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title: "Crystal View：CIFファイルを開いて単位格子を3D表示 | MolDrawブログ"
url: https://www.moldraw.com/ja/blog/crystal-view-plugin-cif-unit-cell-3d.html
description: "CIF、POSCAR、PDB、extended XYZファイルをブラウザで開き、単位格子を3Dで確認。セルの繰り返し、[uvw]方向からの表示、配位多面体、PNG書き出しが無料のCrystal Viewプラグインで行えます。"
lang: ja
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-31
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# Crystal View：CIFファイルを開いて単位格子を3D表示

公開：2026年10月30日 · 著者：Scidart Academy · 読了時間：約5分

![MolDraw Crystal Viewプラグインの2つの単位格子：Na格子とCl格子が互いに入り込んだ岩塩（NaCl）と、中心にTiO6八面体をもつ立方晶ペロブスカイトSrTiO3](https://www.moldraw.com/blog/thumbs/crystal-view-plugin.webp)

Crystal Viewプラグインで表示した岩塩と立方晶ペロブスカイトの単位格子。

**要点：**MolDrawで3Dビューアを開き、**+**を押して**Crystal View**をインストールします。Crystalタブで**Open**をクリックし、CIF、POSCAR、PDB、extended XYZファイル、または内蔵の例を選びます。格子定数、体積、Z、密度とともに単位格子が3Dで表示され、セルの繰り返し、任意の[uvw]方向からの表示、配位多面体の表示、PNGの書き出しができます。

## なぜ結晶を3Dで見るのか？

NaClやSrTiO3のような化学式からは、原子がどう詰まっているかはわかりません。配位数、最密充填層、多面体の形は、セルを回転させていろいろな方向から見て初めて理解できます。教科書の図は一つの角度に固定されていますが、動かせるモデルなら構造をいちばんよく説明する視点を探せます。

Crystal Viewはブラウザ上で、描画のすぐ隣で動作します。ファイルは自分のコンピューター上で読み込まれ、どこにもアップロードされません。

## プラグインで表示できるもの

![紫のNa原子と緑のCl原子、色分けされたa・b・c軸、a = 5.640 Å、空間群Fm-3m、Z = 4、密度2.163 g/cm³を示すカードとともに岩塩の単位格子を表示したCrystal View](https://www.moldraw.com/blog/images/crystal-view/crystal-view-rock-salt.webp)

岩塩（NaCl）。カードにはa、b、c、α、β、γ、空間群、セル体積、Z、計算密度が表示されます。

| 単位格子 | 色分けされたa・b・c軸をもつセルの稜と、隣のセルと共有されるものも含めたすべての格子点上の原子。 |
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| 格子定数 | 長さa、b、c、角度α、β、γ、空間群、体積、Z、密度。 |
| 繰り返し（Repeat） | a × b × c個のセルのブロックを作り、構造がどう続いていくかを確認できます。 |
| 方向から見る（Look along） | 軸方向や任意の方向[u v w]から見下ろすように視点を回転できます。 |
| 表示（Display） | 球棒モデルまたは空間充填モデル、配位多面体、イオン間の接触、原子ラベル。 |
| 投影 | 透視投影と平行（正射）投影を切り替えられます。 |
| 出力 | PNGを書き出すか、現在の表示を編集可能な図としてキャンバスに追加できます。 |

## Crystal Viewのインストール方法

1. [MolDrawエディター](https://www.moldraw.com/ja/)を開いてサインインします。無料アカウントで十分です。
2. 3Dビューアを開き、タブの横にある**+**を押します（または**Settings** › **Plugins**を開きます）。
3. Crystal Viewの横の**Install**をクリックします。**Crystal**タブが表示されます。

## CIFファイルの開き方

![Crystal ViewのOpenメニュー。CIF、POSCAR、PDB、extended XYZ用のOpen a fileと、塩化ナトリウム、塩化セシウム、フッ化カルシウム、ダイヤモンド、グラファイト、チタン酸ストロンチウム、ルチル、酸化亜鉛、銅の例](https://www.moldraw.com/blog/images/crystal-view/crystal-view-examples-menu.webp)

Openメニュー：自分のファイル、または9つの代表的な構造から選べます。

1. Crystalタブで**Open**（左側ツールバー上部のフォルダアイコン）をクリックします。
2. **Open a file…**を選び、`.cif`、POSCAR、PDB（CRYST1レコード付き）、extended XYZファイルを選択します。
3. ドラッグで回転、スクロールでズームします。**Repeat**でセルを増やし、**Look along**で軸方向から見られます。

手元にファイルがなくても大丈夫。例には多くの授業で扱う構造が揃っています：岩塩、塩化セシウム、蛍石、ダイヤモンド、グラファイト、立方晶ペロブスカイト、ルチル、ウルツ鉱（酸化亜鉛）、面心立方の銅。

## 配位を見る：ペロブスカイトの例

![Crystal Viewで表示した立方晶ペロブスカイトSrTiO3：セル中心のチタン原子が6個の酸素原子と結合し、ストロンチウム原子がセルの頂点にある。カードにはa = 3.905 Å、空間群Pm-3m、密度5.117 g/cm³](https://www.moldraw.com/blog/images/crystal-view/crystal-view-perovskite.webp)

チタン酸ストロンチウム（SrTiO3）：チタンは6個の酸素からなる八面体の中に、ストロンチウムは八面体の間の大きな空隙にあります。

**Display**を開いて**Coordination polyhedra**にチェックを入れると、TiO6八面体が塗りつぶされます。セルをいくつか繰り返すと、八面体が頂点を共有していることがわかります。これがペロブスカイト類の重要な特徴です。ルチルでも同じことを試してみましょう。ルチルではTiO6八面体がc軸に沿った鎖状に稜を共有しているので、比べてみてください。

## 2Dキャンバス上の結晶

![MolDrawキャンバスの結晶パネル：セル情報、Repeat a × b × cの操作、Look alongボタン、視点回転の矢印、ラベルとイオン間接触のオプション、Open in Crystal Viewボタン](https://www.moldraw.com/blog/images/crystal-view/crystal-2d-panel.webp)

キャンバスで開いた結晶には専用パネルがあり、Open in Crystal Viewで3D表示できます。

CIFファイルを描画キャンバスに直接開くこともできます。MolDrawは結晶を通常の編集可能な図として描き、セル、繰り返し、表示方向、ラベル、イオン間接触を設定するパネルを表示します。等価なサイトの元素を入れ替えることもでき、たとえばワークシート用にNaClをKClに変えられます。Crystal Viewはキャンバスの図にリアルタイムで追従するので、変更はすぐに3Dに反映されます。

## 授業や実験での活用例

- **固体化学の授業：**NaCl（6:6）とCsCl（8:8）の配位を比べたり、セル内の原子を数えてカードのZ値を確かめたりできます。
- **最密充填：**銅を[1 1 1]方向から見ると、最密充填層が見えます。
- **炭素の同素体：**ダイヤモンドとグラファイトを並べて、sp3結合とsp2結合について考えられます。
- **ファイルの確認：**論文やデータベースのCIFを開き、ほかで使う前にセル、密度、結合関係を確認できます。
- **図の作成：**PNGを書き出すか、表示をキャンバスに追加して、ほかのスキームと一緒にラベルを付けられます。

配位子場についても学んでいますか？[結晶場理論のガイド](https://www.moldraw.com/ja/blog/crystal-field-theory-splitting-guide.html)では八面体型と四面体型の分裂を解説しています。これらはCrystal Viewで多面体として確認できます。

## よくある質問

### CIFファイルをオンラインで開くには？

MolDrawに無料のCrystal Viewプラグインをインストールし、3Dビューアでそのタブを開いてOpenをクリックし、.cifファイルを選びます。単位格子がブラウザ上に3Dで表示され、サーバーには何もアップロードされません。

### Crystal Viewが読み込める結晶ファイル形式は？

CIF、VASP POSCAR、CRYST1レコードを含むPDBファイル、格子情報を含むextended XYZファイルです。

### Crystal Viewプラグインは無料ですか？

はい。プラグインのインストールに必要なのは無料のMolDrawアカウントだけです。

### 2Dキャンバスに結晶構造を描けますか？

はい。キャンバス上でCIFファイルを開くと、繰り返し、表示方向、ラベル用の専用パネルを備えた編集可能な結晶の図になります。Crystal Viewはその図にリアルタイムで追従して3D表示します。

## その他のMolDrawプラグイン

[タンパク質ビューア](https://www.moldraw.com/ja/blog/protein-viewer-plugin-pdb-3d.html) [ChEMBL検索](https://www.moldraw.com/ja/blog/chembl-plugin-bioactivity-lookup.html) [分子の比較](https://www.moldraw.com/ja/blog/compare-molecules-plugin-tanimoto-similarity.html) [結晶場理論](https://www.moldraw.com/ja/blog/crystal-field-theory-splitting-guide.html) [すべてのプラグイン](https://www.moldraw.com/docs/plugins/moldraw-plugins-overview-and-how-to-install/)

最終更新：2026年10月30日