รายการที่คัดสรรแล้วมีคำนิยาม โครงสร้าง ชื่อพ้อง และลิงก์ออนโทโลยีที่บอกว่าโมเลกุล*คือ*อะไร (เช่น "a member of the class of benzoic acids") และมี*บทบาท*อะไร (เช่น "non-steroidal anti-inflammatory drug")

- **ขนาด:** 201,471 รายการ ในจำนวนนี้ 61,961 รายการเป็นรายการ "3 ดาว" ที่คัดสรรครบถ้วน (รุ่น 244 รายงานในบทความ *Nucleic Acids Research* ปี 2026)
- **ใช้สำหรับ:** การตั้งชื่อและจัดประเภทที่สม่ำเสมอ การระบุข้อมูลเมแทบอโลมิกส์และชีววิทยาระบบ และการสอนหมู่ฟังก์ชันและประเภทของสารประกอบ
- **การเข้าถึง:** ChEBI 2.0 (เปิดตัวตุลาคม 2025) มีเว็บไซต์และ REST API ใหม่ บริการ SOAP เดิมถูกยกเลิกแล้ว
- **ไลเซนส์:** CC BY 4.0

**คำถามภาษาธรรมดา:** "CHEBI:15365 คืออะไร"

```
https://www.ebi.ac.uk/chebi/backend/api/public/compound/CHEBI:15365/
```

ผลลัพธ์คืน `"name": "acetylsalicylic acid"` สูตร `C9H8O4` มวลโมโนไอโซโทปิก `180.04226` และข้อความคำนิยาม การค้นหาด้วยข้อความก็ใช้ได้: `https://www.ebi.ac.uk/chebi/backend/api/public/es_search/?term=aspirin`

## ZINC คืออะไร สารประกอบหลายพันล้านตัวสำหรับการคัดกรองเสมือน

**ZINC เป็นฐานข้อมูลฟรีของสารประกอบที่หาซื้อได้ ("tangible") ที่เตรียมไว้สำหรับการคัดกรองเสมือน สร้างโดยห้องปฏิบัติการของ Irwin และ Shoichet ที่ UCSF** ZINC-22 เน้นแคตตาล็อกแบบสั่งผลิตตามต้องการขนาดใหญ่จาก Enamine, WuXi และ Mcule ส่วนฐานข้อมูลพี่น้อง ZINC20 ครอบคลุมแคตตาล็อกที่มีสินค้าในสต็อกขนาดเล็กกว่า ZINC15 เป็นรุ่นเก่าที่[บทเรียน](https://www.moldraw.com/learn/)หลายแห่งยังกล่าวถึง

- **ขนาด:** ประมาณ 54.9 พันล้านโมเลกุลในรูป 2D และ 5.9 พันล้านในรูป 3D ที่พร้อมทำ docking (หน้าแรก CartBlanche22 ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026) [บทความ ZINC-22](https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c01253) รายงาน 37 พันล้านโมเลกุล 2D ณ วันตีพิมพ์ ซึ่งแสดงว่าเติบโตเร็วเพียงใด
- **ใช้สำหรับ:** งาน docking การหาสารอนุพันธ์ที่ซื้อได้ และการดาวน์โหลดไฟล์ 3D ที่พร้อมทำ docking พร้อมประจุและคอนฟอร์เมชัน
- **ผู้ใช้:** นักเคมีคำนวณ นักชีววิทยาโครงสร้าง และกลุ่มคัดกรองในสถาบันการศึกษา
- **การเข้าถึง:** หน้าเว็บ CartBlanche (ค้นหาด้วยความคล้ายคลึง โครงสร้างย่อย และ ID) การดาวน์โหลดจำนวนมาก และสำเนาบนคลาวด์
- **ไลเซนส์:** "free to use and download for everyone" ห้ามแจกจ่ายส่วนสำคัญต่อโดยไม่ได้รับอนุญาตเป็นลายลักษณ์อักษร (ไลเซนส์ UCSF ZINC)

**คำถามภาษาธรรมดา:** "หาสารประกอบที่ซื้อได้ซึ่งคล้ายกับเซทิริซีน" วาง SMILES `OC(=O)COCCN1CCN(CC1)C(c1ccccc1)c1ccc(Cl)cc1` ลงในการค้นหาความคล้ายคลึงที่ [cartblanche22.docking.org](https://cartblanche22.docking.org/)

**หมายเหตุตามจริง:** ระหว่างเขียนคู่มือนี้ เราไม่สามารถเขียนสคริปต์ค้นหา ZINC ได้อย่างเสถียร หน้า ZINC15/ZINC20 มี captcha และงานค้นหา CartBlanche22 ที่เราส่งผ่านโปรแกรมได้ผลว่างเปล่า หน้าเว็บจึงเป็นช่องทางที่แนะนำสำหรับผู้ใช้ส่วนใหญ่

## RCSB PDB คืออะไร โครงสร้าง 3 มิติของโปรตีนและลิแกนด์

**Protein Data Bank (PDB) เป็นคลังข้อมูลเดียวของโลกสำหรับโครงสร้าง 3 มิติที่ได้จากการทดลองของโปรตีน กรดนิวคลีอิก และสารเชิงซ้อนของพวกมัน RCSB PDB เป็นศูนย์ข้อมูลและพอร์ทัลค้นหาของสหรัฐฯ** สำหรับนักเคมี คุณค่าอยู่ที่ลิแกนด์ที่จับอยู่: คุณเห็นได้ชัดว่าโมเลกุลขนาดเล็กอยู่ในช่องจับอย่างไร

- **ขนาด:** 260,724 รายการปัจจุบัน (RCSB holdings API ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026)
- **ใช้สำหรับ:** ศึกษารูปแบบการจับ เตรียมตัวรับสำหรับ docking สอนโครงสร้างโปรตีน และหาทุกโครงสร้างที่มีลิแกนด์ที่กำหนด
- **การเข้าถึง:** เว็บ Data API (`data.rcsb.org`) และ Search API (`search.rcsb.org`) ซึ่งรองรับการค้นหาด้วยข้อความ ลำดับ และสารเคมี
- **ไลเซนส์:** ข้อมูล PDB เผยแพร่ภายใต้ CC0 1.0 (สาธารณสมบัติ)

**คำถามภาษาธรรมดา:** "แสดงข้อมูลลิแกนด์ของแอสไพริน (component ID `AIN`)"

```
https://data.rcsb.org/rest/v1/core/chemcomp/AIN
```

ผลลัพธ์คืนชื่อ `2-(ACETYLOXY)BENZOIC ACID` และสูตร `C9 H8 O4`

**คำถามภาษาธรรมดา:** "รายการ PDB ใดมีแอสไพริน" (Search API วางลงในเบราว์เซอร์ ซึ่งจะเข้ารหัส JSON ใน URL ให้):

```
https://search.rcsb.org/rcsbsearch/v2/query?json={"query":{"type":"terminal","service":"text","parameters":{"attribute":"rcsb_nonpolymer_instance_annotation.comp_id","operator":"exact_match","value":"AIN"}},"return_type":"entry"}
```

ผลลัพธ์จริง (ตัดบางส่วน): `"total_count": 8` พร้อมรายการอย่าง `1OXR`, `1TGM` และ `3GCL` การค้นหาทางเคมีที่ส่ง SMILES ของแอสไพริน (`service: "chemical"`) ก็ได้ `AIN` เป็นผลที่ตรงที่สุดเช่นกัน คุณโหลดรายการใดก็ได้ด้วย PDB ID ใน[โปรแกรมดูโปรตีนของ MolDraw](https://www.moldraw.com/th/tools/protein-viewer/) หรือเปิดที่ rcsb.org

## UniChem คืออะไร การแปลง ID ระหว่างฐานข้อมูล

**UniChem เป็นบริการอ้างอิงข้ามตัวระบุของ EMBL-EBI: ให้ตัวระบุโครงสร้างหนึ่งตัว แล้วจะคืน ID ที่ตรงกันในฐานข้อมูลอื่น** เชื่อมโยงข้อมูลผ่าน InChI/InChIKey มาตรฐาน จึงใช้ได้ทุกครั้งที่ฐานข้อมูลสองแห่งมีโครงสร้างเดียวกัน

- **ขนาด:** 25 แหล่งที่ UniChem API แสดงไว้ รวมถึง ChEMBL, PubChem, ChEBI, DrugBank, RCSB PDB, PDBe, SureChEMBL, HMDB, BindingDB และ nmrshiftdb2 (ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026)
- **ใช้สำหรับ:** รวมชุดข้อมูล ข้ามจาก ChEMBL ID ไปยังรหัสลิแกนด์ใน PDB และตรวจว่าสารประกอบปรากฏที่ใดอีกบ้าง
- **การเข้าถึง:** เว็บและ REST API (`/unichem/api/v1/`)
- **ไลเซนส์:** ใช้ฟรีตามเงื่อนไขการใช้งานของ EMBL-EBI ข้อมูลเบื้องหลัง ID ที่จับคู่แต่ละตัวยังคงไลเซนส์ของแหล่งต้นทาง

**คำถามภาษาธรรมดา:** "InChIKey ของแอสไพรินปรากฏที่ใดอีกบ้าง"

```
curl -X POST https://www.ebi.ac.uk/unichem/api/v1/compounds \
  -H "Content-Type: application/json" \
  -d '{"type":"inchikey","compound":"BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N"}'
```

ผลลัพธ์จับคู่กับ `CHEMBL25`, `CHEBI:15365`, PubChem CID `2244`, DrugBank `DB00945`, ลิแกนด์ PDB `AIN` และ Guide to Pharmacology `4139` เป็นต้น

UniChem จับคู่ InChIKey ของแอสไพรินกับ ID ใน ChEMBL, ChEBI, PubChem, RCSB PDB, DrugBank และ Guide to Pharmacology

## nmrshiftdb2 คืออะไร ฐานข้อมูลสเปกตรัม NMR ฟรี

**nmrshiftdb2 เป็นฐานข้อมูลเว็บแบบเปิดที่ผ่านการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิ รวบรวมโครงสร้างอินทรีย์และสเปกตรัม NMR พร้อมการทำนายค่าการเลื่อนทางเคมี ¹H และ ¹³C ในตัว** แกนหลักคือสเปกตรัมที่ระบุสัญญาณครบถ้วน หลายรายการมีข้อมูลดิบด้วย

- **ขนาด:** 271,817 โครงสร้าง สเปกตรัมที่วัดได้ 70,030 สเปกตรัม และสเปกตรัมที่คำนวณ 396,583 สเปกตรัม (ตัวนับบนหน้าแรก ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026)
- **ใช้สำหรับ:** ตรวจการระบุสัญญาณ หาค่าการเลื่อนทางเคมีอ้างอิงของสารแต่ละประเภท และสอนการแปลผล NMR
- **การเข้าถึง:** ค้นหาบนเว็บด้วยโครงสร้าง โครงสร้างย่อย สเปกตรัม และสมบัติอื่น เว็บไซต์ประกาศอินเทอร์เฟซ REST ใหม่ในเดือนมิถุนายน 2026 (เราไม่ได้ทดสอบ)
- **ไลเซนส์:** ซอฟต์แวร์เป็นโอเพนซอร์ส และข้อมูลเผยแพร่ภายใต้ไลเซนส์เนื้อหาแบบเปิด

**คำถามภาษาธรรมดา:** "หาสเปกตรัม ¹³C ที่วัดได้ของสารที่มีหมู่ 4-chlorobenzhydryl" วาดชิ้นส่วนในแท็บค้นหาของ nmrshiftdb2 แล้วค้นหาโครงสร้างย่อย หากต้องการค่าประมาณก่อนค้นหา เครื่องมือ[โครงสร้างเป็น NMR](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/structure-to-nmr.html)ของ MolDraw ทำนายสเปกตรัมจากภาพวาดของคุณได้

## MassBank คืออะไร สเปกตรัม MS/MS จากการทดลอง

**MassBank เป็นคลังแมสสเปกตรัมจากการทดลองของโมเลกุลขนาดเล็กแบบเปิด ที่ห้องปฏิบัติการทั่วโลกร่วมให้ข้อมูล** ตัวอย่างในที่นี้ใช้ MassBank Europe (massbank.eu) แต่ละรายการอธิบายสเปกตรัมหนึ่งสเปกตรัม: สารประกอบ เครื่องมือ การทำให้เป็นไอออน พลังงานการชน และรายการพีก

- **ขนาด:** 139,006 รายการ (จำนวนจาก MassBank API ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026)
- **ใช้สำหรับ:** ระบุสารที่ไม่ทราบใน LC-MS/MS และเมแทบอโลมิกส์ เปรียบเทียบรูปแบบการแตกตัว และสอนแมสสเปกโทรเมทรี
- **การเข้าถึง:** ค้นหาบนเว็บ (ชื่อ สูตร พีก) และ REST API
- **ไลเซนส์:** แต่ละรายการมีไลเซนส์ Creative Commons ของตัวเอง (ค่าเริ่มต้นคือ CC BY แต่บางรายการเป็น CC0, CC BY-SA หรือไม่ใช่เชิงพาณิชย์) จึงควรตรวจฟิลด์ `license` ก่อนนำไปใช้ต่อ

**คำถามภาษาธรรมดา:** "แสดงรายการสเปกตรัม MassBank ของคาเฟอีน"

```
https://massbank.eu/MassBank-api/records/search?compound_name=caffeine
```

ได้ accession 134 รายการ เมื่อเรียกดูหนึ่งรายการ `https://massbank.eu/MassBank-api/records/MSBNK-ACES_SU-AS000088` จะได้สเปกตรัม LC-APCI Orbitrap MS2 ของ [M+H]⁺ ที่มีไอออนตั้งต้นที่ *m/z* 195.088 และชิ้นส่วนหลักที่ *m/z* 138.067 ภายใต้ไลเซนส์ CC BY

## COCONUT คืออะไร ฐานข้อมูลผลิตภัณฑ์ธรรมชาติแบบเปิด

**COCONUT (COlleCtion of Open NatUral producTs) เป็นคอลเลกชันโครงสร้างผลิตภัณฑ์ธรรมชาติแบบเปิดที่ใหญ่ที่สุด คัดสรรโดยกลุ่มของ Steinbeck ที่ Friedrich Schiller University Jena** รุ่น 2.0 เชื่อมแต่ละโมเลกุลกับสิ่งมีชีวิตต้นกำเนิด เอกสารอ้างอิง และรูปแบบสเตอริโอเคมี

- **ขนาด:** 738,829 โมเลกุลที่ไม่ซ้ำกันจาก 71 คอลเลกชัน พร้อมสิ่งมีชีวิต 73,137 ชนิด (หน้าสถิติของ COCONUT ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026) [บทความ COCONUT 2.0](https://doi.org/10.1093/nar/gkae1063) รายงาน 695,133 โมเลกุล ณ รุ่นเดือนกันยายน 2024
- **ใช้สำหรับ:** การระบุผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่รู้จักแล้ว (dereplication) แนวคิดโครงหลัก และการสร้างชุดสารสำหรับคัดกรอง
- **การเข้าถึง:** ค้นหาบนเว็บ (ชื่อ โครงสร้าง โครงสร้างย่อย ความคล้ายคลึง) และดาวน์โหลด SDF/SQL ทั้งหมด มี REST API แต่ต้องเข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรี เราจึงไม่ได้ทดลองสำหรับคู่มือนี้
- **ไลเซนส์:** ข้อมูล CC0 โค้ด MIT

**คำถามภาษาธรรมดา:** "แสดงผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่คล้ายคาเฟอีน" วาง SMILES ของคาเฟอีน `CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C` ลงในการค้นหาโครงสร้างที่ [coconut.naturalproducts.net](https://coconut.naturalproducts.net/search)

## SureChEMBL คืออะไร เคมีจากสิทธิบัตร

**SureChEMBL เป็นฐานข้อมูลเคมีจากสิทธิบัตรฟรีของ EMBL-EBI: สกัดข้อความและภาพจากเอกสารสิทธิบัตร แล้วดึงโครงสร้างเคมีที่กล่าวถึง** เป็นวิธีฟรีที่ง่ายที่สุดในการถามว่า "สิทธิบัตรใดมีโครงสร้างนี้"

- **ขนาด:** SureChEMBL 2.0 (พ.ค. 2025) ครอบคลุมเอกสารสิทธิบัตรประมาณ 116.6 ล้านฉบับจากห้าหน่วยงาน (CNIPA, EPO, JPO, USPTO, WIPO) USPTO เพียงแห่งเดียวให้สารประกอบที่ไม่ซ้ำกันประมาณ 19.9 ล้านตัว
- **ใช้สำหรับ:** ตรวจงานที่มีมาก่อน สำรวจภาพรวมสิทธิบัตร และสังเกตชุดสารประกอบก่อนที่จะปรากฏในวารสาร
- **การเข้าถึง:** ค้นหาบนเว็บด้วยโครงสร้างหรือคำค้น REST API และไฟล์ Parquet จำนวนมากที่อัปเดตทุกสองสัปดาห์
- **ไลเซนส์:** CC BY 4.0

**คำถามภาษาธรรมดา:** "แปลงชื่อเซทิริซีนเป็นสารประกอบใน SureChEMBL"

```
https://www.surechembl.org/api/chemical/name/cetirizine
```

ผลลัพธ์จริง (ตัดบางส่วน): `"chemical_id": "4176"`, `"inchi_key": "ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N"` จากนั้นคุณค้นหาสิทธิบัตรที่มีโครงสร้างนั้นในหน้าเว็บได้

## แล้ว DrugBank และ NIST Chemistry WebBook ล่ะ

**DrugBank** เป็นฐานความรู้โดยละเอียดของยาที่ได้รับอนุมัติและยาที่อยู่ระหว่างวิจัย เป้าหมาย เมแทบอลิซึม และอันตรกิริยาของยา เข้าชมได้ฟรี แต่การดาวน์โหลดต้องมีบัญชี ชุดข้อมูลวิชาการใช้ไลเซนส์ CC BY-NC 4.0 สำหรับการใช้ที่ไม่ใช่เชิงพาณิชย์ และการใช้เชิงพาณิชย์ต้องซื้อไลเซนส์ ให้ถือว่า "อ่านฟรี แต่นำไปใช้ต่อไม่ฟรี"

**NIST Chemistry WebBook** (NIST Standard Reference Database 69) มีข้อมูลอุณหเคมี สเปกตรัม IR ในสถานะแก๊ส และแมสสเปกตรัมแบบ electron ionisation ของโมเลกุลขนาดเล็กจำนวนมาก ค้นหาออนไลน์ได้ฟรี เช่น `https://webbook.nist.gov/cgi/cbook.cgi?Name=caffeine&Units=SI` แต่ข้อมูลมีลิขสิทธิ์ และการแจกจ่ายต่อจำนวนมากต้องได้รับอนุญาตจาก NIST

## ควรใช้ฐานข้อมูลเคมีใด

| คำถามของคุณ | เริ่มที่ | แล้วลอง |
| --- | --- | --- |
| สารนี้คืออะไร ชื่อ สูตร CAS สมบัติ | PubChem | ChEBI |
| แรงแค่ไหน และออกฤทธิ์กับเป้าหมายใด | ChEMBL | PubChem BioAssay |
| อยู่ในประเภทใด และมีบทบาททางชีวภาพอะไร | ChEBI | PubChem |
| มีสารคล้ายกันใดที่ซื้อหรือทำ docking ได้ | ZINC-22 | PubChem (ผู้จำหน่าย) |
| ลิแกนด์จับกับโปรตีนอย่างไร | RCSB PDB | ChEMBL (ข้อมูลเป้าหมาย) |
| ฉันมี ID จากฐานข้อมูล A ใน ฐานข้อมูล B คือ ID อะไร | UniChem | การอ้างอิงข้ามของ PubChem |
| ¹H/¹³C NMR ของสารนี้ควรมีลักษณะอย่างไร | nmrshiftdb2 | การทำนาย NMR ของ MolDraw |
| สเปกตรัม MS/MS ของฉันตรงกับสารที่รู้จักหรือไม่ | MassBank | NIST WebBook (EI-MS) |
| เป็นผลิตภัณฑ์ธรรมชาติหรือไม่ และมาจากสิ่งมีชีวิตใด | COCONUT | ChEBI |
| โครงสร้างนี้อยู่ในสิทธิบัตรหรือไม่ | SureChEMBL | PubChem Patent |
| รายละเอียดของยาที่ได้รับอนุมัติ | DrugBank (เข้าชม) | ChEMBL |
| อุณหเคมีหรือ IR อ้างอิง | NIST WebBook | PubChem |

## จะใช้ฐานข้อมูลเหล่านี้กับ MolDraw อย่างไร

ฐานข้อมูลส่วนใหญ่ค้นหาได้ดีที่สุดด้วยตัวระบุที่เครื่องอ่านได้มากกว่าชื่อ MolDraw ให้ตัวระบุเหล่านั้นได้จากภาพวาดโดยตรง:

1. **วาด**โครงสร้างใน[ตัวแก้ไข MolDraw](https://www.moldraw.com/th/) (หรือวางชื่อด้วยเครื่องมือ[ชื่อเป็นโครงสร้าง](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/name-to-structure.html))
2. **Copy SMILES** จากแถวตัวเลือกด้านบน *Copy as…* ในเมนูบริบทยังให้รูปแบบ InChI และ MOL (ดู[บท SMILES ในคอร์ส MolDraw](https://www.moldraw.com/docs/import-export/how-to-copy-and-paste-smiles-inchi-and-mol/))
3. **สร้าง InChIKey** ด้วย[เครื่องมือแปลง SMILES เป็น InChIKey](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/smiles-to-inchikey-converter.html) InChIKey เป็นคีย์สำหรับจับคู่แบบตรงทุกประการที่เชื่อถือได้ที่สุดใน PubChem, ChEMBL, ChEBI และ UniChem
4. **ค้นหา**: วาง SMILES ในช่องค้นหาโครงสร้างของฐานข้อมูล หรือใส่ InChIKey ลงใน URL REST ด้านบน
5. **นำผลลัพธ์กลับมา**: แปลง PubChem CID ด้วย[เครื่องมือแปลง CID เป็น SMILES](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/cid-to-smiles-converter.html) หรือ InChIKey ด้วย[InChIKey เป็น SMILES](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/inchikey-to-smiles-converter.html) แล้ววางลงใน MolDraw เพื่อแก้ไข

ขั้นตอน: วาดใน MolDraw คัดลอก SMILES หรือสร้าง InChIKey ค้นหาในฐานข้อมูล แล้วอ่านผลลัพธ์

## ตัวอย่างเฉลย: จะเปรียบเทียบอนุพันธ์ของเซทิริซีนได้อย่างไร

สมมติว่าคุณศึกษายาแก้แพ้**เซทิริซีน**และอยากรู้ว่ามีอนุพันธ์ใกล้เคียงอะไรบ้าง แรงแค่ไหน และซื้อตัวใหม่ได้หรือไม่ นี่คือขั้นตอนที่ใช้สามฐานข้อมูล ทุกตัวเลขมาจากการค้นหาจริงที่เราทำ

**ขั้นที่ 1: ระบุสารใน PubChem** วาดเซทิริซีนใน MolDraw คัดลอก SMILES แล้วค้นหา:

```
https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/name/cetirizine/property/MolecularFormula,MolecularWeight,InChIKey,XLogP,TPSA/JSON
```

PubChem คืน CID 2678, C21H25ClN2O3, MW 388.9, XLogP 1.7, TPSA 53 และ InChIKey `ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N`

**ขั้นที่ 2: หาอนุพันธ์ใน PubChem** การค้นหาความคล้ายคลึง 2D (เกณฑ์ 90) คืนสารที่ใกล้เคียง รวมถึงไฮดรอกซีซีน (CID 3658 ยาต้นกำเนิดของเซทิริซีน) และเลโวเซทิริซีน (CID 1549000 อิแนนทิโอเมอร์เดี่ยวของมัน) พร้อมเกลือของสารเหล่านั้น การค้นหาโครงสร้างย่อยบนแกน chlorobenzhydryl-piperazine เพิ่มคลอร์ไซคลิซีน เมคลิซีน และบิวคลิซีน

**ขั้นที่ 3: เปรียบเทียบฤทธิ์ใน ChEMBL** ค้นหา InChIKey ใน ChEMBL:

```
https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/molecule.json?molecule_structures__standard_inchi_key=ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N
```

ได้ `CHEMBL1000` (max phase 4 อนุมัติครั้งแรกปี 1995) ข้อมูลฤทธิ์รวมถึงค่า Ki ต่อตัวรับ H1 ของมนุษย์ระหว่าง 5.89 ถึง 79 nM (pChEMBL 7.1–8.2) และ IC50 ต่อ hERG (KCNH2) ที่อ่อนกว่ามากประมาณ 30 µM (pChEMBL ประมาณ 4.5) ช่วงห่างราวสามลำดับขนาดนี้คือการเปรียบเทียบความจำเพาะแบบที่ ChEMBL ทำได้ง่าย การค้นหาความคล้ายคลึง `https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/similarity/ZKLPARSLTMPFCP-UHFFFAOYSA-N/80.json` แสดงเลโวเซทิริซีนและรูปเกลือของเซทิริซีนให้เปรียบเทียบแบบเดียวกัน

**ขั้นที่ 4: หาอนุพันธ์ที่ซื้อได้ใน ZINC** วาง SMILES ลงในการค้นหาความคล้ายคลึงของ CartBlanche22 เพื่อดูสารแบบสั่งผลิตที่เปลี่ยนสายข้างที่เป็นกรดหรือวงแอริล แล้วตรวจสมบัติของสารที่น่าสนใจใน MolDraw เช่น ด้วย[เครื่องคำนวณกฎของ Lipinski](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/lipinski-rule-calculator.html)

**เคล็ดลับการแปลผล:** ค่าฤทธิ์จากบทความต่างกันวัดด้วยการทดสอบต่างกัน ให้เปรียบเทียบค่า pChEMBL ของเป้าหมายและประเภทการทดสอบเดียวกัน และระวังค่าที่วัดเพียงครั้งเดียว

## จะค้นหาฐานข้อมูลเคมีให้ได้ผลดีได้อย่างไร

- **ใช้ InChIKey สำหรับการจับคู่แบบตรงทุกประการ** และ SMILES สำหรับการค้นหาความคล้ายคลึงหรือโครงสร้างย่อย ชื่อมักกำกวม ("vitamin C" เกลือ ชื่อการค้า)
- **ระวังเกลือและสเตอริโอไอโซเมอร์** เซทิริซีน เซทิริซีนไดไฮโดรคลอไรด์ และเลโวเซทิริซีน เป็นคนละรายการในทุกฐานข้อมูล
- **บันทึกรุ่นหรือวันที่** อ้างอิง ChEMBL พร้อมหมายเลขรุ่น และบันทึกวันที่ที่คุณค้นหาใน PubChem
- **เคารพขีดจำกัดอัตราการเรียก** PubChem ขอไม่เกิน 5 คำขอต่อวินาที ให้รวมงานใหญ่เป็นชุดหรือดาวน์โหลดไฟล์ทั้งหมด
- **ตรวจไลเซนส์ก่อนแจกจ่ายต่อ** การเข้าชมใช้ฟรีทุกแห่งในคู่มือนี้ แต่การเผยแพร่ข้อมูลซ้ำไม่ได้ฟรีเสมอไป

### ประเด็นสำคัญ

- **PubChem** เป็นฐานข้อมูลเคมีฟรีที่ใหญ่ที่สุด และเป็นจุดแรกที่ดีที่สุดในการระบุสารประกอบ
- **ChEMBL** เป็นฐานข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพฟรีที่ดีที่สุด: ข้อมูลความแรงที่คัดสรรแล้วเชื่อมกับเป้าหมาย
- **ChEBI** จัดประเภทโมเลกุล **UniChem** แปลง ID ระหว่างฐานข้อมูล
- **ZINC-22** สำหรับการคัดกรองเสมือนและการซื้อสารอนุพันธ์ **RCSB PDB** สำหรับรูปแบบการจับแบบ 3 มิติ
- **nmrshiftdb2**, **MassBank** และ **NIST WebBook** ครอบคลุม NMR, MS/MS และ IR/อุณหเคมี
- **COCONUT** ครอบคลุมผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ และ **SureChEMBL** ครอบคลุมสิทธิบัตร
- วาดใน MolDraw คัดลอก SMILES สร้าง InChIKey แล้วคุณก็ค้นหาได้ทุกแห่ง

## คำถามพบบ่อย

### ฐานข้อมูลเคมีฟรีที่ใหญ่ที่สุดคืออะไร

PubChem เป็นฐานข้อมูลเคมีฟรีที่ใหญ่ที่สุด มีสารประกอบที่ไม่ซ้ำกันประมาณ 124 ล้านรายการและสารที่ถูกฝากไว้ 349 ล้านรายการ (ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026) ZINC-22 มีโมเลกุลมากกว่า (ประมาณ 54.9 พันล้าน) แต่ส่วนใหญ่เป็นสารประกอบเสมือนแบบสั่งผลิตตามต้องการสำหรับการคัดกรอง ไม่ใช่สารที่ผ่านการพิสูจน์ลักษณะแล้ว

### PubChem กับ ChEMBL ต่างกันอย่างไร

PubChem เป็นแหล่งรวบรวมข้อมูลขนาดใหญ่ที่พยายามครอบคลุมสารเคมีทุกตัวที่มีผู้ฝากไว้ จึงเหมาะที่สุดสำหรับการระบุสารและหาสมบัติ ChEMBL มีขนาดเล็กกว่าแต่คัดสรรด้วยมือสำหรับข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพ มีค่าความแรงที่เป็นมาตรฐานเชื่อมกับเป้าหมาย จึงเหมาะที่สุดสำหรับคำถามเรื่องความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างกับฤทธิ์และการค้นพบยา

### ZINC ใช้เชิงพาณิชย์ได้ฟรีหรือไม่

ตามไลเซนส์ UCSF ZINC ทุกคนใช้และดาวน์โหลด ZINC ได้ฟรี รวมถึงบริษัท ข้อจำกัดอยู่ที่การแจกจ่ายต่อ: คุณไม่สามารถแจกจ่ายส่วนสำคัญของ ZINC ต่อได้หากไม่ได้รับอนุญาตเป็นลายลักษณ์อักษรจากทีม ZINC ส่วนตัวสารประกอบต้องซื้อจากผู้จำหน่ายที่ระบุไว้

### ฐานข้อมูลฟรีใดมีสเปกตรัม NMR

nmrshiftdb2 เป็นฐานข้อมูล NMR ฟรีหลัก มีสเปกตรัมที่วัดได้ 70,030 สเปกตรัมสำหรับ 271,817 โครงสร้าง (ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026) พร้อมการทำนาย ¹H และ ¹³C ในตัว หน้าสารประกอบของ PubChem ยังลิงก์ไปยังสเปกตรัมจากแหล่งอื่น ส่วน NIST Chemistry WebBook ครอบคลุมสเปกตรัม IR และแมส ไม่ใช่ NMR

### ฐานข้อมูลฟรีใดมีแมสสเปกตรัม

MassBank มีข้อมูลแมสสเปกตรัมจากการทดลอง 139,006 รายการ (ตรวจสอบเมื่อตุลาคม 2026) ส่วนใหญ่เป็นสเปกตรัม MS/MS ของโมเลกุลขนาดเล็ก ภายใต้ไลเซนส์ Creative Commons รายรายการ NIST Chemistry WebBook มีแมสสเปกตรัมแบบ electron ionisation ของโมเลกุลขนาดเล็กจำนวนมากให้ดูออนไลน์

### ค้นหาฐานข้อมูลเคมีด้วยโครงสร้างได้หรือไม่

ได้ PubChem, ChEMBL, ChEBI, ZINC, RCSB PDB, nmrshiftdb2, COCONUT และ SureChEMBL ล้วนรองรับการค้นหาด้วยโครงสร้าง โดยมักวาดหรือวาง SMILES คุณวาดโมเลกุลใน MolDraw คัดลอก SMILES แล้ววางในช่องค้นหาโครงสร้างของฐานข้อมูล หรือใช้การค้นหาแบบตรงทุกประการ โครงสร้างย่อย หรือความคล้ายคลึงผ่าน API ได้

### ฐานข้อมูลเคมีใดดีที่สุดสำหรับนักเรียน

เริ่มจาก PubChem สำหรับชื่อ สมบัติ และข้อมูลความปลอดภัย ChEBI สำหรับคำนิยามและประเภทของสารประกอบ และ RCSB PDB สำหรับโครงสร้าง 3 มิติ ทั้งสามใช้ฟรี ไม่ต้องมีบัญชี และมีหน้าเว็บที่ใช้งานง่าย เพิ่ม ChEMBL เมื่อเรียนเภสัชวิทยา และ nmrshiftdb2 เมื่อเรียน NMR

### ฐานข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพคืออะไร

ฐานข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพเก็บผลที่วัดได้ของสารประกอบต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น ค่า IC50, Ki หรือ EC50 ที่เชื่อมกับการทดสอบและโปรตีน ChEMBL เป็นฐานข้อมูลฤทธิ์ทางชีวภาพฟรีชั้นนำ ส่วน PubChem BioAssay เก็บผลการคัดกรองที่ห้องปฏิบัติการและศูนย์คัดกรองฝากไว้

### DrugBank ใช้ฟรีหรือไม่

DrugBank เปิดให้เข้าชมออนไลน์ฟรี และผู้ใช้ทางวิชาการดาวน์โหลดชุดข้อมูลภายใต้ไลเซนส์ CC BY-NC 4.0 ได้หลังลงทะเบียน การใช้เชิงพาณิชย์ รวมถึงการใช้ในผลิตภัณฑ์หรือบริการเชิงพาณิชย์ ต้องซื้อไลเซนส์จาก DrugBank

### จะแปลง PubChem CID เป็น ChEMBL ID ได้อย่างไร

ใช้ UniChem หา InChIKey ของสารประกอบ (PubChem แสดงไว้ทุกหน้าสารประกอบ) แล้วส่งไปยัง API compounds ของ UniChem ซึ่งจะคืนตัวระบุ ChEMBL, ChEBI, DrugBank, PDB และอื่น ๆ ที่ตรงกัน สำหรับแอสไพริน InChIKey BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N จับคู่ CID 2244 กับ CHEMBL25

## แหล่งอ้างอิง

- PubChem: [pubchem.ncbi.nlm.nih.gov](https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/) · [เอกสาร PUG-REST](https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/docs/pug-rest) · Kim S. *et al.* PubChem 2025 update, *Nucleic Acids Res.* 2025, [doi:10.1093/nar/gkae1059](https://doi.org/10.1093/nar/gkae1059)
- ChEMBL: [ebi.ac.uk/chembl](https://www.ebi.ac.uk/chembl/) · [เอกสาร API](https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/docs) · [ไลเซนส์และข้อมูลเกี่ยวกับ](https://chembl.gitbook.io/chembl-interface-documentation/about) · [โพสต์ประกาศ ChEMBL 37](https://chembl.blogspot.com/2026/05/chembl-37-is-here-bigger-cleaner-and.html)
- ChEBI: [ebi.ac.uk/chebi](https://www.ebi.ac.uk/chebi/) · [การเปิดตัว ChEBI 2.0](https://www.ebi.ac.uk/about/news/updates-from-data-resources/chebi-2-0-launches/) · ChEBI: re-engineered for a sustainable future, *Nucleic Acids Res.* 2026, [academic.oup.com/nar/article/54/D1/D1768/8349173](https://academic.oup.com/nar/article/54/D1/D1768/8349173)
- ZINC: [CartBlanche22](https://cartblanche22.docking.org/) · Tingle B. I. *et al.* ZINC-22, *J. Chem. Inf. Model.* 2023, [doi:10.1021/acs.jcim.2c01253](https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c01253) · [ไลเซนส์ UCSF ZINC](https://wiki.docking.org/index.php?title=UCSF_ZINC_License)
- RCSB PDB: [rcsb.org](https://www.rcsb.org/) · [Data API](https://data.rcsb.org/) · [Search API](https://search.rcsb.org/) · [นโยบายการใช้งาน](https://www.rcsb.org/pages/usage-policy)
- UniChem: [ebi.ac.uk/unichem](https://www.ebi.ac.uk/unichem/) · [เอกสาร API](https://www.ebi.ac.uk/unichem/api/docs)
- nmrshiftdb2: [nmrshiftdb.nmr.uni-koeln.de](https://nmrshiftdb.nmr.uni-koeln.de/)
- MassBank: [massbank.eu](https://massbank.eu/MassBank/) · [MassBank API](https://massbank.eu/MassBank-api/) · [รูปแบบรายการและไลเซนส์](https://github.com/MassBank/MassBank-web/blob/main/Documentation/MassBankRecordFormat.md)
- COCONUT: [coconut.naturalproducts.net](https://coconut.naturalproducts.net/) · Chandrasekhar V. *et al.* COCONUT 2.0, *Nucleic Acids Res.* 2025, [doi:10.1093/nar/gkae1063](https://doi.org/10.1093/nar/gkae1063)
- SureChEMBL: [surechembl.org](https://www.surechembl.org/) · [ประกาศ SureChEMBL 2.0](https://www.ebi.ac.uk/about/news/updates-from-data-resources/surechembl-2-0-is-here/) · [คำถามพบบ่อยและไลเซนส์](https://chembl.gitbook.io/surechembl/faq)
- DrugBank: [go.drugbank.com](https://go.drugbank.com/) · [ไลเซนส์สำหรับงานวิชาการ](https://www.drugbank.com/academic_research)
- NIST Chemistry WebBook: [webbook.nist.gov/chemistry](https://webbook.nist.gov/chemistry/) · [ไลเซนส์ NIST SRD](https://www.nist.gov/open/license)

## เครื่องมือและคู่มือ MolDraw ที่เกี่ยวข้อง

[ตัวแก้ไข MolDraw](https://www.moldraw.com/th/) [โครงสร้างเป็น SMILES](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/structure-to-smiles-converter.html) [SMILES เป็น InChIKey](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/smiles-to-inchikey-converter.html) [InChIKey เป็น SMILES](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/inchikey-to-smiles-converter.html) [CID เป็น SMILES](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/cid-to-smiles-converter.html) [CAS เป็น SMILES](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/cas-number-to-smiles-converter.html) [ชื่อเป็นโครงสร้าง](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/name-to-structure.html) [โครงสร้างเป็น NMR](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/structure-to-nmr.html) [เครื่องมือทำนายแมสสเปกตรัม](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/mass-spectrum-predictor.html) [เครื่องคำนวณ Lipinski](https://www.moldraw.com/th/tools/free-chem-tools/lipinski-rule-calculator.html) [โปรแกรมดูโปรตีน](https://www.moldraw.com/th/tools/protein-viewer/) [หน้าโมเลกุลแอสไพริน](https://www.moldraw.com/th/blog/molecules/aspirin.html) [คู่มือเครื่องมือเคมีฟรี](https://www.moldraw.com/th/blog/free-chemistry-tools-and-calculators.html)

**Rafeeque Mavoor** หัวหน้าฝ่ายผลิตภัณฑ์และการพัฒนาของ MolDraw ตัวเลขตรวจสอบกับเว็บไซต์ทางการและ API จริงเมื่อตุลาคม 2026 ดู[แนวทางบรรณาธิการ](https://www.moldraw.com/th/pages/editorial-guidelines.html)ของเรา

อัปเดตล่าสุด: 14 ตุลาคม 2026

## เครื่องมือและคู่มือที่เกี่ยวข้อง

[**โปรแกรมดูสเปกตรัม NMR**เปิดไฟล์ NMR ของ 1H และ 13C](https://www.moldraw.com/th/tools/nmr-viewer/)[**โปรแกรมดูแมสสเปกตรัม**ไอโซโทป แอดดักต์ และการสูญเสียชิ้นส่วน](https://www.moldraw.com/th/tools/mass-spec-viewer/)[**โปรแกรมดูสเปกตรัม IR**หาพีกและหมู่ฟังก์ชัน](https://www.moldraw.com/th/tools/ir-viewer/)[**หน้าโมเลกุล**โครงสร้างและสมบัติ](https://www.moldraw.com/th/blog/molecules/)[**เครื่องมือเคมีทั้งหมด**ตัวแปลง เครื่องคำนวณ โปรแกรมดู](https://www.moldraw.com/th/tools/)[**เครื่องมือและเครื่องคำนวณเคมีฟรี**เลือกเครื่องมือที่ใช่ได้อย่างรวดเร็ว](https://www.moldraw.com/th/blog/free-chemistry-tools-and-calculators.html)[**ตัวแก้ไข MolDraw**วาดโครงสร้างในเบราว์เซอร์ของคุณ](https://www.moldraw.com/th/)