---
title: "SMILES naar PDBQT omzetten | MolDraw"
url: https://www.moldraw.com/nl/tools/free-chem-tools/smiles-to-pdbqt-converter.html
description: "Converter van SMILES naar PDBQT van MolDraw. Zet een SMILES-string om naar het PDBQT-formaat voor moleculaire docking en werken met AutoDock."
lang: nl
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-26
---
# SMILES naar PDBQT omzetten

**Kort gezegd:** Zet een SMILES-string om naar het PDBQT-formaat voor moleculaire docking en werken met AutoDock. Gratis, werkt in je webbrowser en vereist geen download.

Zet SMILES in twee stappen om naar PDBQT: genereer een 3D-PDB uit de SMILES en zet de structuur daarna om in PDBQT-tekst die klaar is voor docking.

Klaar.

## Invoer- en uitvoerformaten

|  | Invoer: SMILES | Uitvoer: PDBQT |
| --- | --- | --- |
| Volledige naam | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | PDBQT (AutoDock-formaat) |
| Wat het bevat | Atomen, bindingen, ringen, ladingen en stereo als één regel tekst. Geen coördinaten. | PDB-coördinaten plus partiële ladingen (Q) en AutoDock-atoomtypen (T), met torsiegegevens voor liganden. |
| Bestand of vorm | .smi of platte tekst | .pdbqt |

## Technische werkwijze

- Stap 1: de tool vraagt 3D-PDB-coördinaten op bij een openbaar eindpunt voor SMILES-conversie.
- Stap 2: de atoomregels van de PDB worden herschreven tot PDBQT-records met kolommen voor atoomtype en lading.
- Gebruik deze snelle converter voor concepten; verfijn protonering en torsie-instellingen zo nodig in de dockingsoftware.

## Bestandsformaat uitgelegd

**SMILES** is een compacte string met de verbindingen tussen atomen. Goed om snel een ligand te beschrijven, maar zonder dockingatoomtypen, ladingen, torsies of 3D-coördinaten.

**PDBQT** is een dockingformaat in AutoDock-stijl. Het slaat PDB-achtige coördinaten op plus velden voor partiële lading en AutoDock-atoomtype, en ligandbestanden kunnen torsieboomrecords bevatten zoals ROOT, BRANCH, ENDBRANCH en TORSDOF.

Deze converter maakt in de browser een concept-PDBQT. Controleer voor echte docking met AutoDock Vina de waterstofatomen, protonering, het ladingsmodel, de atoomtypen en de draaibare bindingen.

## Verwante scheikundetools

[PDB naar PDBQT online omzetten](https://www.moldraw.com/nl/tools/free-chem-tools/pdb-to-pdbqt-converter.html)[SMILES naar 3D-structuur omzetten](https://www.moldraw.com/nl/tools/free-chem-tools/smiles-to-3d-structure-converter.html)[SMILES naar InChI omzetten](https://www.moldraw.com/nl/tools/free-chem-tools/smiles-to-inchi-converter.html)[SMILES naar InChIKey omzetten](https://www.moldraw.com/nl/tools/free-chem-tools/smiles-to-inchikey-converter.html)[SMILES-notatiegids](https://www.moldraw.com/nl/tools/free-chem-tools/smiles-notation-guide.html)[SMILES naar structuur online omzetten](https://www.moldraw.com/nl/tools/free-chem-tools/smiles-to-structure.html)

Laatst bijgewerkt: 11 oktober 2026