---
title: "Конвертер SMILES в PDBQT | MolDraw"
url: https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/smiles-to-pdbqt-converter.html
description: "Конвертер SMILES в PDBQT от MolDraw. Преобразуйте строку SMILES в формат PDBQT для молекулярного докинга и задач в стиле AutoDock."
lang: ru
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-26
---
# Конвертер SMILES в PDBQT

**Кратко:** преобразуйте строку SMILES в формат PDBQT для молекулярного докинга и задач в стиле AutoDock. Инструмент бесплатный, работает в браузере и не требует загрузки.

Преобразуйте SMILES в PDBQT в два шага: сначала по SMILES строится 3D-структура PDB, затем она переводится в текст PDBQT, готовый к докингу.

Готово.

## Входной и выходной форматы

|  | Вход: SMILES | Выход: PDBQT |
| --- | --- | --- |
| Полное название | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | PDBQT (формат AutoDock) |
| Что содержит | Атомы, связи, циклы, заряды и стереохимию в одной строке текста. Без координат. | Координаты PDB плюс частичные заряды (Q) и типы атомов AutoDock (T), с данными о торсионах для лигандов. |
| Файл или форма | .smi или обычный текст | .pdbqt |

## Как это работает

- Шаг 1: инструмент запрашивает 3D-координаты PDB у открытого сервиса преобразования SMILES.
- Шаг 2: строки атомов PDB переписываются в записи PDBQT со столбцами типа атома и заряда.
- Используйте этот быстрый конвертер для черновиков; при необходимости уточните протонирование и торсионные параметры в программе докинга.

## Описание форматов файлов

**SMILES** — компактная строка связности. Она удобна для быстрого описания лиганда, но не содержит типов атомов для докинга, зарядов, торсионов и 3D-координат.

**PDBQT** — формат докинга в стиле AutoDock. Он хранит координаты как в PDB плюс поля частичного заряда и типа атома AutoDock, а файлы лигандов могут содержать записи дерева торсионов, например ROOT, BRANCH, ENDBRANCH и TORSDOF.

Этот конвертер создаёт черновой PDBQT прямо в браузере. Для рабочего докинга в AutoDock Vina проверьте атомы водорода, протонирование, модель зарядов, типизацию атомов и вращающиеся связи.

## Другие химические инструменты

[Онлайн-конвертер PDB в PDBQT](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/pdb-to-pdbqt-converter.html)[Конвертер SMILES в 3D-структуру](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/smiles-to-3d-structure-converter.html)[Конвертер SMILES в InChI](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/smiles-to-inchi-converter.html)[Конвертер SMILES в InChIKey](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/smiles-to-inchikey-converter.html)[Руководство по нотации SMILES](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/smiles-notation-guide.html)[Конвертер SMILES в структуру онлайн](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/smiles-to-structure.html)

Последнее обновление: 11 октября 2026 г.