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title: "Scopri in che forma esiste una molecola a pH 7,4: il plugin pKa e microspecie | Blog MolDraw"
url: https://www.moldraw.com/it/blog/pka-plugin-protonation-states-microspecies.html
description: "Stima i valori di pKa, la forma carica principale e la quota di ogni microspecie a qualsiasi pH. Guida pratica al plugin gratuito pKa & Microspecies di MolDraw."
lang: it
publisher: Scidart Academy
generated: 2026-10-26
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# Trovare gli stati di protonazione a qualsiasi pH con il plugin pKa e microspecie

Pubblicato: 15 ott 2026 · Autore: Scidart Academy · Tempo di lettura: ~5 min

![Curve di distribuzione delle specie della glicina da pH 0 a 14: catione, zwitterione e anione, con una linea tratteggiata a pH 7,4 dove prevale lo zwitterione](https://www.moldraw.com/blog/thumbs/pka-plugin.webp)

A pH 7,4 la glicina esiste soprattutto come zwitterione, come mostrano le curve delle specie.

**Risposta breve:** installa **pKa & Microspecies** da Settings › Plugins, disegna una molecola e apri la scheda **pKa**. Imposta il pH con il cursore o con una preimpostazione come **Blood 7.4**. Vedi una stima del pKa di ogni gruppo acido o basico, la forma carica principale, la carica netta, il punto isoelettrico e un grafico di ogni microspecie da pH 0 a 14. Tutto avviene nel browser.

## Perché conta lo stato di protonazione

La maggior parte delle molecole di farmaci porta gruppi acidi o basici. Un acido carbossilico può perdere un protone e diventare un carbossilato. Un'ammina può acquistare un protone e diventare uno ione ammonio. La forma presente dipende dal pH della soluzione e dal pKa di ciascun gruppo.

Il pKa è il pH al quale un gruppo è per metà protonato e per metà deprotonato. Ogni unità di pH di distanza dal pKa sposta il rapporto tra le due forme di un fattore dieci. È la relazione di Henderson–Hasselbalch che gli studenti incontrano in chimica generale.

Una molecola con più gruppi ionizzabili può esistere contemporaneamente in più stati di protonazione. Ciascuno di questi stati è una *microspecie*. La quota di ognuna cambia con il pH. La forma che prevale al pH del sangue (circa 7,4) influisce sulla solubilità, sulla facilità con cui la molecola attraversa le membrane e su come si lega a una proteina. È anche la forma che di solito ti serve per il docking o per una figura. Il plugin ti dà una stima rapida di tutto questo mentre disegni.

## Cosa mostra il plugin

![Plugin pKa & Microspecies di MolDraw che mostra la cetirizina a pH 7,4 con il grafico di distribuzione delle microspecie, il cursore del pH e le preimpostazioni, i valori di riepilogo e la tabella Sites](https://www.moldraw.com/docs/img/plugin-pka-annotated-screenshot.webp)

Cetirizina a pH 7,4. Il grafico copre il pH da 0 a 14 e la tabella Sites ti permette di inserire un pKa misurato.

| Vista della struttura | **pKa sites** etichetta ogni gruppo acido o basico con la sua stima. **Major at pH** disegna la forma carica principale. |
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| Grafico | La percentuale di ogni microspecie da pH 0 a 14. Fai clic sul grafico per passare a quel pH. |
| Controlli del pH | Un cursore, una casella numerica e preimpostazioni: Stomach 1.5, Skin 5.5, Blood 7.4 e pH 9. |
| Riepilogo | Quota della specie principale, carica netta al pH scelto, punto isoelettrico e valori di pKa macroscopici. |
| Schede | **Microspecies** elenca ogni forma con la sua carica e la sua percentuale. **Sites** elenca ogni gruppo con la sua stima e una casella per il tuo valore. **About** spiega il metodo. |

## Come installare il plugin pKa

1. Apri l'[editor MolDraw](https://www.moldraw.com/it/) ed effettua l'accesso. Basta un account gratuito.
2. Fai clic su **Settings** (l'ingranaggio), poi su **Plugins**.
3. Fai clic su **Install** accanto a pKa & Microspecies. Nel pannello di destra compare una scheda **pKa**.

Puoi anche fare clic destro su una molecola nell'area di disegno e scegliere **pKa & microspecies**.

## Come trovare la specie principale a un dato pH

1. Disegna la molecola. Se nell'area di disegno ci sono più molecole, seleziona quella che ti interessa.
2. Apri la scheda **pKa**. Con **Live** spuntato, il plugin rianalizza ogni volta che il disegno cambia. Altrimenti premi **Analyse drawing**.
3. Imposta il pH con il cursore, scrivi un valore o premi una preimpostazione come **Blood 7.4**.
4. Leggi il riepilogo: la specie principale, la sua quota e la carica netta.
5. Passa la vista della struttura a **Major at pH** per vedere dove si trovano le cariche.
6. Apri **Microspecies** per confrontare le altre forme. Passa il mouse su una di esse per evidenziarne la curva sul grafico.
7. Premi **Insert major species** per aggiungere la forma carica all'area di disegno, oppure **Replace drawing** per sostituirla alla tua struttura.

## Come usarlo in classe e in laboratorio

- **Insegnare acidi e basi:** disegna la glicina. I valori dei libri di testo sono circa 2,3 per l'acido carbossilico e 9,6 per l'ammina, quindi a pH 7,4 dovrebbe prevalere lo zwitterione. Confronta le stime del plugin con quei valori e sposta il cursore per mostrare come prevale ogni forma.
- **Assorbimento dei farmaci:** premi Stomach 1.5 e poi Blood 7.4 per mostrare come un acido o una base debole cambia carica nel corpo.
- **Preparazione per docking e modellistica:** inserisci la specie principale a pH 7,4 ed esporta quella forma invece del disegno neutro. Per vedere dove si trova la sua carica, [colora la forma inserita in base al potenziale elettrostatico](https://www.moldraw.com/it/blog/mep-plugin-electrostatic-potential-map.html).
- **Calcoli rapidi:** per problemi su tamponi e rapporti, abbina il plugin al [calcolatore di pKa](https://www.moldraw.com/it/tools/free-chem-tools/pka-calculator.html) e al [calcolatore di pH](https://www.moldraw.com/it/tools/free-chem-tools/ph-calculator.html).

## Consigli e limiti

- Fai clic su un'etichetta di pKa sulla struttura per passare a quel gruppo nella tabella Sites.
- Se hai un pKa misurato, scrivilo nella casella **Your pKa**. Lascia la casella vuota per mantenere la stima. I valori misurati sono sempre migliori delle stime.
- Un sale disegnato con il suo controione conta come due molecole. Seleziona la parte del farmaco, oppure disegna il composto progenitore neutro.
- Se una molecola non ha gruppi ionizzabili tra pH 0 e 14, il plugin ti dice che resta neutra.

Tutti i valori sono stime. Il plugin individua ogni gruppo acido o basico, parte da un valore misurato per quel tipo di gruppo e lo corregge per i sostituenti vicini con le equazioni di Hammett e Taft. Su un set di test indipendente di circa 2.000 molecole l'errore medio è di 0,92 unità di pKa e il 71% dei valori rientra entro 1 unità. Per i farmaci comuni l'errore medio è di circa 0,45. Alcuni sistemi ad anello, tautomeri, amidine, enoli e acidi C-H possono discostarsi di 2 unità o più. Usa i risultati per la didattica, controlli rapidi e pianificazione, non come sostituto della misura.

## Domande e risposte

### Che cos'è una microspecie?

Una microspecie è uno specifico stato di protonazione di una molecola, in cui ogni gruppo acido o basico porta o non porta il suo protone. Una molecola con più gruppi ionizzabili può esistere contemporaneamente come più microspecie, e le loro quote cambiano con il pH.

### Quanto sono accurati i valori di pKa?

Sono stime. Su un set di test indipendente l'errore medio è di 0,92 unità di pKa, con il 71% dei valori entro 1 unità, e di circa 0,45 unità per i farmaci comuni. Sistemi ad anello insoliti ed eterocicli tautomerici possono discostarsi di 2 unità o più.

### Il plugin invia la mia molecola a un server?

No. Il calcolo avviene nel browser e non usa né server né modelli di IA.

### Posso usare i miei valori di pKa misurati?

Sì. Apri la scheda Sites e scrivi il tuo valore nella casella Your pKa di quel gruppo. Il grafico, il riepilogo e la specie principale si aggiornano subito.

## Altri plugin di MolDraw

[Documentazione del plugin pKa](https://www.moldraw.com/docs/plugins/pka-plugin-microspecies-protonation-states-at-any-ph/) [Mappa del potenziale elettrostatico](https://www.moldraw.com/it/blog/mep-plugin-electrostatic-potential-map.html) [Ricerca della bioattività in ChEMBL](https://www.moldraw.com/it/blog/chembl-plugin-bioactivity-lookup.html) [Visualizzatore di proteine](https://www.moldraw.com/it/blog/protein-viewer-plugin-pdb-3d.html) [Tutti i plugin](https://www.moldraw.com/docs/plugins/moldraw-plugins-overview-and-how-to-install/)

Ultimo aggiornamento: 15 ottobre 2026