--- title: "Visualizza strutture proteiche online: ID PDB, catene e sequenze | Blog MolDraw" url: https://www.moldraw.com/it/blog/protein-structure-viewer-guide.html description: "Guida pratica alla pagina gratuita Visualizzatore di proteine di MolDraw: carica una voce PDB per ID o da file, assegna uno stile a ogni catena, evidenzia residui dalla sequenza ed esporta immagini o coordinate." lang: it publisher: Scidart Academy generated: 2026-10-26 --- # Come esplorare una struttura proteica con il visualizzatore di proteine gratuito di MolDraw Pubblicato: 15 ott 2026 · Autore: Scidart Academy · Tempo di lettura: ~5 min ![Cartoon di una proteina con un nastro di alfa-elica e una freccia di filamento beta, ID PDB 1CRN, sopra una striscia di sequenza con residui evidenziati](https://www.moldraw.com/blog/thumbs/protein-viewer-guide.webp) Carica una voce PDB come 1CRN ed esplorane catene e residui. **Risposta breve:** apri il [Visualizzatore di proteine](https://www.moldraw.com/it/tools/protein-viewer/), scrivi un ID PDB di quattro caratteri e premi **Carica ID PDB**, oppure premi **Carica file PDB**. Scegli uno **Stile predefinito delle catene**, poi assegna uno stile a ogni catena nell'elenco **Catene**. Trascina sulla **Sequenza di amminoacidi** e fai clic destro per cambiare stile a quel tratto o nasconderlo. Salva la vista in PNG o JPG, oppure le coordinate in PDB, XYZ, OBJ o X3D. ## Prova qui il visualizzatore di proteine Il visualizzatore interattivo qui sotto è lo stesso strumento della pagina completa. All'apertura carica la crambina (1CRN). Fai clic per caricare il visualizzatore interattivo in questa pagina, oppure [apri il visualizzatore di proteine completo](https://www.moldraw.com/it/tools/protein-viewer/). Il caricamento per ID PDB recupera la struttura dalla RCSB Protein Data Bank. ## Perché usare un visualizzatore di proteine nel browser? La funzione di una proteina dipende dalla sua forma 3D. I programmi desktop come PyMOL o ChimeraX sono potenti, ma vanno installati e bisogna imparare i loro comandi. Per un'occhiata veloce, una dimostrazione in classe o una figura semplice, spesso basta una pagina web. Questa pagina è lo strumento web autonomo. MolDraw ha anche un [plugin Protein viewer](https://www.moldraw.com/it/blog/protein-viewer-plugin-pdb-3d.html) dentro l'editor. Il plugin sta accanto al tuo disegno e aggiunge più schemi di colori, superfici molecolari e formati di esportazione aggiuntivi. La pagina autonoma è più leggera e si apre senza l'editor. ## Le strutture proteiche in breve La **Protein Data Bank (PDB)** è l'archivio pubblico delle strutture determinate sperimentalmente di proteine, acidi nucleici e loro complessi. La maggior parte proviene da cristallografia a raggi X, NMR o microscopia crioelettronica. Ogni **voce** ha un ID di quattro caratteri, come 1CRN per la crambina o 4HHB per la deossiemoglobina umana. Una voce elenca le coordinate degli atomi. Gli atomi appartengono a **residui**, gli amminoacidi, numerati lungo ogni **catena**. Le catene hanno ID a lettera (A, B, C e così via). L'emoglobina, per esempio, ha due catene α e due β. Ligandi, ioni e acqua sono memorizzati come eteroatomi separati. Le parti di una catena non risolte nell'esperimento mancano semplicemente dal modello. Ogni stile di visualizzazione risponde a una domanda diversa. Un **cartoon** traccia lo scheletro e mostra eliche e filamenti β, così vedi il ripiegamento complessivo. I **bastoncini** mostrano i legami tra atomi, che servono per catene laterali e contatti di legame. Le **sfere** riempiono lo spazio e mostrano l'impaccamento. Una **superficie** mostra la forma esterna e le tasche; questa pagina non disegna superfici, ma il plugin nell'editor sì. ## Formati di input e di esportazione | Caricamento | Un ID PDB, scaricato da RCSB in formato PDB, oppure un file .pdb dal tuo computer. | | --- | --- | | PNG e JPG | Un'immagine della vista corrente. Il JPG ha uno sfondo bianco. | | PDB | Il file caricato così come è stato letto. | | XYZ | L'elemento e le coordinate di ogni atomo, eteroatomi compresi. | | OBJ e X3D | Semplici modelli a punti delle posizioni degli atomi. Non riproducono il cartoon né gli stili sullo schermo. | ## Come esplorare una struttura passo per passo 1. Apri il visualizzatore. Per prima si carica la crambina (1CRN), così puoi provare subito i controlli. 2. Scrivi un ID in **ID PDB**, per esempio 4HHB, e premi **Carica ID PDB**. La riga di stato elenca le catene trovate. Per aprire un tuo file, premi **Carica file PDB**. 3. Scegli **Cartoon**, **Bastoncini**, **Sfere** o **Linee** in **Stile predefinito delle catene**. Questo imposta tutte le catene insieme. 4. Trascina nella vista 3D per ruotare la molecola e scorri per ingrandire. 5. In **Catene**, ogni catena mostra il numero di residui, un menu di stile, un selettore di colore e una casella **Nascondi**. Premi **Focus** per evidenziare quella catena con bastoncini arancioni. 6. In **Sequenza di amminoacidi**, trascina sui residui di una catena. Fai clic destro sulla selezione per aprire **Stile del segmento selezionato**, imposta **Stile**, **Colore** o **Nascondi segmento** e premi **Applica**. 7. Usa i pulsanti di download per salvare il risultato. **Cancella** svuota il visualizzatore. ## Che cosa fa il visualizzatore - **Stili per catena:** dai a ogni catena il suo stile e colore, oppure nascondila, per vedere come si impaccano le subunità. - **Vista della sequenza:** codici a una lettera per ogni catena, collegati al modello 3D. - **Stili per segmento:** cambia stile, colore o nascondi un tratto di residui selezionato. Ogni segmento applicato mantiene il proprio stile, così puoi segnare più siti. - **Download:** PNG, JPG, PDB, XYZ, OBJ e X3D. ## Come usarlo in classe e in laboratorio - **Insegnare la struttura quaternaria:** carica 4HHB, dai a ogni catena un colore diverso e nascondine una o due per mostrare come si incastrano le subunità. - **Evidenziare un sito:** lascia la proteina come cartoon e mostra un'ansa di legame o un sito di mutazione come bastoncini colorati. - **Figure rapide:** imposta una vista e scarica un PNG per una slide o una relazione. - **Passi successivi:** trasforma un ligando legato in SMILES con [da PDB a SMILES](https://www.moldraw.com/it/tools/free-chem-tools/pdb-to-smiles-converter.html), calcola la massa di una catena con il [calcolatore del peso molecolare delle proteine](https://www.moldraw.com/it/tools/free-chem-tools/protein-molecular-weight-calculator.html) o prepara un recettore con [da PDB a PDBQT](https://www.moldraw.com/it/tools/free-chem-tools/pdb-to-pdbqt-converter.html). ## Consigli e limiti - Cartoon disegna solo il tracciato dello scheletro delle catene, non ligandi, ioni o acqua. Per vederli, passa la catena a Bastoncini, Sfere o Linee. - Per strutture grandi, Linee è lo stile più leggero. - La sequenza proviene dai residui del modello. I residui non risolti non compaiono, e quelli che il visualizzatore non riconosce, come i nucleotidi, appaiono come X. - Una selezione resta all'interno di una sola catena. La selezione della sequenza usa trascinamento e clic destro, quindi con un mouse è più facile. - Il caricamento per ID richiede una connessione a internet. Vuoi superfici, più schemi di colori o l'esportazione GLB? Usa il [plugin Protein viewer](https://www.moldraw.com/it/blog/protein-viewer-plugin-pdb-3d.html) nell'editor MolDraw. ## Domande e risposte ### In che cosa questa pagina differisce dal plugin Protein dell'editor MolDraw? Questa pagina è un visualizzatore leggero e autonomo che si apre senza l'editor. Il plugin Protein sta accanto al tuo disegno nell'editor e aggiunge più schemi di colori, superfici molecolari e formati di esportazione aggiuntivi come GLB e SDF. ### Da dove provengono le strutture? Quando premi Carica ID PDB, la pagina scarica la voce dalla RCSB Protein Data Bank, quindi serve una connessione a internet. Con Carica file PDB, la pagina legge il file nel browser. ### Perché non vedo il ligando o le molecole d'acqua? Cartoon disegna solo il tracciato dello scheletro delle catene. Imposta la catena su Bastoncini, Sfere o Linee nell'elenco Catene per vedere ligandi, ioni e acqua come atomi. ### Posso aprire file mmCIF? No. La pagina legge solo il formato PDB. La maggior parte delle voci si può scaricare come file .pdb da RCSB, ma alcune strutture molto grandi sono disponibili solo in mmCIF. Quelle non si caricano qui. ## Altri visualizzatori e guide di MolDraw [Visualizzatore di proteine](https://www.moldraw.com/it/tools/protein-viewer/) [Plugin visualizzatore di proteine](https://www.moldraw.com/it/blog/protein-viewer-plugin-pdb-3d.html) [Visualizzatore NMR](https://www.moldraw.com/it/tools/nmr-viewer/) [Visualizzatore IR](https://www.moldraw.com/it/tools/ir-viewer/) [Visualizzatore di spettri di massa](https://www.moldraw.com/it/tools/mass-spec-viewer/) [Visualizzatore UV-Vis](https://www.moldraw.com/it/tools/uv-vis-viewer/) [Visualizzatore Raman](https://www.moldraw.com/it/tools/raman-viewer/) [Visualizzatore XPS](https://www.moldraw.com/it/tools/xps-viewer/) [Visualizzatore di voltammetria ciclica](https://www.moldraw.com/it/tools/cv-viewer/) [Visualizzatore TGA e DSC](https://www.moldraw.com/it/tools/tga-dsc-viewer/) [Guida all'NMR](https://www.moldraw.com/it/blog/nmr-spectrum-viewer-guide.html) [Guida all'IR](https://www.moldraw.com/it/blog/ir-spectrum-viewer-guide.html) [Guida agli spettri di massa](https://www.moldraw.com/it/blog/mass-spectrum-viewer-guide.html) [Guida all'UV-Vis](https://www.moldraw.com/it/blog/uv-vis-spectrum-viewer-guide.html) [Guida al Raman](https://www.moldraw.com/it/blog/raman-spectrum-viewer-guide.html) [Guida al fitting dei picchi XPS](https://www.moldraw.com/it/blog/xps-viewer-peak-fitting-guide.html) [Guida alla voltammetria ciclica](https://www.moldraw.com/it/blog/cyclic-voltammetry-viewer-guide.html) [Guida a TGA e DSC](https://www.moldraw.com/it/blog/tga-dsc-viewer-guide.html) Ultimo aggiornamento: 15 ottobre 2026