---
title: "В какой форме молекула существует при pH 7,4: плагин pKa и микроформ | Блог MolDraw"
url: https://www.moldraw.com/ru/blog/pka-plugin-protonation-states-microspecies.html
description: "Оценивайте значения pKa, основную заряженную форму и долю каждой микроформы при любом pH. Практическое руководство по бесплатному плагину pKa & Microspecies в MolDraw."
lang: ru
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-26
---
# Определяйте состояния протонирования при любом pH с плагином pKa и микроформ

Опубликовано: 15 октября 2026 г. · Автор: Scidart Academy · Время чтения: ~5 мин

![Кривые распределения форм глицина от pH 0 до 14: катион, цвиттер-ион и анион, пунктирная линия при pH 7,4, где преобладает цвиттер-ион](https://www.moldraw.com/blog/thumbs/pka-plugin.webp)

При pH 7,4 глицин существует в основном в виде цвиттер-иона, как показывают кривые распределения.

**Коротко:** установите **pKa & Microspecies** в Settings › Plugins, нарисуйте молекулу и откройте вкладку **pKa**. Задайте pH ползунком или предустановкой, например **Blood 7.4**. Вы увидите оценку pKa для каждой кислотной или основной группы, основную заряженную форму, суммарный заряд, изоэлектрическую точку и диаграмму всех микроформ от pH 0 до 14. Всё работает в браузере.

## Почему важно состояние протонирования

Большинство молекул лекарств содержат кислотные или основные группы. Карбоновая кислота может потерять протон и стать карбоксилатом. Амин может присоединить протон и стать ионом аммония. Какая форма у вас, зависит от pH раствора и от pKa каждой группы.

pKa — это pH, при котором группа наполовину протонирована и наполовину депротонирована. Каждая единица pH в сторону от pKa меняет соотношение двух форм в десять раз. Это соотношение Хендерсона–Хассельбаха, знакомое студентам по общей химии.

Молекула с несколькими ионизуемыми группами может одновременно находиться в нескольких состояниях протонирования. Каждое из них — *микроформа*. Доля каждой меняется с pH. Форма, преобладающая при pH крови (около 7,4), влияет на растворимость, на то, насколько легко молекула проходит через мембраны, и на связывание с белком. Обычно именно эта форма нужна для докинга или для рисунка. Плагин даёт быструю оценку всего этого прямо во время рисования.

## Что показывает плагин

![Плагин pKa & Microspecies в MolDraw: цетиризин при pH 7,4 с диаграммой распределения микроформ, ползунком pH и предустановками, сводными значениями и таблицей Sites](https://www.moldraw.com/docs/img/plugin-pka-annotated-screenshot.webp)

Цетиризин при pH 7,4. Диаграмма охватывает pH от 0 до 14, а в таблице Sites можно ввести измеренный pKa.

| Вид структуры | **pKa sites** подписывает каждую кислотную или основную группу её оценкой. **Major at pH** рисует основную заряженную форму. |
| --- | --- |
| Диаграмма | Доля каждой микроформы в процентах от pH 0 до 14. Щёлкните диаграмму, чтобы перейти к этому pH. |
| Управление pH | Ползунок, поле для числа и предустановки: Stomach 1.5 (желудок), Skin 5.5 (кожа), Blood 7.4 (кровь) и pH 9. |
| Описание | Доля основной формы, суммарный заряд при выбранном pH, изоэлектрическая точка и макроскопические значения pKa. |
| Вкладки | **Microspecies** перечисляет каждую форму с зарядом и долей. **Sites** перечисляет каждую группу с оценкой и полем для вашего значения. **About** описывает метод. |

## Как установить плагин pKa

1. Откройте [редактор MolDraw](https://www.moldraw.com/ru/) и войдите в систему. Достаточно бесплатной учётной записи.
2. Нажмите **Settings** (шестерёнка), затем **Plugins**.
3. Нажмите **Install** рядом с pKa & Microspecies. На правой панели появится вкладка **pKa**.

Можно также щёлкнуть молекулу на холсте правой кнопкой и выбрать **pKa & microspecies**.

## Как найти основную форму при заданном pH

1. Нарисуйте молекулу. Если на холсте несколько молекул, выделите нужную.
2. Откройте вкладку **pKa**. Если отмечено **Live**, плагин повторяет анализ при каждом изменении рисунка. Иначе нажмите **Analyse drawing**.
3. Задайте pH ползунком, введите значение или нажмите предустановку, например **Blood 7.4**.
4. Прочитайте сводку: основная форма, её доля и суммарный заряд.
5. Переключите вид структуры на **Major at pH**, чтобы увидеть, где находятся заряды.
6. Откройте **Microspecies**, чтобы сравнить другие формы. Наведите курсор на форму, чтобы выделить её кривую на диаграмме.
7. Нажмите **Insert major species**, чтобы добавить заряженную форму на холст, или **Replace drawing**, чтобы заменить ею свою структуру.

## Как использовать плагин на занятиях и в лаборатории

- **Изучение кислот и оснований:** нарисуйте глицин. Учебные значения — около 2,3 для карбоксильной группы и 9,6 для аминогруппы, поэтому при pH 7,4 должен преобладать цвиттер-ион. Сравните оценки плагина с этими значениями и двигайте ползунок, чтобы показать, как преобладание переходит от одной формы к другой.
- **Всасывание лекарств:** нажмите Stomach 1.5, а затем Blood 7.4, чтобы показать, как слабая кислота или основание меняет заряд по пути через организм.
- **Подготовка к докингу и моделированию:** вставьте основную форму при pH 7,4 и экспортируйте её, а не нейтральный рисунок. Чтобы увидеть, где сосредоточен её заряд, [раскрасьте вставленную форму по электростатическому потенциалу](https://www.moldraw.com/ru/blog/mep-plugin-electrostatic-potential-map.html).
- **Быстрые расчёты:** для задач на буферы и соотношения используйте плагин вместе с [калькулятором pKa](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/pka-calculator.html) и [калькулятором pH](https://www.moldraw.com/ru/tools/free-chem-tools/ph-calculator.html).

## Советы и ограничения

- Щёлкните метку pKa на структуре, чтобы перейти к этой группе в таблице Sites.
- Если у вас есть измеренный pKa, введите его в поле **Your pKa**. Оставьте поле пустым, чтобы использовать оценку. Измеренные значения всегда лучше оценок.
- Соль, нарисованная с противоионом, считается двумя молекулами. Выделите часть, относящуюся к лекарству, или нарисуйте нейтральное исходное соединение.
- Если у молекулы нет ионизуемых групп в диапазоне pH 0–14, плагин сообщит, что она остаётся нейтральной.

Все значения — оценки. Плагин находит каждую кислотную или основную группу, берёт измеренное значение для группы этого типа и корректирует его с учётом соседних заместителей по уравнениям Гаммета и Тафта. На отложенном тестовом наборе примерно из 2000 молекул средняя ошибка составляет 0,92 единицы pKa, и 71 % значений укладываются в 1 единицу. Для распространённых лекарств средняя ошибка около 0,45. Для некоторых циклических систем, таутомеров, амидинов, енолов и C-H-кислот отклонение может достигать 2 единиц и более. Используйте результаты для обучения, быстрых проверок и планирования, а не вместо измерений.

## Вопросы и ответы

### Что такое микроформа?

Микроформа — одно конкретное состояние протонирования молекулы, в котором каждая кислотная или основная группа либо несёт свой протон, либо нет. Молекула с несколькими ионизуемыми группами может одновременно существовать в нескольких микроформах, и их доли меняются с pH.

### Насколько точны значения pKa?

Это оценки. На отложенном тестовом наборе средняя ошибка составляет 0,92 единицы pKa, 71 % значений укладываются в 1 единицу, а для распространённых лекарств ошибка около 0,45 единицы. Для необычных циклических систем и таутомерных гетероциклов отклонение может достигать 2 единиц и более.

### Отправляет ли плагин мою молекулу на сервер?

Нет. Расчёт выполняется в браузере без сервера и без ИИ-модели.

### Можно ли использовать свои измеренные значения pKa?

Да. Откройте вкладку Sites и введите своё значение в поле Your pKa для нужной группы. Диаграмма, сводка и основная форма сразу обновятся.

## Другие плагины MolDraw

[Документация плагина pKa](https://www.moldraw.com/docs/plugins/pka-plugin-microspecies-protonation-states-at-any-ph/) [Карта электростатического потенциала](https://www.moldraw.com/ru/blog/mep-plugin-electrostatic-potential-map.html) [Поиск биоактивности в ChEMBL](https://www.moldraw.com/ru/blog/chembl-plugin-bioactivity-lookup.html) [Просмотр белков](https://www.moldraw.com/ru/blog/protein-viewer-plugin-pdb-3d.html) [Все плагины](https://www.moldraw.com/docs/plugins/moldraw-plugins-overview-and-how-to-install/)

Последнее обновление: 15 октября 2026 г.